转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹与理化因子的关系

对转基因鱼试验湖7个采样点的浮游生物群落进行了PCR-DGGE指纹分析,并进而探讨了DNA指纹与理化因子的关系.结果表明:(1)PCB-DGGE指纹图谱中共含104谱带,其中原核谱带58条,真核谱带46条,其多态性位点分别为87.9%和82.6%.(2)各站点的理化因子中,Ⅰ站的TP含量最高(0.10 mg/L),TN含量在Ⅲ站最高(0.34 mg/L),且各站点波动较大,Ⅴ站的透明度最低(63.00 cm);NO3-N、NH4-N、pH、DO、COD及电导率在各站点变化不大.基于原核生物图谱的相似性聚类分析表明,浮游生物群落Ⅵ和Ⅶ、Ⅳ和Ⅴ、Ⅱ和Ⅲ相似度分别较高,Ⅰ站有别于其它各站,单独为1枝;基于真核生物图谱的聚类分析显示,Ⅰ、Ⅱ站聚为1枝,Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ依次相聚后与Ⅲ站聚为另1大枝,Ⅰ、Ⅱ站与Ⅲ站相距较近;理化因子的主成分分析结果与之基本吻合.因此,浮游生物群落DNA多态性与环境理化因子是密切相关的,这类资料的积累将为在分子水平上建立水质预测预报体系奠定基础,为评价转基因鱼生态安全性提供依据.     

转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹与理化因子的关系

对转基因鱼试验湖７个采样点的浮游生物群落进行了ＰＣＲ－ＤＧＧＥ指纹分析，并进而探讨了ＤＮＡ指纹与理化因子的关系。结果表明：（１）ＰＣＲ－ＤＧＧＥ指纹图谱中共含１０４谱带，其中原核谱带５８条，真核谱带４６条，其多态性位点分别为８７．９％和８２．６％。（２）各站点的理化因子中，Ⅰ站的ＴＰ含量最高（０．１０ｍｇ／Ｌ），ＴＮ含量在Ⅲ站最高（０．３４ｍｇ／Ｌ），且各站点波动较大，Ⅴ站的透明度最低（６３．００ｃｍ）；ＮＯ３－Ｎ、ＮＨ４－Ｎ、ｐＨ、ＤＯ、ＣＯＤ及电导率在各站点变化不大。基于原核生物图谱的相似性聚类分析表明，浮游生物群落Ⅵ和Ⅶ、Ⅳ和Ⅴ、Ⅱ和Ⅲ相似度分别较高，Ⅰ站有别于其它各站，单独为１枝；基于真核生物图谱的聚类分析显示，Ⅰ、Ⅱ站聚为１枝，Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ依次相聚后与Ⅲ站聚为另１大枝，Ⅰ、Ⅱ站与Ⅲ站相距较近；理化因子的主成分分析结果与之基本吻合。因此，浮游生物群落ＤＮＡ多态性与环境理化因子是密切相关的，这类资料的积累将为在分子水平上建立水质预测预报体系奠定基础，为评价转基因鱼生态安全性提供依据。     

武汉市湖泊微型裸腹溞种群遗传结构比较分析

分析武汉市9个湖泊中枝角类微型裸腹溞(Moina micrura)细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的多样性情况,对种群遗传多样性进行分析,了解不同地理距离对枝角类种群遗传分化的影响。形态鉴定表明,9个湖泊26个样点中共有8个湖泊17个样点检出微型裸腹溞,牛山湖设置的3个样点均未检测出微型裸腹溞。通过基因测序共得到66条微型裸腹溞COⅠ基因序列。由COⅠ基因序列构建的邻接树及Network分析显示,武汉8个湖泊中所得到的微型裸腹溞序列分为3大枝并具有14种不同的单倍体型。曼-惠特尼检验及科尔莫格罗夫-斯米尔诺夫检验均表明,湖泊内和湖泊间的微型裸腹溞遗传距离存在极显著差异。武汉市不同湖泊间微型裸腹溞存在遗传分化倾向。微型裸腹溞COⅠ基因在选择上是中性的,并且积累了相对较多的突变位点,可以用于种群遗传结构尤其是大尺度上的种群遗传结构分析。     

滤食性鲢、鳙肠含物PCR-DGGE指纹分析

以采自武汉东湖的滤食性鲢、鳙为对象，通过PCR-DGGE并结合序列分析对其肠道微生物及肠含物中残留的食物组分进行了探索研究。在所有个体中都能检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带，其中包括肠道细菌在内的原核谱带较多，真核谱带相对较少；分析结果表明针对鲢、鳙肠含物这一特殊生境样品进行PCR-DGGE指纹分析是可行的。PCR-DGGE指纹结构及针对部分特定PCR-DGGE谱带的序列分析显示，从武汉东湖采集的鲢、鳙在食性上存在很大的重叠，并没有像基于常规食性分析文献报道的那样明显不同。基于肠含物DNA来进行鱼类食性分析的方法不受对食物碎片分类鉴定的制约，可同时对多个样品平行进行分析，且不同研究者间的研究结果便于进行比较，以便总结生态学的内在规律。