中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析

为了解我国主要对虾养殖区的白斑综合征病毒(WSSV)胶原蛋白基因(wsv001)蛋白结构变异情况,以2015年13个省市发病地区采集的57份WSSV阳性样品为模板,用特异引物对目的片段进行扩增,连接转化扩增片段并进行测序分析。结果显示,57份WSSV阳性样品中,扩增出现条带的样品共有18份。氨基酸序列比对结果显示,扩增的wsv001片段所编码氨基酸出现三类变异,包括18个氨基酸小片段缺失,121个氨基酸大片段缺失及氨基酸插入,此外,还有8个氨基酸存在突变。结果表明,我国不同地区wsv001基因及其编码氨基酸存在明显缺失变异。对wsv001蛋白结构缺失变异的分析,为进一步对其蛋白功能和WSSV毒株毒力及WSSV对环境适应能力的研究提供参考。     

2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较

为了解我国白斑综合征病毒(WSSV)流行变异特征，本研究对2015年4~10月期间在山东、江苏、天津、浙江、海南和广东6省市采集到的57份WSSV阳性的样本，通过特异性的扩增目的片段，根据测序结果分析比较不同地区、不同分离株之间在ORF14/15、ORF23/24上的缺失变异情况，以及ORF75、ORF94和ORF125上的重复单元(Repeat unit, RU)数目差异。结果显示，在ORF14/15扩增中，分别有6530、5908和5725 bp的片段缺失，而在ORF23/24扩增中均有12070 bp大片段的缺失，ORF75的45 bp的RU数目分别为1、2和3，102 bp的RU数目均为1，而ORF94的RU数目分别为4、5、10和12不等，ORF125的RU数目为3、5和6。结果表明，WSSV在部分开放型阅读框上表现出明显的变异差异，而在某些开放型阅读框上的缺失情况则有显著的稳定性。