家猪AFLP分析体系的建立

以大白等6个猪品种为试验材料，建立了家猪扩增酶切片段长度多态性(AFLP)分析体系，对其分析过程中DNA提取、双酶切、连接、预扩增、选择性扩增、银染效果进行了检测。用E39M48引物组合构建了供试猪的AFLP指纹图谱。条带清晰可辨，扩增信号强，无背景干扰。     

应用分子标记AFLP建立不同猪种间遗传关系

作者首先在实验室建立了猪的AFLP分析体系。经过筛选,利用16对引物组合构建了中国6个常见猪品种中共计20个样本的AFLP分析图谱,通过统计分析,得到了6个猪品种的遗传距离,并由此构建了聚类分析图。在此基础上,得到了一些品种特异性的片段,这些片段为进一步寻找这些品种特异性的分子标记提供了可能。     

利用cDNA-AFLP技术研究副溶血弧菌感染下拟穴青蟹的基因差异表达

研究以实验室分离自汕头牛田洋青蟹养殖区的副溶血弧菌感染的健康拟穴青蟹,利用cDNA-AFLP技术分析感染前后拟穴青蟹肝脏组织基因的转录表达差异,最终获得了23个差异片段,其中20个片段成功测序。BLAST分析表明,序列与已知功能基因具有同源性的有6个,其中5个经real-time PCR重新验证为上调表达,主要涉及参与能量代谢的精氨酸激酶(arginine kinase)和甘油醛3磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)、磷酸烯醇丙酮酸羧激酶(phosphoenolpyruvate carboxykinase),以及参与转运过程的精氨酰tRNA合成酶(arginyl-tRNA synthetase),同时,还有直接参与免疫防御反应的凝乳状蛋白酶(chymotrypsin-like proteinase)。另外,8个差异片段与已知基因或序列无同源性。     

利用RAP-PCR检测高盐刺激下Shewanella piezotolerans WP3的基因差异表达

选取高盐刺激为条件，利用实验室模拟极端环境培养条件下的菌体提取RNA，采用差异显示方法RAP—PCR扫描盐刺激下基因的差异表达。结果表明，在高盐刺激下，WP3下调表达的基因是SSl：hypotheticalproteins SS2：ferroxidase。上调的基因是SS3：gamme-butyrobetaineantiporter；SS4：hypothetical protein。