利用RAPD技术分析绵羊品种间遗传关系

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术研究分析了三种绵羊杂交品种及一种纯种绵羊的基因组DNA多态性。用 10个随机引物对各品种实验羊的基因组DNA进行扩增 ,平均每个品种观察到约 94个标记。扩增结果以RAPDistanceProgram软件分析表明 :中国美利奴羊A品系与中国美利奴羊B品系的随机扩增多态DNA共享度最高 ,它们构成的姊妹群依次与哈萨克羊、中国美利奴羊多胎品系成为对应的姊妹品种。     

江苏镇江长江豚类保护区浮游动物群落结构特征及江豚生存状况评估

江苏镇江长江豚类保护区是唯一没有被开辟为主航道的长江干流豚类保护区,是长江下游少有的长江江豚的优良栖息地。为了解这一地区的浮游动物群落特征,2010-2011年对镇江保护区进行了4个季度的考察和调研。结果表明,在浮游动物种类数和丰度上,原生动物和轮虫占据主导地位,但浮游动物生物量主要由枝角类和桡足类决定。保护区2(现有保护区)的物种丰度、物种多样性及生物量都要明显高于保护区1(拟扩展保护区)和主航道。浮游动物各类群随季节的变化不尽相同,原生动物和轮虫的密度高峰主要出现在春季,而枝角类和桡足类密度高峰主要出现在秋季。浮游动物多样性指数在夏季和秋季时高,在冬季时最低。对不同采样点浮游动物群落的季节变化研究发现,受干扰较多的主航道表现出更明显的季节性。结合浮游动物的渔产潜力评估,认为保护区能够满足江豚生存的鱼类资源量已趋紧张。     

转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹与理化因子的关系

对转基因鱼试验湖７个采样点的浮游生物群落进行了ＰＣＲ－ＤＧＧＥ指纹分析，并进而探讨了ＤＮＡ指纹与理化因子的关系。结果表明：（１）ＰＣＲ－ＤＧＧＥ指纹图谱中共含１０４谱带，其中原核谱带５８条，真核谱带４６条，其多态性位点分别为８７．９％和８２．６％。（２）各站点的理化因子中，Ⅰ站的ＴＰ含量最高（０．１０ｍｇ／Ｌ），ＴＮ含量在Ⅲ站最高（０．３４ｍｇ／Ｌ），且各站点波动较大，Ⅴ站的透明度最低（６３．００ｃｍ）；ＮＯ３－Ｎ、ＮＨ４－Ｎ、ｐＨ、ＤＯ、ＣＯＤ及电导率在各站点变化不大。基于原核生物图谱的相似性聚类分析表明，浮游生物群落Ⅵ和Ⅶ、Ⅳ和Ⅴ、Ⅱ和Ⅲ相似度分别较高，Ⅰ站有别于其它各站，单独为１枝；基于真核生物图谱的聚类分析显示，Ⅰ、Ⅱ站聚为１枝，Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ依次相聚后与Ⅲ站聚为另１大枝，Ⅰ、Ⅱ站与Ⅲ站相距较近；理化因子的主成分分析结果与之基本吻合。因此，浮游生物群落ＤＮＡ多态性与环境理化因子是密切相关的，这类资料的积累将为在分子水平上建立水质预测预报体系奠定基础，为评价转基因鱼生态安全性提供依据。     

转基因鱼试验湖浮游生物群落DNA指纹与理化因子的关系

对转基因鱼试验湖7个采样点的浮游生物群落进行了PCR-DGGE指纹分析,并进而探讨了DNA指纹与理化因子的关系.结果表明:(1)PCB-DGGE指纹图谱中共含104谱带,其中原核谱带58条,真核谱带46条,其多态性位点分别为87.9%和82.6%.(2)各站点的理化因子中,Ⅰ站的TP含量最高(0.10 mg/L),TN含量在Ⅲ站最高(0.34 mg/L),且各站点波动较大,Ⅴ站的透明度最低(63.00 cm);NO3-N、NH4-N、pH、DO、COD及电导率在各站点变化不大.基于原核生物图谱的相似性聚类分析表明,浮游生物群落Ⅵ和Ⅶ、Ⅳ和Ⅴ、Ⅱ和Ⅲ相似度分别较高,Ⅰ站有别于其它各站,单独为1枝;基于真核生物图谱的聚类分析显示,Ⅰ、Ⅱ站聚为1枝,Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ依次相聚后与Ⅲ站聚为另1大枝,Ⅰ、Ⅱ站与Ⅲ站相距较近;理化因子的主成分分析结果与之基本吻合.因此,浮游生物群落DNA多态性与环境理化因子是密切相关的,这类资料的积累将为在分子水平上建立水质预测预报体系奠定基础,为评价转基因鱼生态安全性提供依据.     

主养草鱼池塘三种混养模式下鱼类肠道菌群PCR-DGGE比较

消化道微生物在宿主生长、营养和健康等方面起到重要的作用.本实验采用基于PCR扩增的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术比较研究了主养草鱼(Ctenopharyngodon idellus)池塘三种不同混养模式下的鱼类肠道菌群差异.结果表明,三种混养模式下同种鱼的生长率出现显著性差异(P＜0.05),而肠道细菌16SrDNA V3区特征片段PCR-DGGE指纹分析显示草鱼的肠道菌群相似性较高(＞42.2％);投喂配合饲料的草鱼与摄食浮游生物的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis和匙吻鲟(Polyodon spathula)肠道菌群结构相差最大(＜19％),鲢和鳙肠道菌群相似性较高(＞41.6％),除模式Ⅱ鳙的肠道和匙吻鲟的胃菌群具有较高的相似性(＞50.3％)外,匙吻鲟的消化道菌群和鲢鳙的相似性低.实验共回收测序了14条特定DGGE条带中的DNA片段,并进行系统进化分析,结果显示,这14条条带分别归属于4个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),厚壁菌门(Firmicutes)和梭杆菌门(Fusobacteria).研究结果为鱼类混养模式的优化,饲料研发和鱼病防治提供了基础参考资料.     

江苏镇江长江豚类保护区浮游动物群落结构特征及江豚生存状况评估

江苏镇江长江豚类保护区是唯一没有被开辟为主航道的长江干流豚类保护区,是长江下游少有的长江江豚的优良栖息地。为了解这一地区的浮游动物群落特征,2010-2011年对镇江保护区进行了4个季度的考察和调研。结果表明,在浮游动物种类数和丰度上,原生动物和轮虫占据主导地位,但浮游动物生物量主要由枝角类和桡足类决定。保护区2（现有...     

武汉市湖泊微型裸腹溞种群遗传结构比较分析

分析武汉市9个湖泊中枝角类微型裸腹溞(Moina micrura)细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的多样性情况,对种群遗传多样性进行分析,了解不同地理距离对枝角类种群遗传分化的影响。形态鉴定表明,9个湖泊26个样点中共有8个湖泊17个样点检出微型裸腹溞,牛山湖设置的3个样点均未检测出微型裸腹溞。通过基因测序共得到66条微型裸腹溞COⅠ基因序列。由COⅠ基因序列构建的邻接树及Network分析显示,武汉8个湖泊中所得到的微型裸腹溞序列分为3大枝并具有14种不同的单倍体型。曼-惠特尼检验及科尔莫格罗夫-斯米尔诺夫检验均表明,湖泊内和湖泊间的微型裸腹溞遗传距离存在极显著差异。武汉市不同湖泊间微型裸腹溞存在遗传分化倾向。微型裸腹溞COⅠ基因在选择上是中性的,并且积累了相对较多的突变位点,可以用于种群遗传结构尤其是大尺度上的种群遗传结构分析。     

西藏尼洋河流域浮游动物群落结构研究

尼洋河是雅鲁藏布江流域内的五大支流之一,具有独特的地理位置和自然环境.在前人研究的基础上,通过扩大干流与主要支流上的采样点、增加对支流巴河上的冰川堰塞湖-巴松错采样,研究尼洋河流域的浮游动物群落结构.经鉴定,浮游动物有47属、78种；其中,原生动物17属、35种,占浮游动物总物种数的45％；轮虫17属、30种,占39％；枝角类9属、9种,占12％；桡足类4属、4种,占4％.结果表明,尼洋河流域动物群落结构在种数上以原生动物和轮虫为主,密度上主要取决于原生动物和轮虫密度的多寡,枝角类和桡足类所占的比例极低；生物量以轮虫、枝角类和桡足类为主,原生动物所占比例最少.结合各采样点的生境特征分析,尼洋河干流和支流中的巴郎曲和巴河浮游动物物种丰富、群落结构复杂、群落稳定性较高；本研究再次证明尼洋河地区肉足虫类是以古北区种类分布为主的特点,并对筒壳亚目(Tintinnina)在西藏及其周边地区的分布情况进行了研究,对解决西藏原生动物的起源和演化具有十分重要的意义.统计分析表明,相较于海拔高度的变化,小环境对浮游动物的分布有更大的作用.     

春、秋季武湖浮游动物群落特征及其与环境因子的关系

2007年和2008年春（5月）、秋（11月）季对武湖浮游动物进行了4次调查,共检出浮游动物133种,其中原生动物61种,轮虫63种,枝角类6种,桡足类3种。浮游动物物种数春季较多,2007年和2008年分别为86种和85种;秋季较少,分别为73种和72种。2007年春季浮游动物总丰度最高,为49605个/L;2007...     

春、秋季武湖浮游动物群落特征及其与环境因子的关系

2007年和2008年春(5月)、秋(11月)季对武湖浮游动物进行了4次调查,共检出浮游动物133种,其中原生动物61种,轮虫63种,枝角类6种,桡足类3种。浮游动物物种数春季较多,2007年和2008年分别为86种和85种;秋季较少,分别为73种和72种。2007年春季浮游动物总丰度最高,为49605个/L;2007年秋季和2008年春、秋季浮游动物总丰度较低;原生动物和轮虫的丰度是武湖浮游动物丰度的主体。浮游动物丰度和环境因子的典型对应分析(CCA)表明,叶绿素a、总磷、总氮、化学需氧量、溶解氧、水温和透明度是与武湖浮游动物群落相关性较强的环境因子(P<0.05),且相关性较强的环境因子在各季节是不同的,表明武湖浮游动物群落结构的季节变化与水体营养状况密切相关。