动物抗凝血酶Ⅲ和褐藻糖胶结合的结构模拟

褐藻糖胶是一种含有硫酸基的水溶性杂多糖,其抗凝血与抗血栓等生理机能与肝素类似。用分子动力学计算,模拟抗凝血酶Ⅲ结合褐藻糖胶的结构变化。抗凝血酶Ⅲ和褐藻糖胶结合时Arg393从抗凝血酶Ⅲ的内部激发到了分子表面,Arg393与凝血酶活性中心的Asp、His、Ser结合,继而进入到四面体的过渡状态。