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【目的】为了制定更好的一串红全基因组denovo测序策略及筛选SSR标记。【方法】利用Illumina测序平台对一串红基因组大小进行测定,通过生物信息学分析对一串红基因组的重复序列、杂合度等基本信息进行了预估,并进行了初步组装,在此基础上对一串红全基因组进行了SSR查找。【结果】(1)一串红全基因组大小预估为841Mbp;(2)一串红基因组杂合度较低,有一定的重复序列;(3)共获得95 982个重复单元长度为1~6碱基及复合型的SSR重复序列,其中单碱基重复的SSR单元最为丰富,共39 903个,占41.6%;其次是二碱基重复类型(24 820个)和复合型(13 281个),所占比例分别为25.9%和13.8%。【结论】为一串红全基因组denovo测序和SSR标记的筛选提供了依据,对于一串红后续的分子水平上的研究及遗传多样性、遗传图谱构建、品种鉴定等提供了应用价值。 相似文献
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以一串红35及35-1为试验材料,采用实时荧光定量PCR技术,研究了S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)基因在35及35-1不同发育时期、不同部位的表达情况。结果表明:幼苗期腋芽未形成和腋芽形成后35中SAMDC基因的相对表达量均低于35-1;营养生长期35的茎节、根尖及侧枝顶芽中SAMDC的表达量均高于35-1,且差异显著。试验表明,SAMDC在一串红幼苗顶芽中相对表达量高,可促进植株细胞分裂分化形成侧芽;营养生长期SAMDC相对表达量低,可促进分支和枝条伸长生长。 相似文献
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一串红株型突变体AFLP分析 总被引:2,自引:1,他引:1
一串红(Salvia splendens)株型突变体BN35—1分枝能力强,不必摘心,株型自然成球。本研究利用AFLP(amplified fragment lengthpolymorphism)分子标记技术对其进行分析。从21对引物组合中筛选出6对多态性高的引物组合对突变体BN35—1、野生型BN35及4个商品种进行亲缘关系分析以确定BN35—1与BN35亲缘关系。另外用21对供试引物组合单独对突变体及原种进行多态性分析以寻找差异条带。结果表明,BN35—1与BN35亲缘关系最近,相似系数为0.9861,远高于其他商品种、BN35与商品种以及商品种间的相似性。在21对供试引物组合中,12对引物检测出BN35—1与BN35基因组DNA共52处基因座位位点存在差异,相应的特异条带是控制株型突变或与控制株型突变基因相连锁的侯选基因片段,深入研究工作有待进一步进行。 相似文献
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以一串红“彩铃红”及其野生型为试材,研究了外源生长素IAA、脱落酸ABA对侧芽萌发前后“彩铃红”侧芽生长及外源反式玉米素核苷ZR、玉米素ZT对侧芽萌发前后一串红野生型侧芽生长的影响,旨在为探索“彩铃红”顶端优势丧失、株型低矮成球的形成机理奠定一定的基础.结果表明:对一串红“彩铃红”侧芽萌发前的幼苗施加外源IAA和ABA,“彩铃红”侧芽生长受到抑制;对“彩铃红”侧芽萌发后的幼苗施加外源IAA和ABA,“彩铃红”侧芽生长得到促进.对一串红野生型侧芽萌发前、萌发后的幼苗施加外源ZR和ZT,野生型侧芽生长都得到促进.由此得出,“彩铃红”株型形成与激素相关. 相似文献
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北京地区常见鼠尾草属植物AFLP亲缘关系分析 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]采用AFLP分子标记技术对北京地区鼠尾草属(Salviaspp.)植物的7个种23份样本进行亲缘关系分析。[方法]利用21对引物组合中筛选出的稳定性好、多态性较高的6对引物用于扩增北京地区鼠尾草属植物基因组DNA,银染后在灯光下统计扩增条带数,构成二进制矩阵表。用NTSYSpc2.10e软件进行分析,采用UPGMA方法进行聚类分析,通过Treeplot模块生成聚类图。[结果]对23份鼠尾草属植物进行AFLP分析,得到367个扩增位点,其中多态性位点359个,占总扩增位点的97.82%。在遗传距离为0.32的水平下,23份鼠尾草属植物样本归为7个组:一串红(S.splendens)组、蓝花鼠尾草(S.farinacea)组、朱唇(S.coccinea)组、雪见草(S.plebeia)组、丹参(S.miltiorrhiza)组、荫生鼠尾草(S.umbratica)组和罗马尼亚鼠尾草(S.officinalis)组。蓝花鼠尾草、朱唇、雪见草、丹参、荫生鼠尾草、罗马尼亚鼠尾草与一串红的亲缘关系依次增远;一串红种内,自选品种(系)与商品种亲缘关系较远。[结论]该研究结果可为北京地区开展鼠尾草属植物的种间和种内远缘杂交提供理论参考。 相似文献
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一串红对水分胁迫的生理响应 总被引:1,自引:0,他引:1
以5个一串红品种(系)为试材,在水分胁迫,即干旱胁迫和水涝胁迫2种处理下的生理反应,测定一串红叶片相对含水量、电导率、丙二醛(MDA)含量、游离脯氨酸(Pro)和可溶性蛋白含量的变化。结果表明:在干旱胁迫处理下,胁迫8 d后,一串红叶片伤害度、MDA含量和游离脯氨酸(Pro)含量明显增加;可溶性蛋白含量呈平稳下降;叶片相对含水量在第11天后明显下降。在水涝胁迫处理下,一串红叶片相对含水量没有明显变化;水涝胁迫4 d后,叶片伤害度呈明显增加趋势;MDA含量和游离脯氨酸(Pro)含量总体呈上升趋势;可溶性蛋白含量持续下降。一串红水分胁迫耐受临界点在干旱胁迫下8 d左右、水涝胁迫下4 d左右,在栽培过程中应注意掌握水分供给时间及防止持续水涝影响一串红正常生长。 相似文献
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