枣MAPK基因片段克隆与分析

采用同源基因克隆法,首次获得了枣MAPK基因片段543 bp,经Blast比对,该序列与湖北海棠(Malus hupehensis EF427897.1)、蓖麻(Ricinus communis XM002509805.1)、西府海棠(Malus micromalus AF435805.2)和欧洲山毛榉(Fagus sylvatica AJ784997.1)的相似率分别为86%、86%、85%和84%。进一步进行系统进化分析,证明该基因属于MAPK中TEY型的B类。     

赞皇大枣枣疯病植原体分子分类

 【目的】枣疯病是一种重要的植原体病害，本试验旨在明确惟一已知的天然三倍体品种--赞皇大枣枣疯病植原体的分类地位，为赞皇大枣枣疯病植原体分类研究提供参考。【方法】利用植原体16S rDNA通用引物对赞皇大枣枣疯病病株的DNA进行PCR扩增和克隆测序，通过BLAST比对进行序列分析，利用临位相连法构建16S rDNA系统演化树，并应用DNAstar软件进行虚拟RFLP分析。【结果】获得的赞皇大枣枣疯病植原体16S rDNA序列长度为1 850 bp（GenBank登录号GU184180），包括1 529 bp的16S rDNA基因全序列、264 bp的邻近间隔区序列及57 bp的23S rDNA部分基因序列。同源分析表明，赞皇大枣枣疯病病原16S rDNA序列与其它植原体的相似性在87%—98%，其中与榆树黄化 Elm yellows（EY）(GenBank登录号l33763)最高相似性为98%；与大多数二倍体枣品种的植原体序列相似率达99%以上；其虚拟RFLP图谱与4个16SrⅤ亚组的代表序列图谱差异显著,赞皇大枣枣疯病植原体延伸因子tuf基因的序列(GenBank登录号JN001985) 比对结果表明，与其它亚组序列同源性为52.3%—76.7%。【结论】三倍体赞皇大枣枣疯病病原属于榆树黄化组(16Sr V)，并与其中的B亚组亲缘关系最近；与二倍体品种的病原分类地位一致，说明枣疯病植原体在系统进化上比较保守。