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中国4大湖泊大鳞副泥鳅群体遗传多样性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
为保护大鳞副泥鳅种质资源,制定合理的野生资源保护策略,并为大鳞副泥鳅良种选育确定合适的育种基础群体,通过第二代测序技术自主开发并合成微卫星引物400对,经验证后随机采用其中的17个多态性微卫星标记对太湖、洪泽湖、洞庭湖和巢湖等4大湖泊的野生大鳞副泥鳅群体进行遗传多样性分析。检测到各基因座的平均观测等位基因和有效等位基因数分别为9.5和5.5个。平均期望杂合度为0.566 5,平均Fst值为0.219 4(0.2),Nm为0.889 4(1),表明4个大鳞副泥鳅群体间遗传交流较少,存在着较高程度的遗传分化。4个大鳞副泥鳅群体的等位基因数为5.4~6.2(平均5.8),观测杂合度0.273 2~0.386 4,期望杂合度0.562 9~0.589 3,多态信息含量(PIC)为0.550 3~0.575 4,表明4个群体具有丰富的遗传多样性。4个大鳞副泥鳅群体间的遗传距离为0.528 3~0.967 7,洪泽湖和太湖群体间的遗传距离最小(0.528 3),而太湖和巢湖群体间遗传距离最大,亲缘关系相对较远。基于遗传距离的聚类结果显示4个群体先聚为2个分支,其中太湖和洪泽湖群体聚为一支,洞庭湖和巢湖群体聚为另一支,这与4个大鳞副泥鳅野生群体的地理分布一致。中国4大湖泊大鳞副泥鳅自然群体具有丰富的遗传多样性,每个群体宜作为独立的保护单元进行保护。4个大鳞副泥鳅群体中太湖群体和洪泽湖群体的遗传多样性最高,可作为进一步遗传选育的基础群体。  相似文献   
2.
大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类,通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序,其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本,AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序,分别获得了65 536和80 786个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)突变;对2个测序样本进行表达差异的比较,获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物,进行验证分析,共获得16个有效的多态性标记。  相似文献   
3.
将大鳞副泥鳅幼鱼随机分为5组,分别用含硒量为0.0(0.31)、0.1(0.39)、0.2(0.48)、0.4(0.50)和0.6(0.62)mg/kg的饲料投喂60 d,每组3个重复。试验结束后测定各组大鳞副泥鳅肌肉中的一般营养成分、矿物元素含量、氨基酸含量,并对其进行营养品质评价。结果表明:投喂不同硒含量的饲料对大鳞副泥鳅肌肉的水分、粗脂肪、粗蛋白没有显著影响(P>0.05),但在0.2(0.48)mg/kg饲料组其粗蛋白含量达到最大值,水分达最小值;灰分在0.1(0.39)、0.2(0.48)和0.4(0.50)mg/kg组显著或极显著低于对照组(P<0.05或P<0.01);Fe、Zn、Mn、Se、K、Na元素在0.2(0.48)mg/kg饲料组均显著或极显著高于对照组(P<0.05或P<0.01);TAA、EAA、EAAI和DAA与对照组相比均无显著性差异,但在0.1(0.39)mg/kg饲料组均达到最大值。  相似文献   
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