兰坪乌骨绵羊WWOX基因生物信息学分析

为探索兰坪乌骨绵羊乌质性状的分子遗传基础,根据NCBI收录的绵羊WWOX(WW Domain ContainingOxidoreductase)基因设计9对外显子特异性引物,扩增测序后拼接序列,编码区翻译后得到的蛋白质序列进行空间结构预测。兰坪乌骨绵羊WWOX基因位于14号染色体,WWOX蛋白由1 436个碱基编码414个氨基酸。WWOX是一种主要定位于细胞质中的亲水性非跨膜蛋白,其碱基序列与普通绵羊同源性对比为99.57%,氨基酸序列同源性对比为100%,发现有7个同义突变位点,蛋白结构预测显示WWOX空间结构主要由α螺旋、无规则卷曲构成。本实验进一步探索兰坪乌骨绵羊WWOX基因空间结构与“乌质”性状形成机制间的联系并提供理论支撑。     

微流控芯片技术在微生物检测中的应用

微流控芯片是一项以芯片为基础,结合化学、物理学、生物学等多学科形成的技术平台,能够在一个芯片上实现样品制备、反应、分离、检测等流程,具有高通量、高效率和易操作的特点。随着材料科学和纳米技术的发展,该项技术得到迅速发展并应用于化学分析、微生物检测等,尤其是在微生物检测和分析方面发挥着重要作用,并逐步产生了商品化的微流控芯片。微流控芯片因具有小型化、节约试剂、速度快、集成化程度高等优点,适用于处理突发公共卫生事件,但目前在动物疫病检测中的应用还很少见。本文对微流控芯片的技术原理、结构及其在微生物检测中的应用进行综述,以期为动物疫病的高通量检测提供借鉴。     

我国部分地区Sicinivirus流行病学调查

Sicinivirus是一种禽类新发病毒,可引起家禽发育迟缓综合症、腹泻、吸收不良综合征等。目前,仅部分国家开展了该病毒的流行病学调查,研究数据极为有限。为明确该病毒在我国的流行情况,以及该病毒感染率与地域、宿主、养殖方式之间的关系,2019年下半年在江苏、广西、河北、安徽、广东、上海、湖北和江西8个省(自治区、直辖市),采集25个场点1 920份家禽咽喉/泄殖腔双拭子样品,采用RT-PCR方法进行Sicinivirus检测和基因测序分析。采样场点涉及农贸市场、批发市场、屠宰场和养殖场,样品来自鸡、鸭、鹅以及鸽和鹧鸪等不同禽类。结果显示:25个场点中有13个检出阳性,检出阳性样品134份,个体阳性率为6.97%(134/1 920)。其中,河北、湖北、上海、广东、江苏、江西、广西和安徽的个体阳性率分别为24.16%(58/240)、10.83%(24/240)、5.83%(14/240)、5.41%(13/240)、4.16%(10/240)、2.50%(6/240)、1.66%(4/240)和1.25%(3/240),鸡、鹅和鸽的个体阳性率分别为10.81%(132/1 221)、2.44%(1/41)和0.42%(1/235),鸭和鹧鸪中未检测到Sicinivirus。农贸市场、批发市场和屠宰场的个体阳性率分别为3.00%(18/600)、6.23%(58/930)和24.16%(58/240),养殖场中未检测到Sicinivirus。结果表明,鸡是该病毒主要的易感宿主,不同类型场点感染率差别较大,表明家禽养殖环境与该病毒的感染有较大的关系。     

单产15000 kg/hm2以上玉米品种子粒灌浆特征分析

选用具有高产潜力的6个玉米杂交种,采用12万株/hm²的密度大田种植,研究高产玉米不同品种子粒灌浆特征的差异及其与粒重的关系。结果表明,6个玉米杂交种均可实现15 000 kg/hm²的高产水平。良玉66和中单909前中期灌浆速率高,且最早到达最大灌浆速率;灌浆速率下降慢的品种,成熟相对偏晚。品种间差异主要是灌浆速率和到达最大灌浆速率的时间不同,活跃灌浆期并没有明显差异。影响不同品种粒重的主要因素是线性灌浆期和缓慢灌浆期的灌浆速率。因此提高品种的线性灌浆期和缓增期灌浆速率可以增加粒重。在新疆伊犁春播玉米高产区,适宜的高产品种为中单909和良玉66。     

新城疫病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与应用

为满足新城疫病毒高通量快速检测的需要,针对新城疫病毒M基因序列,通过基因比对分析保守区域,经同源性分析后,设计合成多条引物和探针并对其筛选,建立了一种能够快速检测新城疫病毒的实时荧光RTPCR检测方法,并对该方法的特异性、灵敏性进行了评估。结果显示,该方法检测耗时短、特异性好,检测下限达10~(-4) ng/μL。利用该方法,对480份临床采集的各类家禽咽拭子样品进行检测,共检测出25份阳性,与常规RT-PCR检测方法结果一致,κ值为1(P 0.001)。结果表明,该方法快速、准确,可用于新城疫病毒的快速检测。     

宁夏某猪场猪流行性腹泻紧急流行病学调查

2017年5月10日,宁夏回族自治区动物疾病预防控制中心接到青铜峡市某规模化猪场发生大规模腹泻的报告。经流行病学调查和实验室检测,确定猪流行性腹泻病毒是导致该猪群发生大规模腹泻的主要原因,生物安全管理水平不高、运输车辆或人员进场管理不严是疫病传入的主要风险因素;场内管理不严是疫情扩散的原因。按照调查建立的病因假设,采取了针对性防控措施,包括对猪场的入场清洗消毒设施等进行升级改造,加强饲养管理等。半年内该场未再发生大规模猪腹泻疫情。     

猪链球菌35个血清型标准抗血清的制备及应用

用猪链球菌35个血清型的标准菌株免疫新西兰白兔制备标准抗血清,经试管凝集测定抗血清的效价均在1:32以上,吸附处理后抗血清具有良好的特异性和敏感性。对12株猪链球菌的试验结果表明:抗血清只与相同血清型的菌株出现凝集,可以区分出PCR方法无法区分的1型和14型以及2型和1/2型,并在国内首次鉴定出猪链球菌13型。     

猪链球菌2型毒力因子与MLST分型分析

为了解我国猪链球菌2型毒力因子和MLST型的特点,对四川、重庆和山东等地的22株猪链球菌2型进行毒力因子检测和ST型分析。结果显示,78%(17/22)的分离株为sly+mrp+epf+基因型的强毒株,仅山东省的5株分离株为弱毒力型。四川省和重庆市89%(15/17)的分离株为毒力较强的ST7型,而山东省的分离株均为毒力稍弱的ST1型。结合这些地区的猪链球菌病发病情况,分析提示猪链球菌2型的毒力因子和ST分型与菌株的致病性有一定的相关性。     

猪链球菌2型分泌性核酸酶A(SsnA)活性检测及其基因序列的克隆与测序分析

对8株猪链球菌2型重庆分离株的核酸酶A全基因进行克隆测序,结果表明该基因长度为3 126 bp,与Gen-Bank发表的唯一的该基因的序列相比,核苷酸同源性高于98%,推导的氨基酸同源性高于94%。根据核酸酶A基因的测序结果建立扩增片段长度为301 bp的PCR检测方法,并用甲苯胺蓝DNA酶琼脂对猪链球菌分泌性核酸酶A的活性进行检测。检测了从病猪内脏分离的猪链球菌致病株35株,33株核酸酶A基因PCR检测阳性(阳性比例为94.3%),其中有24株分泌活性检测为阳性(阳性比例68.6%);正常猪扁桃体分离株14株,PCR检测为阳性的10株(阳性比例71.4%),其中有核酸酶A分泌活性为8株(阳性比例57.1%),检测菌株中有2型猪链球菌44株,38株扩增出核酸酶A基因的片段PCR检测阳性并且分泌活性为阳性的有32株,猪链球菌1型、7型、9型、13型、1/2型各1株,均能扩增出核酸酶A基因的片段,但只有13型猪链球菌有核酸酶A分泌活性。对猪链球菌在不同生长时期核酸酶活性的检测显示,猪链球菌在培养4、8、16、32、48 h均有核酸酶A的分泌,并且C a2 和M g2 为分泌性核酸酶A的活性必需因子。     

禽偏肺病毒研究进展

禽偏肺病毒(avian metapneumovirus,aMPV)可感染火鸡、鸡、鸭以及一些野生禽类,传染性强、传播迅速,易造成继发感染,导致严重的上呼吸道感染和产蛋率下降等症状。该病在世界范围内广泛流行,并呈地方性流行,给养禽业造成严重经济损失。本文以国内外对aMPV在禽类中的流行病学调查和基因分析研究报道为基础,从病原学、流行病学、病毒分离鉴定和防治的角度,对其在禽类中的感染情况和引起的相关疾病进行简要概述;比较多种分子生物学检测方法的优缺点和实用性,为建立快速、简便、实用的aMPV检测方法提供参考。