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烟草脉清病毒完整基因组上微卫星分布特性研究 总被引:2,自引:0,他引:2
借助MATLAB软件和最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中烟草脉清病毒完整基因组(NC-003378.1)上微卫星分布特性。结果表明,计算出了各种1-碱基组~6-碱基组在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,并展示它们的分布规律(指数函数)。烟草脉清病毒完整基因组上各种N-碱基组最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;各种N-碱基组重复出现次数由少到多排序的结果,重复出现次数随序号增加。该研究方法可以系统地运用到其他病毒完整基因组序列微卫星分布特性的提取和展示,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供依据。 相似文献
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Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组上微卫星分布 总被引:3,自引:1,他引:2
为了展示Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组上的微卫星分布特性。借助MATLAB软件、应用最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组(AF_188481.1)上的微卫星分布特性,计算1-碱基组至6-碱基组在完整基因组序列上重复出现的次数和位置,展示它们的分布规律(指数函数)。结果表明:Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组(AF_188481.1)上各种N-碱基组(N取1至6)最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;笔者提取和展示Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组序列微卫星分布特性(特别是微卫星各种N-碱基组重复出现的位置和次数)的方法,可以系统地运用到其他病毒完整基因组序列微卫星分布特性的提取和展示中,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供完备、仔细的数据支撑。 相似文献
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本文利用自编计算机程序提取并展示马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上微卫星分布特性。借助MATLAB软件和借用最优完全子图算法,分析NCBI数据库中该基因组(NC_011620.1)微卫星分布特性。结果表明,计算出所有各种N-碱基组(N取1至6)在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,展示它们的分布规律(指数函数),马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上各种N-碱基组最大的重复出现次数随N按指数函数数减少;且呈现出重复出现次数由少到多排序,重复出现次数随序号增加;本文使用的方法,可以系统地应用到其它病毒完整基因组序列微卫星分布特性分析,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供完整的数据支撑。 相似文献
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借助MATLAB软件利用自编程序,构造一个简明模型来仿真演示新农村建设中经济人利他行为对社会福利的影响。结果表明,在无强制机制约束条件下,无利他奖励机制的群体,利他倾向大的成员,其后期可配置资源和发展水平少于较自私成员;在无强制机制约束条件下,有事后奖励机制但无事后奖励预期的群体,利他倾向大的成员,其后期可配置资源和发展水平多于较自私成员;社会福利由于利他行为产生的利他社会效益,利他者获得的合作剩余和利他行为带来的荣誉义务效用而更大。由于新农村建设增加社会福利和发展农村生产力的一个有效途径是提升农民的理性模式和需求结构,为此可从群体和个人2个方面建立和完善利他行为奖励机制。 相似文献
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提取6个癌基因(BAK1、ccnd1、A DA MTS1、ADAM17、A DA MTS8、A GER)的碱基序列,借助MATLAB软件编写程序代码,检索6个癌基因碱基序列的4种单一碱基(A、T、C、C)的概率和64种三碱基组(AAA、AAT、AAC、……、GGG)的概率;对6个癌基因碱基序列的各种分布进行相空间聚类.结果表明,所在染色体不同、所在细胞不同、序列长度不同的6个癌基因碱基序列的结构特点与其生物学功能之间存在着明确的相空间关联.对生物学功能未知的基因和生物学功能已知的基因进行碱基序列结构特点分析和相空间聚类,可以由聚类结果预测功能未知基因是否具有与功能已知基因相似的生物学功能,这为寻找具有某种生物学功能的基因和预测基因是否具有某种生物学功能提供了一个有效途径. 相似文献
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借助MATLAB软件和最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中烟草脉清病毒完整基因组(NC-003 378.1)上微卫星分布特性。结果表明,计算出了各种1碱-基组~6-碱基组在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,并展示它们的分布规律(指数函数)。烟草脉清病毒完整基因组上各种N-碱基组最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;各种N-碱基组重复出现次数由少到多排序的结果,重复出现次数随序号增加。该研究方法可以系统地运用到其他病毒完整基因组序列微卫星分布特性的提取和展示,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供依据。 相似文献
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