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旨在更好的了解内江猪群体结构和遗传多样性,更好的保护和利用内江猪遗传资源。本研究基于低深度全基因组测序,检测了133头(12头公猪,121头母猪)内江猪的SNP,按照SNP检出率大于90%和95%获得两组SNP数据,分别编号为NJ90和NJ95。针对两组数据,通过群体分层、遗传距离、亲缘关系、家系划分等方法分析了内江猪群体结构,通过等位基因频率、有效等位基因数、多态性标记比、杂合度等指标估计了群体遗传多样性,最后利用不同方法评估了群体近交系数。结果显示:1)NJ90共包含135 760个SNPs位点,其等位基因频率为0.87,有效等位基因数为1.27,多态性标记比为0.76,观测杂合度为0.15,期望杂合度为0.21;NJ95包含32 266个SNPs位点,其等位基因频率为0.79,有效等位基因数为1.44,多态性标记比为0.74,观测杂合度为0.30,期望杂合度为0.31。2)NJ90结果显示群体平均遗传距离为0.20,平均亲缘系数为0.9%;NJ95结果显示群体平均遗传距离为0.25,平均亲缘系数为0.7%。3)根据NJ90公猪和群体聚类以及亲缘关系,可将群体分为6个家系。4)根据... 相似文献
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在世代离散的情形下,应用计算机随机模拟技术研究当候选个体的遗传贡献和施加给QTL的相对权重一起被最优化时,使用多性状、多QTL信息的QTL优化选择所能获得的潜在的额外遗传优势.用一个实际育种猪群的参数进行模拟,选择是直接针对窝产活仔数和达100 kg日龄进行,每个性状都有2个不同效应大小的QTL正在和相应的多基因一起分离.将优化QTL选择与标准QTL选择和常规BLUP选择进行比较发现,综合了遗传贡献优化和QTL相对权重优化的QTL优化选择在固定的近交速率下能增加更多的遗传反应,同时避免了短期和长期选择反应之间的矛盾. 相似文献
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天府肉猪配套系是以四川农业大学为技术支撑,由四川铁骑力士牧业科技有限公司组织四川省畜牧总站共同历时近20年利用杜洛克、长白、大白三大外种猪及梅山猪资源,经多世代选育形成,适宜西南地区生长条件的优质瘦肉型猪配套系,于2011年通过国家畜禽遗传资源委员会审定,成为四川省首个自主选育的猪配套系。天府肉猪配套系具有遗传性能稳定,产肉性能高,繁殖性能较好,肉质优良等优点。其突出优点在于强调平衡选育和平衡生产,既不一味追求高产肉量和高瘦肉率,也不过度强调肉质优良,在商品猪实现优质与瘦肉型的平衡。相对于四川地区DLY的平均生产水平而言,其瘦肉率略有降低(63.78%VS 63.0%),但 相似文献
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通过对封山育林的作用、技术措施、政策措施及科学管理的分析认为,只有把封山育林技术措施和政策措施有效地结合起来,才能为恢复森林创造良好的社会环境。 相似文献
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基因组选择常用的评估方法GBLUP和ssGBLUP都涉及到基因组亲缘矩阵的求逆,而大规模矩阵求逆运算非常耗时。本研究以提高大型基因组亲缘矩阵求逆运算的效率为目的。本研究通过真实数据和模拟数据构建基因组亲缘矩阵,引入Intel MKL矩阵函数,以减少迭代次数(方法1)和重复分块(方法2)两种方式改良分块迭代求逆算法,编程实现算法并在台式电脑和服务器上测试计算时间。结果表明,利用方法1计算4 000×4 000的基因组亲缘矩阵逆矩阵时,与MKL库函数的加速比为0.898。而16 000×16 000矩阵的计算速度为MKL库函数的1.006倍。利用方法2计算4 000×4 000矩阵的运算速度是MKL库函数的1.084倍;而在更大型的128 000×128 000基因组亲缘矩阵求逆运算时,该方法与MKL直接求逆函数的加速比为1.805倍。相比于MKL直接求逆函数,改进后的两种方法在效率上有一定程度的提升。 相似文献