合作猪IFN-ε基因克隆及生物信息学分析

旨在克隆合作猪干扰素ε(Interferon epsilon,IFN-ε)基因,并对其结构和编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步研究合作猪IFN-ε生物学功能提供参考。根据GenBank上公布的猪IFN-ε基因序列(登录号:NM_001105310.1)设计引物,PCR扩增及测序获得合作猪IFN-ε基因完整编码区序列(Coding sequence,CDS),并对其进行生物信息学分析。结果显示,合作猪IFN-ε基因编码区长582bp,编码193个氨基酸。该基因编码区序列与杜洛克猪、人、小鼠、黑猩猩、狗、瘤牛、蒙古野马、山羊和绵羊的同源性分别为98.4%、77.7%、56.8%、78.2%、76.5%、87.0%、85.5%、85.0%和86.0%;系统进化树结果表明,合作猪与瘤牛、蒙古野马、绵羊、山羊亲缘关系较近。此外,在合作猪IFN-ε基因CDS上共发现3个碱基突变,均为错义突变。氨基酸序列分析表明,合作猪IFN-ε蛋白分子式为C_(1027)H_(1630)N_(278)O_(290)S_(10),理论分子质量为22.83ku,等电点(pI)为8.43,属于碱性蛋白;平均亲水系数为-0.240,属于亲水蛋白质;IFN-ε蛋白无跨膜结构,存在信号肽序列,属于分泌型蛋白;IFN-ε蛋白只包含1个超家族保守结构域,即IFab结构域。二级结构分析表明,该蛋白中α-螺旋、无规则卷曲、β-转角和延伸链所占比例分别为61.66%、30.05%、3.11%和5.18%。     

甘肃高山细毛羊妊娠母羊营养需要量估测

借助其他品种绵羊营养需要的一些研究方法,结合甘肃高山细毛羊四季牧草干物质采食量、营养物质摄入量、采食牧草营养成分、牧草营养物质消化率以及生产相关数据,采用析因法估测甘肃高山细毛羊能量和蛋白质需要量:成年母羊维持代谢能需要量为6.58 MJ/d(每kg代谢体重维持代谢能需要为0.417 MJ/W0.75),维持蛋白质需要量107.62g/d;妊娠前期代谢能需要量为12.54MJ/d,粗蛋白质需要量125.19g/d;妊娠后期代谢能需要量为12.86 MJ/d,粗蛋白质需要量为146g/d;通过对比研究表明,甘肃高山细毛羊成年母羊钙需要量约为8.22~9.61g/d,磷需要量为4.98~5.87g/d,食盐需要量为9~16g/d。     

'合作猪'TDRP基因的克隆及生物信息学分析

[目的]丰富猪TDRP1基因研究的基础数据.[方法]以猪NM_001198925序列为参考,设计特异性引物,通过克隆测序获得'合作猪'TDRP1基因完整CDS序列,并进行生物信息学分析,同时采用实时荧光定量PCR方法检测TDRP1基因在不同组织中的表达特性.[结果]获得了TDRP1基因完整的CDS序列(GenBank登录号:KU743254),共684bp,其编码186个氨基酸多肽.与参考序列相比,在编码区第33、348位点处发生了同义突变(C→G、C→T).TDRP1基因分子式为C897H1421N259O287S2,理论等电点(PI)为5.86,不稳定系数为62.66,疏水指数为64.03,平均亲水性为-0.939,属不稳定可溶性酸性蛋白质.二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,属混合类蛋白质.亚细胞定位结果显示,TDRP1编码的蛋白质在遗传物质复制和转录、翻译过程中发挥功能的可能性分别为26.3%、14.3%,明显高于发挥其它功能的可能性.mRNA表达分析表明,TDRP1基因在垂体和睾丸中高表达,肺、肾、小脑、卵巢中度表达,肝、脾、大脑、胃、小肠中低表达,心脏组织中不表达.[结论]成功克隆了'合作猪'TDRP1基因的完整CDS区序列,并发现了2个SNP位点;多组织转录表达分析表明TDRP1在垂体和睾丸中表达较高,可为深入研究TDRP1基因的功能提供参考.     

高繁殖力猪新品系-HN肥育性能、胴体品质与年生产力研究

【目的】研究高繁殖力猪新品系-HN的肥育性能、胴体品质及年生产力.【方法】以大白猪为对照,测定了高繁殖力猪新品系-HN 2.5~6.5月龄肥育性能及活体质量60,70,80,90kg时的胴体性能和肉质,分析其经济效益及年生产力水平.【结果】高繁殖力猪新品系-HN全期平均日增质量为614.00g/d,极显著低于大白猪(P0.01),3.5~4.5月龄时生长速度最快,日增质量达774.19g/d,全期料肉比为3.19,高于大白猪;各个体质量阶段屠宰率均在68%左右,胴体瘦肉率在51%~56%;90kg屠宰时胴体质量、眼肌面积最大,分别是61.48kg和40.73cm2,80kg屠宰时后腿比例、净肉率最大,分别是29.34%和73.12%,肉质指标都在正常范围内;新品系-HN每头母猪年提供育肥仔猪比大白猪多10.16头,60,70,80,90kg屠宰时,母猪年生产力(产肉量)分别为1 107.25,1 282.98,1 461.98,1 644.24kg.根据当前市场价格,各体质量阶段育肥猪出售时,母猪年纯盈利分别为3 681.34,5 415.34,6 335.50,6 497.25元,综合经济效益高于100kg大白猪.【结论】高繁殖力猪新品系-HN肥育性能好,胴体品质优良,综合考虑肥育性能和经济效益,80kg出售或屠宰,经济效益最好.     

甘肃高山细毛羊成年母羊四季采食量及消化率测定

选择15只甘肃高山细毛羊成年母羊,采用链烷法测定四季干物质采食量和牧草消化率,其结果为:每只成年母羊春夏秋冬四季干物质采食量分别为0.85,1.36,1.48和0.75kg·d~(-1),成年母羊每kg代谢体重四季采食量分别为61.72,93.86,93.83和47.99g·(w0.75kg)-1。每只甘肃高山细羊春夏秋冬四季代谢能食入量分别为6.11,13.30,13.99和5.08 MJ·d~(-1);粗蛋白质食入量分别为71.49,212.31,188.26和43.83g·d~(-1);钙食入量分别为2.27,8.22,9.61和2.58g·d~(-1);磷食入量分别为0.94,4.98,5.87和1.01g·d~(-1)。甘肃高山细毛羊成年母羊春夏秋冬四季牧草干物质消化率分别为44.65%,64.02%,57.73%和45.98%,四季牧草粗蛋白质消化率分别为47.40%,62.69%,59.67%和48.05%。     

猪用发酵床菌种优化组合的研究

【目的】筛选适用于西北地区猪用发酵床的最佳使用菌种,比较分析不同菌种配比对发酵效果的影响.【方法】以兰州当地的土著菌种、实验室保存的纤维分解菌群和购买的商业菌种为供试材料,共设7个处理,分别为:100%土著菌种(A1)、100%纤维分解菌群(A2)、100%商业菌种(A3)、30%土著菌种+70%纤维分解菌群(B1)、70%土著菌种+30%纤维分解菌群(B2)、50%土著菌种+50%纤维分解菌群(),不添加任何发酵菌种的处理组(CK).在模拟发酵床条件下,通过测定床体20cm处温度、垫料含水率、氨气浓度、硫化氢浓度、孔隙度等指标,选择最佳菌种配比.【结果】A3处理20cm处平均温度最高(36.23±2.24)℃,显著高于A2和CK处理(P0.05),但与A1、B1、B2和B3处理差异不显著(P0.05);B2、B3和A3处理氨气平均浓度相对较低;B1、B2和A3处理硫化氢平均浓度相对较低;A3处理垫料孔隙度平均值最高(87.91±0.91%),CK处理垫料含水率平均值最高(61.12±0.78)%,与其他处理差异不显著(P0.05).【结论】B2、B3和A3处理发酵效果均较理想.     

应用土工织物处理渠道滑坡

应用土工织物处理渠道滑坡,是利用土工织物的过滤透水性,将渠坡土中的侧向渗流,通过土工织物排入渠道中,从而达到固结边坡土体、增加边坡稳定之目的。昌黎县引滦灌区1978年动工,1984年竣工,总投资800万元。设计过水流量9.5m~2/s,灌溉面积6万多亩。该灌区二分干渠在桩号1+420～1+900范围属控方渠段,设计流量2m~3/s,渠道两侧均是水稻田。地质结构表层1m厚砂壤土,孔隙率为0.4～0.5,具有一定的湿陷性。渠底粉细砂层,渗透系数为     

日光温室滴灌番茄需水规律及水分生产函数的研究与应用

在滴灌条件下，试验研究了日光温室早春番茄的需水量、需水规律，产量与耗水量的关系，同时对番茄不同时期水分胁迫对产量的影响进行了深入研究，并根据试验研究成果，应用Jensen模型拟合了番茄水分生产函数。     

八眉猪DQA基因编码区多态性及生物信息学分析

采用克隆测序的方法对八眉猪DQA基因编码区进行多态性分析,并利用生物信息学方法预测八眉猪DQA基因的理化特性及其编码产物的结构功能。结果显示:八眉猪DQA基因编码255个氨基酸,编码区序列有14个碱基变异,11个氨基酸变异,外显子2区域表现出丰富的多态性。DQA基因编码产物是一种不稳定的水溶性蛋白,二级结构为混合型,三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成。蛋白质功能预测结果显示,信号转导、受体、胁迫应答、免疫应答和生长因子的几率较高。研究结果为八眉猪的抗病分子育种和经济性状相关基因筛选提供理论依据。