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1.
广东茄科雷尔氏菌16S rDNA序列分析   总被引:4,自引:0,他引:4       下载免费PDF全文
应用PCR方法,获得了分离自广东番茄、茄子、辣椒、烟草、空心菜、沙姜、姜、马铃薯、花生、菊花、桑树和藿香共12种作物21个茄科雷尔氏菌菌株的16S rDNA.序列测定及比较结果表明,21个广东茄科雷尔氏菌菌株16S rDNA近全长序列均为1 528 bp,序列间同源率99.2%~100%;各菌株的16S rDNA序列间只有1~12个不等的碱基差异,其中20个菌株的458~460位及474位的碱基是ACT和T,而菌株HZ-1则是TTC和A,说明广东茄科雷尔氏菌的16S rDNA序列十分保守.系统进化分析结果显示,仅菌株HZ-1聚类于茄科雷尔氏菌2a亚组中,其余20个菌株均聚类于茄科雷尔氏菌区组1中.  相似文献
2.
无公害银杏标准化栽培技术及高效间套种模式   总被引:2,自引:2,他引:0  
从肥水土管理、人工授粉、整形与修剪、疏果、病虫害防治等方面介绍无公害银杏标准化栽培技术,同时介绍了几种高效间套种模式,即银杏-桑树-花生和蔬菜模式、银杏-牧草模式、银杏-绿化苗木模式、银杏园套栽果树模式,以供参考。  相似文献
3.
大宝山重金属污染土壤微生物群落优势种群分析   总被引:2,自引:0,他引:2       下载免费PDF全文
采用16S rDNA PCR-DGGE技术,对大宝山重金属污染土壤中的微生物群落多样性进行了分析,并对其中的优势种群进行了比较研究.结果表明,重金属污染土壤中的微生物还保持着高的多样性;克隆测序结果表明重金属污染土壤中的优势菌大多为未培养菌(Uncultured bacterica),其主要优势菌群为未培养的α-变形菌纲alpha Proteobacterium、劳尔氏菌属Ralstonia、酸杆菌门Acidobacteria和放线菌属Actinobacterium,以及产卟啉菌属Porphyrobacter、Pseudochrobactrum、无色杆菌属Achromobacter和链霉菌属Streptomyces等.  相似文献
4.
 【目的】克隆植物中主要的防卫基因β-1, 3-葡聚糖酶基因,为该基因功能研究和有效利用提供理论依据。【方法】通过分析芭蕉科植物的β-1,3-葡聚糖酶基因,据其保守区域设计一对简并引物,通过RACE法从野生指天蕉中克隆得到一个β-1,3-葡聚糖酶基因的全长cDNA——glu。【结果】glu全长为1 114 bp,其推导的氨基酸序列与GenBank中其它来源的β-1,3-葡聚糖酶蛋白序列的相似性为54%—71%。其中,与芭蕉科植物Grand Nain的β-1,3-葡聚糖酶蛋白序列的相似性最高(71%)。【结论】在芭蕉类作物中克隆了一个新的β-1,3-葡聚糖酶基因,为进一步研究该基因的功能并应用于作物转基因抗病育种研究奠定了基础。  相似文献
5.
黄瓜花叶病毒荧光定量 PCR 检测方法的建立   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
【目的】建立检测香蕉中黄瓜花叶病毒 Cucumber mosaic virus(CMV)的实时荧光定量方法.【方法】根据 CMV 外壳蛋白(CP)保守序列设计了 TaqMan 实时荧光定量 PCR 特异性探针及引物,优化反应体系检测 TaqMan 探针实时荧光定量方法的灵敏度、特异性和重复性.【结果和结论】该方法检测灵敏度为4.2×102 μL-1,比普通PCR高100倍,且与香蕉束顶病毒 Banana bunchy top virus(BBTV)、香蕉线条病毒 Banana streak virus(BSV)无交叉反应,特异性和重复性都较好.用实时荧光定量 PCR 检测 14 份田间香蕉样品有 5 份样品为阳性,进一步证明建立的实时荧光定量方法可用于香蕉 CMV 的检测.  相似文献
6.
水稻橙叶病植原体16S rDNA基因的序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
利用植原体16S rDNA通用引物对水稻橙叶病发病植株的DNA进行了PCR扩增和基因克隆.序列测定表明,PCR扩增的片段全长为1 853 bp,包括1 527 bp的水稻橙叶病植原体(RYL)的16S rDNA基因全序列、234 bp的邻近间隔区的序列及部分(92 bp)23S rDNA基因序列.序列比较结果表明,RYL的16S rDNA全序列与其他植原体的相似性在88%~95%,其中与America aster yellows(AAY,GenBank登录号X68373)最高相似性为95%.利用最大简约法构建的16S rDNA系统演化树结果表明:RYL与AAY亲缘关系最近,同被聚类为翠菊黄化组(16Sr Ⅰ).  相似文献
7.
水稻橙叶病PCR检测体系的建立   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
利用植原体通用引物sP1和sP2,采用PCR法从发病的水稻植株中扩增植原体一段保守的16S rRNA基因的核苷酸序列. 结果表明,从发病的水稻植株中都能够稳定扩增得到1条558 bp的特异性条带. 对该条带进行克隆和序列分析表明,该片段和Genbank中公布的众多植原体的相应区域的核苷酸序列相似性都高达95%以上,表明利用植原体通用引物能有效扩增得到水稻橙叶病原的序列. 利用此引物并优化PCR反应条件,建立了水稻橙叶病的PCR检测方法. 该方法对检测水稻橙叶病具有特异、灵敏和有效性. 应用该检测体系检测从广东信宜、高州和从化采集的多份疑似标样,结果表明,在这几个地区均有水稻橙叶病的发生和危害.  相似文献
8.
香蕉束顶病毒基因附加组分的克隆及序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
采用PCR的方法分别克隆了香蕉束顶病毒(BBTV)广东分离物NS株系和NSP株系的附加组分,将之命名为BT-NS和BT-NSP.序列分析发现,2个附加组分基因全长均为1 094nt,其核苷酸的同源率为97.3%,编码氨基酸的同源率为98.4%;与BBTV台湾分离物附加组分S1、S2和越南分离物附加组分S3相比,BT-NS/NSP与S1的氨基酸序列相似率最高,与S2的相似率最低.每一附加组分的ORF均含有推导的与脱氧核苷酸结合的基序,具有潜在的复制酶活性.通过对BBTV编码复制酶基因组分的进化树分析发现,BT-NS/NSP与BBTV台湾附加组分S1的亲缘关系最近,与广东分离物NSP株系DNA组分1的亲缘关系较远.  相似文献
9.
转PRSV复制酶基因番木瓜食品安全性的初步评价   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
应用生物信息学的方法对转基因番木瓜进行实质等同性分析.将复制酶基因与多个数据库中的花生、大豆、坚果、牛奶、鸡蛋、鱼类、贝类和小麦等8类过敏源序列进行比对分析,结果未发现连续8个相同的氨基酸, 据此可初步认为转入的复制酶蛋白不是已知的致敏源.将复制酶基因进行原核表达,并纯化复性表达蛋白,再通过模拟胃肠液消化试验,结果发现纯化的变性蛋白与复性蛋白均能在15 s内降解,表明复制酶蛋白能在人的消化系统内降解,使人体发生过敏的可能性不大.通过液相萃取法,提取转基因与非转基因番木瓜中的一种内源毒物苄基异硫氰酯(benzyl isothiocyanate,BITC),将浓缩后的样品进行气相色谱分析,结果表明BITC的含量在转基因与非转基因番木瓜中差异不显著.  相似文献
10.
VIGS介导的转复制酶基因番木瓜对PRSV的抗性   总被引:1,自引:1,他引:0  
将PCR检测呈阳性的T4代转复制酶(replicase,Rep)基因番木瓜植株在苗期接种番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)Ys株系,定期采取不同部位的叶片进行Northern blot分析.结果表明:接种PRSV之前,在植株的各部位均能检测到转基因完整的Rep mRNA,但接种后不同时间在接种叶以上部位陆续出现了Rep mRNA的降解;接种后30 d内,接种叶下部第1片叶上始终未出现Rep mRNA的降解;另外,在发生mRNA降解的叶片上都能相继检测到小分子干涉RNA(short interferring RNA,si RNA)的产生.这说明转基因番木瓜的抗病性与mRNA的降解及siRNA的积累有着密切的关系.这种抗性发生在转录后水平上,是由病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)介导产生的.  相似文献
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