江西铅山红芽芋芋病毒种类lncRNA测序鉴定及其序列分析

探究江西铅山红芽芋的主要病毒种类及其序列信息，为其脱毒苗培育提供依据。采用lncRNA测序技术确定江西铅山红芽芋的病毒种类，并利用RT-PCR技术、生物信息学分析软件和qRT-PCR技术进行病毒验证、序列分析和组织表达分析。江西铅山红芽芋检测到芋花叶病毒（DsMV）和花椰菜花叶病毒（CaMV）两种病毒；DsMV和CaMV基因cDNA总长度分别为1780 bp和5412 bp，分别编码592和1803个氨基酸；DsMV和CaMV多聚蛋白二级结构均由α螺旋、β-片层、无规则卷曲构成，其三级结构均为单体蛋白；DsMV和CaMV在江西铅山红芽芋根、茎、叶中均有侵染，但均在叶中表达量最高。明确了侵染江西铅山红芽芋的主要病毒种类，并首次在江西铅山红芽芋上检测到CaMV。