水稻淀粉合成相关基因对稻米品质效应的研究

颗粒淀粉合成酶(GBSS)、淀粉分支酶1(SBE1)和淀粉分支酶3(SBE3)是淀粉合成过程中的3个关键酶,这3个酶主要由耽、Sbel、She3 3个基因控制.设计这3个基因位点的分子标记检测了183个水稻品种的基因型,分析了3个基因对稻米理化品质和RVA谱特征的效应.结果表明:3个分子标记均能很好的区分3个位点上等位基因的籼梗来源,根据3个位点的基因型可将183个品种分为8种类型;单个基因遗传效应分析表明,不同基因型品种间淀粉的理化特性(AC、GC、RVA)存在显著或极显著差异,3个基因的联合效应在不同基因型组合间也存在显著的差异.Wx基因对大多数品质性状效应显著,Sbe3效应次之,Sbel效应较小;Sbel和Sbe3基因在不同的Wx等位基因背景下,对稻米的品质的理化特征的效应不同.3基因间存在互作效应,Wx与Sbe3的互作效应较大.     

拟南芥和水稻cystatin基因家族的生物信息学分析

利用已经分离的植物半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因家族的成员进行分析;同时利用这些基因编码的蛋白质序列构建系统发生树,并对这些蛋白序列的保守序列进行分析;最后在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列。结果表明:1结合结构域的鉴定、多序列联配以及MEME分析最终确定了7个拟南芥和11个水稻的cystatin基因。2系统发生分析表明,cystatin基因的基本特征很可能是在拟南芥和水稻的分离之前就已经形成。3 cystatin结构域在蛋白质间高度保守。4拟南芥和水稻的cystatin基因主要在花、叶、根、种子和愈伤组织中表达,这有助于植物避免昆虫的侵害。     

基因组水平上拟南芥和水稻mrs2基因家族的比较系统发生分析

mrs2（mitochondrial RNA splicing2）基因是植物线粒体中Ⅱ类内含子自我剪接缺陷的抑制基因，同时参与了植物中镁离子的运输。本研究利用已经分离的植物的mrs2基因，鉴别出MRS2结构域，同时对拟南芥和水稻中的mrs2基因家族的成员进行了鉴定；利用这些基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树，并进行了序列保守性分析，最后查找了相关基因的EST表达信息。结果表明：①系统发生分析表明拟南芥和水稻的mrs2基因的结构在拟南芥和水稻分离之前已经形成，并在分离之后按照物种特异性的方式进行了扩张；②MEME分析表明植物的Mrs2蛋白质具有高度保守的基序，并且在蛋白质中的排列顺序也大致相似；③mrs2基因在拟南芥和水稻中的表达有差异，但在部分表达上仍保持了一致性。     

小麦穗发芽敏感性的配合力分析

为了探讨冬小麦穗发芽敏感性的遗传特点，并为小麦的抗穗发芽育种提供科学依据，对穗发芽敏感性不同的4个红皮和3个白皮小麦品种进行完全双列杂交，并对杂交材料进行配合力分析。结果表明，小麦收获前穗发芽性受加性效应、非加性效应和细胞质效应的共同影响，说明小麦的穗发芽抗性能够稳定地遗传给后代；小麦穗发芽敏感性的广义遗传力和狭义遗传力都比较高，说明小麦的穗发芽性主要受遗传因素决定。所以在穗发芽抗性育种中，早代选择是有效的。     

10个小麦品种(系)的产量与主要农艺性状的相关分析

以扬麦158为对照,对引进和选育的10个品种(系)进行品比试验研究。结果表明:品种间产量存在极显著差异,其中,YD249产量最高,比对照扬麦158增产23.3%。对9个主要农艺性状进行了测定,发现每穗小穗数、公顷穗数、每穗粒数和千粒重对产量的影响较大。     

公选课《常用统计软件的应用》教学改革实践

学生应用能力的培养是现代教育教学模式改革的重要任务。在高校开设《常用统计软件的应用》公共选修课对促进大学生的科研素养具有非常重要的作用。介绍了扬州大学农学院对该课程的教学改革的实践,从革新教学内容,选用自编教材,培养学生的兴趣,采用现代化教学方法和改革考核方式等方面入手,提高了教学效果。     

水稻基因组进化的研究进展

介绍了近年来在水稻基因组进化方面的研究进展,主要内容包括:水稻的核基因组至少经历了2次基因组复制过程,并从最初5条染色体形成了12条染色体;水稻籼粳两个亚种的分化估计发生在距今20～40万年前;在水稻驯化的研究方面,一方面克隆了一些控制重要驯化性状的基因,另一方面通过基因组分析发现了一些快速进化的基因组区段;片段复制、串联重复和逆转录转座等基因复制方式在水稻基因家族的物种特异性扩张方面起到了重要作用.通过整合以上研究成果,初步揭示了水稻基因进化的基本特点,为水稻功能基因组学和分子设计育种的进一步研究提供了新的切入点.     

玉米穗型和粒型性状的GWAS及其关联位点驯化和改良分析

以32份大刍草、68份玉米地方品种和来源广泛的294份玉米自交系为材料，在对294份玉米自交系进行简化基因组测序的基础上，采用GWAS方法对11个玉米穗型和粒型性状进行关联分析。结果表明，11个性状共检测到44个关联的SNP位点，其中，28个位点与6个穗型性状相关联，16个位点与3个粒型性状相关联。进一步整合32份大刍草和68份地方品种相应位点的序列数据，44个关联位点中共发现29个SNP在3类群体间共有。通过Fisher的精确检验发现，7个SNP的等位基因频率在大刍草到地方品种中发生了显著变化，14个SNP的等位基因频率在地方品种到自交系中发生了显著变化，3个SNP的等位基因频率则在大刍草到地方品种以及地方品种到自交系中均发生了显著变化，表明这些位点可能经历了驯化或/和人工改良。