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通过优化建立一套符合山溪鲵属物种环境DNA (environmental DNA,eDNA)分析的操作方法,为后期山溪鲵属资源调查及保护提供理论依据.以太白山溪鲵为研究对象,在室内养殖条件下,进行水样过滤及目标物种线粒体细胞色素b (Cytb)基因的扩增,根据测序序列构建系统发育树,来判定水样DNA中目标物种的归属.结果 表明:(1)通过酒精直接浸泡、锡箔纸包裹、唾液收集管收集这3种方法对过滤养殖水后的滤膜进行贮存,发现酒精直接浸泡法可增加后期eDNA的提取量;(2)在进行目的 片段的PCR扩增时发现高保真Mix的扩增成功率大于普通Mix;(3)应用属间特异引物进行不同物种扩增后,可通过系统发育分析来确定种间的分类.通过优化首次建立了山溪鲵属物种的水样eDNA分析方法,可为后期生活在相同水质且种间分化较小的物种进行eDNA分析提供参考. 相似文献
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三河口水库是"引汉济渭"工程的重要水利工程,工程位于陕西省汉中市佛坪县大河坝镇三河口村附近。2015-2017年,数次前往施工现场采集浮游生物标本,经鉴定分析,共检出浮游植物5门48种(属),其中硅藻门为优势种,共41种(属),其次是绿藻门4种(属),黄藻门、蓝藻门和裸藻门各占1种(属)。浮游植物密度范围1 125~5 500 cells/L,生物量范围为0.000 825~0.016 6 mg/L;浮游动物共有2门20种,其中原生动物门17种,为优势种群,轮虫类3种,浮游动物密度范围20~55 cells/L,生物量范围为0.000 4~0.032 mg/L。本研究为评价三河口水库工程建成后对汉江流域影响提供本底资料。 相似文献
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稻米淀粉RVA谱特征值与直链淀粉、蛋白含量的相关性及QTL定位分析 总被引:1,自引:1,他引:1
【目的】检测到新的控制稻米品质性状相关的QTL并分析各性状间的相关性,为了解控制水稻品质的遗传机理和培育优质水稻品种奠定基础。【方法】利用Sasanishiki×Habataki回交重组自交系(backcross inbred lines,BILs)群体在两个环境下种植的结果,检测与稻米直链淀粉含量、蛋白质含量及RVA谱特征值相关的加性QTL。【结果】表型分析结果显示,Habataki的蛋白含量明显高于Sasanishiki;而除消减值以外其余的稻米品质性状指标,Sasanishiki均高于Habataki。利用BIL群体共检测到加性QTL 42个,其中10个QTL位点在2个环境中均能被检测到,即q PC8、q AC4、q AC10、q PKV2、q PKV7、q HPV7、q CPV1、q BDV4、q BDV7、q SBV7,且q CPV1、q BDV4、q PKV7、q HPV7和q AC10等5个QTL尚未见报道。同时,我们还利用Sasanishiki×Habataki染色体片断置换系(Chromosome segment substitution lines,CSSLs)验证了10个稳定表达的QTL位点。【结论】稻米RVA谱特征值与直链淀粉含量、蛋白质含量之间呈现一定相关性,且控制不同品质性状的QTL之间具有共定位现象。 相似文献
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