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将11个华北型黄瓜杂交种F1代进行基于Illumina HiSeq X10平台的全基因组重测序,测序深度10X。样本基因组DNA采用单株混合提取和混池二代测序。对测序原始数据经过数据质控获得有效读长基础上进行了二次筛选。最终在684 891个SNP变异信息中筛选出381个变异位点,其中的180个为位于核染色体组上的变异(166个SNPs,14个InDels变异)。使用Minimal marker对SNP位点进行三位点组合选择,挑选出可区分参试品种的25个非重复SNP位点,35种三位点组合,涉及基因组1~6号染色体。最后选择10个在5’和3’侧翼序列50bp内无过滤过变异的候选位点,用于PCR扩增验证。得到7个高质量SNP,包括:Chr1_14433374,Chr3_24329128,Chr3_32823086,Chr3_33307511,Chr5_1548305,Chr5_6143567和Chr5_26188907。采用KASP基因分型技术验证,这7个位点的分型结果与二代测序结果吻合。 相似文献
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针对目前黄瓜各种真菌性病害、细菌性病害和病毒性病害高发的现状,对天津地区黄瓜病害的发生情况进行田间观察,并运用试纸条法、PCR法及RT-PCR法对黄瓜种子和叶片样品进行检测。结果表明:田间观察发现,天津地区黄瓜病害主要有细菌性病害、真菌性病害及病毒性病害,其中真菌性病害最为普遍,褐斑病、白粉病、霜霉病多发;试纸条法在30份黄瓜品种种子样品中检出种传病害瓜类细菌性果斑病病原(Aac)1份,在11份叶片样品中检测出黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)和烟草花叶病毒(TMV)各1份;PCR法在30份种子样品和2份疑似病害叶片样品中有3份种子样品检出细菌性角斑病;RT-PCR法在30份种子样品和6份疑似病害叶片样品中有1份叶片同时检出黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)和烟草花叶病毒(TMV)。 相似文献
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植物广谱抗性反应中,特定的抗性基因通过细胞信号转导高度表达。应用图位克隆、转座子标签、微卫星标记等技术从一些主要的经济作物和园艺植物中定位和克隆了大量抗性基因。R蛋白是一类重要的Pr类蛋白,往往具有若干相似结构域,R蛋白结构和序列分析对抗性基因家族分类、抗性信号转导机制研究有重要意义。Avr基因研究的成果进一步证实了“基因对基因”学说。根据抗性细胞信号转导机制的研究,发展形成了激发子一受体学说、细胞防卫学说等一些新的植物抗性机制假说。目前已有十几种动植物、微生物的外源抗性基因应用于转基因植物研究中。 相似文献
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