基于线粒体cox1、nad1和rrn L基因探讨马圆线科线虫间的亲缘关系

为探讨马圆线科线虫（圆线亚科和盅口亚科）间的亲缘关系,对长伞杯冠线虫（Cylicostephanus longibursatum）、冠状冠环线虫（Coronocyclus coronatus）、细口杯环线虫（Cylicocyclus leptostomus）、拉氏杯口线虫（Poteriostomum ratzii）、麦氏副杯口线虫（Parapoteriostomum mettami）和无齿圆形线虫（Strongylus edentatus）6种线虫的线粒体cox1、nad1和rrnL基因进行扩增,与同科相关线虫进行比较分析。然后以线粒体cox1、nad1和rrnL串联序列为标记基因,采用贝叶斯法（Bayesian inference,BI）构建进化树来探讨圆线科线虫间的亲缘关系。结果显示,研究中6种线虫的cox1序列长度均为1 578 bp,nad1的序列长度除无齿圆形线虫为879 bp外,其余均为873 bp,rrnL序列长度均不同,大小为959～980 bp。6种线虫的cox1、nad1和rrnL的AT含量分别为67.55%～69.71%、71.36%～73.83%和80.88%～...     

楔形前殖吸虫核糖体全序列的特征分析

楔形前殖吸虫(Prosthogonimus cuneatus)是禽类和鸟类输卵管、法氏囊和直肠常见的寄生虫之一,对禽和鸟类危害较大.利用PCR对楔形前殖吸虫核糖体全序列进行了扩增,并探讨了其与其他吸虫的进化关系.结果发现,楔形前殖吸虫核糖体全序列长10 713 bp,其中18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S、I...     

华支睾吸虫副肌球蛋白功能区基因的序列分析及B细胞抗原表位预测

为了阐明华支睾吸虫副肌球蛋白(paramyosin,Pmy)的生物学特性,试验对其功能区的C段(PmyC)基因进行克隆、序列分析及B细胞抗原表位预测,采用TRIzol法提取华支睾吸虫成虫的总RNA,将其反转录成cDNA,再利用PCR方法对PmyC基因进行扩增,将其连接到pMD 18-T载体上进行克隆、测序,并利用DNAStar软件进行序列分析,同时利用生物学软件DNAStar 5. 0对B细胞抗原表位进行预测。结果表明:该虫体PmyC序列长度为903 bp,A+T含量为52. 6%,与NCBI上的华支睾吸虫囊虫幼、麝后睾吸虫、卫氏并殖吸虫和日本血吸虫核苷酸序列的同源性分别为99. 4%、94. 0%、75. 0%和71. 1%。蛋白二级结构预测显示,PmyC蛋白主要由8个α-螺旋、2个β-折叠和3个β-转角构成。B细胞抗原表位预测显示,在该蛋白中有2个B细胞抗原表位。说明华支睾吸虫副肌球蛋白(CsPmy)具有成为抗原分子的潜能。