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牦牛新鲜囊胚与玻璃化冻融囊胚转录组的比较分析   总被引:2,自引:1,他引:1  
旨在探讨牦牛在囊胚玻璃化冷冻前后转录组差异表达,明确玻璃化冷冻对牦牛囊胚基因表达谱的影响。采用体外受精生产的牦牛新鲜囊胚和玻璃化冻融囊胚为研究对象,分别提取总RNA,使用Smart-seq2方法进行扩增、构建文库、转录组测序(RNA-seq),以|log2(冻胚/鲜胚)|≥1和Q0.05为阈值筛选差异表达基因(DEG),并对DEGs进行GO功能富集和KEGG分析。结果表明,冷冻前后牦牛囊胚中分别检测到9 827和13 567个转录本。在两个文库共筛选出11 174个DEGs,其中有7 037个在冻融囊胚上调,4 137个下调。有10 538个DEGs显著富集(P0.05)到479条GO terms上,共涉及318条通路,其中真核生物的核糖体合成、剪接体和神经活性配体-受体互作等8条通路显著富集(P0.05)。本研究利用RNA-seq技术分析了牦牛囊胚在玻璃化冷冻前后转录组变化,为探讨牦牛囊胚冷冻损伤机制及进一步完善冷冻方法提供理论依据。  相似文献   
2.
为了研究山羊RF酰胺相关肽(RFRP)与繁殖性状的相关性,试验采用RT-PCR技术和q PCR技术对山羊RFRP c DNA进行克隆、序列分析和组织表达研究。结果表明:金堂黑山羊RFRP基因编码区全长537 bp,编码179个氨基酸; RFRP基因编码区核苷酸序列与山羊、绵羊、牛、野猪、人、褐家鼠和小鼠的同源性为72. 5%~100%;利用NJ法以序列编码区构建物种间分子系统进化树,聚类结果符合动物学分类结果。常年发情的多羔金堂黑山羊垂体RFRP基因表达量显著低于季节性发情、单胎藏山羊(P0. 05),但其他组织的表达量在品种间无显著差异(P0. 05);垂体和卵巢中RFRP基因表达量显著高于子宫和输卵管(P0. 05)。说明RFRP可能是影响山羊季节性发情、排卵活动的重要因素之一。  相似文献   
3.
【目的】明确岷山主峰雪宝顶(海拔 5 588 m)及其周边地区自然地域范围。雪宝顶及其周边地区是叠加了山地生态系统和岩溶生态系统双重脆弱性的西南山区典型代表区域,但该区域在前人研究中无统一确定范围。【方法】运用 ArcGIS 软件水文分析模块提取雪宝顶小流域单元,将其和该区域地质构造、钙华资源、地形地貌和植被区划进行空间叠加分析得到雪宝顶流域边界,并以小流域为研究单元对研究区生态、社会经济因子空间分布特征进行初步分析。【结果】雪宝顶流域地理位置为103°25''59"~104°17''12"E,32°26''11"~33°28''51"N,总面积约 6 988.97 km2,共计覆盖 3 个县 29 个乡镇。【结论】研究区小流域面积为10~30 km2 的个数最多,3~10 km2 的次之,类型以坡面型为主;研究区受自然因素影响较强,受人类活动影响则相对较不明显,其北部白河河谷周边地区和东南部涪江河谷周边地区均具有坡度大、降水强和人类活动强度高的特征,需注意涵养水源、预防地质灾害。  相似文献   
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