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为了明确PCR产物直接测序与克隆后测序结果的差异,验证PCR产物直接测序的“准确性”,将从两个规模化猪场采集的组织样品(A、B)PRRSV ORF5 PCR阳性扩增产物胶回收后连接至pMD19-T载体,分别取15个阳性亚克隆单菌落,同原始PCR产物进行测序,对两个样品各获得的16条序列进行比对分析。结果显示:A、B两组样品16条序列间的核苷酸同源性分别为84.2%~100%、87.4%~100%,PCR产物与其15个亚克隆测序获得序列的核苷酸同源性分别为87.7%~97.3%、87.9%~100%。遗传演化分析方面:样品A序列与其亚克隆序列被划分在谱系1、5、8,占比分别为6.25%、87.50%、6.25%,与其12个亚克隆序列同属于谱系5;样品B与其亚克隆序列被划分在谱系5、8,占比分别为68.75%、31.25%,与其10个亚克隆序列同属于谱系5。结果表明,同一样品中PRRSV ORF5序列具有多样性,不同样品的PRRSV ORF5序列丰富度不同。结果提示,在生产实际中,通过PCR对PRRSV ORF5产物进行直接测序,对于了解场内流行毒株具有一定的指示意义。 相似文献
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本试验旨在研究添加复合益生菌对猪生长性能、腹泻率、肠道菌群和代谢物和猪舍氨气浓度的影响。试验1:从1 000头猪中挑选体重[(15.5±0.5) kg]相近的猪40头备用,将剩余的960头猪根据体重和性别平均分在2组(每组16个重复,每个重复30头),分别放在2个栋舍中监测氨气浓度,对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂添加复合益生菌(主要成分是枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌和酿酒酵母等)的试验饲粮。每个栋舍再随机挑选平均体重[(15.5±0.5) kg]接近的3栏猪(3个重复,每个重复30头)观察猪腹泻情况。试验期30 d。试验2:将试验1中挑选出的40头猪在另一个栋舍中随机分为2组(每组4个重复,每个重复5头)对猪只料重比、肠道菌群及代谢物进行研究。试验期30 d。结果表明:与对照组相比,添加复合益生菌能显著提高平均日增重(P<0.05),显著降低料重比和室内氨气浓度(P<0.05);添加复合益生菌组肠道菌群的α多样性指数中Shannon指数显著提高(P<0.05);物种差异判别分析(LEfSe)发现,瘤胃菌科的相对丰度显著上升(P<0.05);代谢组学KEGG通路富集... 相似文献
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