Hapseeker:一个分析单倍型的C++程序(英文)

The C++ program: Hapseeker was developed to analyze DNA or RNA sequence, besides, Hapseeker could be used to identify haplotype, calculate frequency of each haplotype as well as find variable site quickly. Moreover, Hapseeker had many advantages such as simple operation, rapid running speed and high accuracy.     

Hapseeker：一个分析单倍型的C＋＋程序

开发了一个C＋＋程序——Hapseeker对DNA或RNA序列进行分析。Hapseeker能够鉴定单倍型并统计每种单倍型的频率,快速找出变异住点。具有操作简单、运行速度快、结果准确可靠等优点。     

植物的杂交起源及研究进展

结合分子标记技术的发展历程,概述了植物的杂交起源,其次介绍了目前和过去鉴定杂交物种所使用的方法,综述了植物杂交所造成的基因渗入、遗传变异和重组、基因流、适应性进化、自然选择和“固化加强”作用及其在形成新物种过程中的作用和影响等。     

Hapseeker：一个分析单倍型的C＋＋程序

Hapseeker（Haplotypes Seeker）,即单倍型搜索者,具有辨别单倍型、统计单倍型频率、发现变异位点等功能。Hapseeker能够在Windows、UNIX／Linux操作系统下跨平台运行,具有操作非常简单、运行速度快和需求电脑配置低等特点。在Windows系统下只需要双击Hapseeker．exe．即可运行并自动保存运算结果;而UNIX／Linux系统下,在终端输入命令．／Hapseeker则可运行。Hapseeker被设计用于处理DNA序列或RNA序列,甚至也可对氨基酸序列做类似分析,其输入文件的格式为常用的Fasta格式（序列用Clustal或Mega比对之后另存为Fasta格式即可）。读者通过email：pingchen09@gmail．com联系可以免费获得程序以及详细说明文档,如有需要还可提供源代码。笔者用标准C＋＋语言编写了一个程序——Hapseeker对DNA或RNA序列进行分析。经及复验证,Hapseeker能够鉴定单倍型并统计每种单倍型的频率,快速找出变异位点,具有操作简单、运行速度快,结果准确可靠的优点。