甘肃省4种苹果病毒检测及其分子多样性分析

为明确甘肃省苹果产区苹果茎沟病毒（Apple stem grooving virus,ASGV）、苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid,ASSVd）、苹果褪绿叶斑病毒（Apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV）和李属坏死环斑病毒（Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV）4种病毒发生和分布情况,以及主要病毒的遗传多样性,采用RT-PCR技术进行鉴定,并对主要病毒cp基因片段测序分析。结果表明：在甘肃省5个市（县）苹果产区随机采集的93份叶片中,ASGV平均检出率达87.1%,ASGV成为危害甘肃省苹果的优势种,各苹果产区ASSVd、ACLSV和PNRSV平均检出率分别为41.9%、10.7%和11.8%,天水和兰州市4种苹果病毒检出率均高于其他地区;所有检测样品以“ASGV+ASSVd”为主要复合侵染类型,检出率达37.6%;4条ASGV cp基因片段的系统发育分析显示,4个分离物被聚在同一亚组,来自天水的分离物A29与来自中国云南苹果的ML-1分离物（JN871586.1）聚在同一支,与其核酸序列同源性为99.2%,A39与A42聚为一支,两者与来自中国陕西苹果的YL06分离物（EU236258.1）核酸序列同源性为97.1%和96.9%,A80与A39和A42共聚为一簇。