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1.
2.
为探讨屎肠球菌自溶状态下基因表达变化,利用高通量测序技术进行RNA-Seq分析。差异基因分析显示,自溶状态下共有783个基因表达出现差异,其中在自溶状态下上调和下调的基因分别为689和94个。GO功能聚类分析显示,差异基因主要富集在细胞、细胞组分、生物合成、有机物质生物合成几个方面。KEGG富集分析发现,差异基因主要参与了核糖体、氨基酰基-tRNA生物合成、嘌呤代谢、肽聚糖生物合成、嘧啶代谢、同源重组、氨基酸合成等通路,且下调的差异基因主要富集在碳代谢、糖酵解/糖异生、丙酮酸代谢等能量代谢相关通路。说明屎肠球菌自溶状态下代谢出现了明显改变,对碳源的利用不足和合成能力的下降可能是导致屎肠球菌自溶发生的重要原因。通过分析屎肠球菌自溶状态下基因的表达情况,得到了充分的基因数据,为进一步研究屎肠球菌的自溶发生机制提供了基础。
[关键词] 屎肠球菌|自溶|转录组|差异表达基因|GO功能 相似文献
3.
4.
通过RACE技术从花生叶片cDNA中克隆到了UDP-glucosyltransferase基因,命名为AhUGT83A1-like (Genbank注册号为KF411463)。该基因全长为1 530bp,ORF为1 380bp,编码460个氨基酸。序列比对与进化分析结果表明,该序列有保守的UDPGT结构域,并且与其它植物的UGT蛋白同源性较高。荧光定量PCR结果表明,AhUGT83A1-like基因在高盐和低温处理的花生根和叶片中均上调表达;在干旱处理时,根中表达也受到显著上调,但叶片中表达量则有明显下降。以上结果表明AhUGT83A1-like可能参与了花生对干旱、低温和高盐的抗性调控。ABA处理结果表明,AhUGT83A1-like在花生根中对ABA响应明显,但在叶片中对ABA没有明显响应,表明该基因在花生根中对非生物胁迫的调控可能是以依赖ABA的方式发挥作用的。? 相似文献
5.
溶血磷脂酸酰基转移酶在植物油脂合成途径中具有重要的作用.本研究通过构建花生种子全长cDNA文库,结合大规模EST测序和RACE克隆等方法,从花生中克隆得到了三个LPAT基因,分别命名为AhLPAT2,AhLPAT4和AhLPAT5.其中AhLPA72全长为1626bp,ORF为1164bp,理论分子量为43.2 kD,理论等电点为9.42;AhLPAT4全长为1618bp,ORF为1152bp,理论分子量为43.9 kD,理论等电点为9.23;AhLPA T5全长为1911bp,ORF为1137bp,理论分子量为43.7 kD,理论等电点为8.99.它们推导的氨基酸序列与拟南芥的同源性依次为78%,65%和65%;与大豆的同源性分别是82%,80%和82%.将这三个基因在GenBank上注册,注册号分别为JN032677,KC160499,KC160500. 相似文献
6.
不同石砾条件对土壤水分入渗的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
运用室内人工模拟的方法,对黔中喀斯特地区几种不同配比的白云岩土石混合样进行了土壤水分入渗的试验。结果表明:(1)石砾含量和砾径的增加均能加速土壤湿润峰下移速率。(2)容重较大(1.3 g/cm3)的土样土壤湿润峰下移速率和渗透系数高于容重较小(1.1 g/cm3)的土样;但当石砾含量为80%时,容重对土壤水分渗透系数的影响差异不显著。(3)在砾径为2~3 mm、3~5mm时,石砾含量与土壤渗透性能呈正相关趋势。但砾径为5~10 mm时,除了80%石砾含量的土样下渗曲线明显较高以外,土壤容重和石砾含量对土壤渗透性影响差异较小。 相似文献
7.
采用高效液相色谱法(HPLC),分析商洛种植的2年生桔梗根不同部位(须根、木质部和韧皮部)及不同月份(5—11月)中桔梗皂苷D的含量变化,以探究主要次生代谢产物在桔梗根中积累量的变化。结果显示,在5—11月期间,桔梗皂苷D含量在须根和木质部中稳步增加,二者分别在9,11月份达到最大值,而韧皮部中则变化不大,10月达到最大值;不同部位桔梗皂苷D平均含量大小为须根(0.410%)>韧皮部(0.182%)>木质部(0.039%)。建议商洛地区所种植桔梗采收期在10—11月,采收时须根要充分收集。研究结果可为确定商洛桔梗采收期以及为桔梗质量控制及规范化种植提供借鉴。 相似文献
8.
采用高效液相色谱法(HPLC)分析商洛种植的两年生桔梗(Platycodon grandiflorum)茎和叶在不同月份(5—10月)中桔梗皂苷D的含量变化,以探究主要次生代谢产物在桔梗茎叶中积累量的变化。结果表明,5—10月桔梗皂苷D的含量在茎中比较稳定,9月份达到最大值;而叶中桔梗皂苷D含量在7—8月份含量较高,10月份含量急剧下降;叶中桔梗皂苷D平均含量(0.614%)大于茎中(0.257%),表明商洛地区所种植桔梗幼嫩茎叶也可入药,其采收期应在8月份。通过对不同月份及茎叶中桔梗皂苷D含量的研究,可为确定商洛桔梗入药部位及采收期提供参考,同时也可为桔梗质量控制及规范化种植提供借鉴。 相似文献
9.
本文根据文献及NCBI中已收录的植物糖基转移酶(GT, Glucosyltransferase)序列,选取了红景天(Rhodiola sachalinensis)等16种植物的糖基转移酶序列,利用生物信息学软件分别对其组成及理化性质、信号肽和二级结构等进行预测和分析。结果表明,这16种植物糖基转移酶核苷酸序列长度均在1 000 bp到2 000 bp之间,含量最丰富的氨基酸为Leu、Gly、Val、Ser和Ala等,其中,桉树、北柴胡、滇牡丹、蒺藜苜蓿、毛白杨、七彩虹叶、蔷薇和红景天糖基转移酶属于稳定类蛋白,其余为不稳定类蛋白;16种植物中,只有红景天糖基转移酶序列有信号肽;糖基转移酶蛋白二级结构均由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角组成,且α-螺旋和无规则卷曲为主要结构。综合三种不同分析工具对16种植物中糖基转移酶的研究表明,糖基转移酶蛋白特性差别不大,显示糖基转移酶具有较高的保守性和稳定性。本文对糖基转移酶的生物信息学分析,可为研究糖基转移酶酶学特征及三萜皂苷代谢提供帮助。 相似文献
10.
吉木乃县是全疆地表水资源最少的干旱贫水县,亦是阿勒泰地区最缺水的县,水资源匮乏已成为影响县域经济社会发展的"瓶颈"。通过分析论证,萨吾尔山区云的厚度和含水量呈上升趋势;降水天气过程多,年有效降水过程可达56次;降水日数多,山区月最多降水日数达20 d;同时地形云资源丰富,年降水量平均达300~500 mm,是开展人工影响天气作业条件最佳区域,人工增水潜力巨大。在萨吾尔山区进行空中云水资源开发,既是缓解水资源供需矛盾的长远之计,也是改善保护脆弱生态环境的有效措施。对于吉木乃县经济可持续发展、脱贫攻坚及后续巩固具有重要的现实意义。 相似文献