基于转录组分析的九种苍耳分子标记筛选和鉴定

为实现我国非重要的检疫性杂草——苍耳属Xanthium杂草快速高效的分子鉴定,利用Illumina二代测序平台对白苍耳X.albinum、意大利苍耳X.italicum、直刺苍耳X.ripicola、刺苍耳X.spinosum、柱果苍耳X.cylindricum、宾州苍耳X.pennsylvanicum、蝟实苍耳X.echinatum、苍耳X.sibiricum和北美苍耳X.strumarium共9种苍耳属杂草进行转录组测序,获得的unigene序列数分别为103 362、93 506、87 452、83 822、70 994、66 397、57 598、57 164和57 134个。利用生物信息分析方法对9种苍耳属杂草转录组进行简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）和物种间的特异性序列预测和筛选。经过PCR试验验证,筛选获得了可以有效鉴定上述9种杂草的6对SSR引物和13对特异性引物,提高了苍耳属杂草鉴定的准确率。     

不同采气方法对六氟化硫示踪法测定肉牛甲烷排放量的影响

为研究不同采气方法对六氟化硫示踪法测定牛甲烷(CH4)排放的影响,试验选取18头6月龄夏洛来杂交牛作为研究对象,随机分成A、B、C三组,每组6头(实际采样时每组随机选用牛头数为5头),饲喂相同日粮,采用六氟化硫(SF6)示踪技术测定牛CH4排放量。A组为对照组,使用牛扼法采气;B组和C组采用定时定点法采气,B组每2h采集1次,采集24h;C组每1h采集1次,采集12h(每天10∶00~22∶00),连续采样5d。试验期30d。结果表明:三组测得的CH4排放量差异不显著(P0.05)。采样期内三种采气方法所测得CH4排放量变化趋势基本一致。因此,可根据试验需要采用定时定点采气法测定牛CH4排放量。     

寄生蜂细胞色素P450基因家族进化分析

寄生蜂是重要的天敌昆虫，被广泛应用于生物防治，但在实际生产应用中面临诸多问题，如环境适应性和耐药性问题。细胞色素P450是真核生物中广泛存在的超基因家族酶系，参与农药、植物次生代谢物及环境有害物质等的代谢，同时也参与昆虫体内多种内源性化合物的合成与代谢。本文通过对植食性榕小蜂和9种寄生蜂基因组数据的生物信息学分析，共获得615个P450基因，分析表明不同寄生蜂P450基因家族的差异主要发生在CYP3和CYP4簇，而CYP2和Mito簇相对保守；相较于外寄生蜂，内寄生蜂的P450超基因家族有明显的收缩现象；此外，发现了2个在寄生蜂中1：1：1高度保守的P450基因，CYP18和CYP314，以及茧蜂特有的CYP304基因和内寄生蜂特有的CYP28基因。本研究从基因组水平系统地分析了寄生蜂P450超基因家族的进化，为寄生蜂的遗传改良和规模化饲养等提供理论基础。     

影响反刍动物氮素利用效率和排放的营养实践

涉及奶牛生产系统和粪肥应用的总氨氮排放参数是影响农业源氨氮排放的最敏感的参数,如何通过精细饲养来提高奶牛的氮素泌乳转化效率,降低奶牛生产系统的氮素排放,对于缓解奶牛生产系统面临的经济与环保双重压力具有重要意义。本文从饲粮的氮素水平、碳水化合物类型、氨基酸补饲、饲料添加剂、饲粮精粗比以及新型饲料原料等方面对影响反刍动物氮素排放的研究进行了综述,同时介绍了康奈尔净碳水化合物-蛋白质体系(CNCPS)模型及其改进对奶牛场氮排放估测的影响以及尿素转运蛋白对反刍动物氮素代谢的影响。     

LncRNA在柑橘木虱与黄龙病病原菌互作中的差异表达分析及验证

为明确柑橘黄龙病的唯一自然传播媒介——柑橘木虱Diaphorina citri的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是否参与调控黄龙病病原菌Candidatus Liberibacter asiaticus(CLas)的侵染及复制,采用生物信息学预测及PCR扩增方法进行lncRNA的预测、特征分析、验证及差异表达分析。结果显示,柑橘木虱的13个转录组RNA-Seq数据中共有10 192个lncRNA基因,对应15 747条lncRNA转录本;与蛋白质编码基因相比,柑橘木虱lncRNA具有更少的外显子数量和更短的转录本长度;随机选取的10条lncRNA基因中,有7条lncRNA基因在无菌柑橘木虱广州品系或赣州品系中有表达,其中1条lncRNA基因TCONS_00034665在无菌广州品系和无菌赣州品系中存在差异表达;带菌和无菌柑橘木虱成虫中预测获得2个差异表达的lncRNA基因TCONS_00096118和TCONS_00234564,实时荧光定量PCR验证发现TCONS_00234564与预测结果一致,在带菌柑橘木虱成虫中高表达。表明lncRNA参与了黄龙病病原菌与寄主柑橘木虱的互作。     

两株茶尺蠖核型多角体病毒毒株对灰茶尺蠖的毒力及基因组差异

为明确茶尺蠖核型多角体病毒（Ectropis obliqua nucleopolyhedrovirus,EcobNPV）毒株对灰茶尺蠖E.grisescens的毒力差异及其机制,以前期筛选获得的高效毒株EcobNPV-QF4和原始毒株EcobNPV-QV为研究对象,采用PCR扩增技术对其进行分子鉴定,通过叶盘法毒力生测试验测定毒力差异,并用定量PCR技术比较病毒拷贝数及基因组测序方法分析基因组差异。结果表明,EcobNPV-QV经分子鉴定存在3个基因型,而EcobNPV-QF4则存在2个基因型,2株毒株的基因型存在差异;EcobNPV-QV和EcobNPV-QF4对灰茶尺蠖的幼虫毒力分别为4.26×10⁶ PIB/头和9.72×10⁷ PIB/头,EcobNPV-QF4对灰茶尺蠖的毒力是EcobNPV-QV的22.8倍;饲毒0~48 h之间EcobNPV-QF4在灰茶尺蠖体内的增殖拷贝均显著高于EcobNPV-QV,EcobNPV-QF4比EcobNPV-QV具有更快的繁殖能力;比较2株毒株的基因组,EcobNPV-QF4比EcobNPV-QV长315 bp,与EcobNPV-QV相比EcobNPV-QF4基因组的hr1~hr3区域出现倒位,其中核苷酸还原酶小亚基基因在EcobNPV-QF4中重复1次,3个同源重复区的回文序列存在差异但2株毒株仍为α杆状病毒亚家族II亲缘种分离株。表明2株毒株的基因组在同源重复区的序列及回文个数间存在差异,推测这可能与导致其对灰茶尺蠖毒力差异有关。     

2023年新疆哈密市牛羊养殖场户布鲁氏菌病防控问卷调查

为了解哈密市畜间布鲁氏菌病(简称“布病”)各项防控措施落实情况,准确分析畜间布病防控工作中存在的短板、漏洞,采用问卷调查方式对牛羊布病阳性养殖场户的基本情况、饲养管理、生物安全措施及意识行为等展开调研。结果显示:布病阳性场户中存在代牧、混牧行为的占85.18%;购进申报率较低,购进后隔离的不足30%;圈舍进行过消毒占97.54%,消毒频次为1～2次/年的占50.23%;对流产物、粪污等污物进行无害化处理的占96.28%;有徒手接羔行为的占45.12%,有喝生奶习惯的占7.67%,自己屠宰牛羊的占84.21%,畜主感染过布病的占14.15%。结果表明:哈密市存在代牧混牧复杂、流通监管力度不够、基层动物防疫力量不足、从业人员防范意识不强等问题,建议采取加强顶层设计、强化检疫监管、落实净化措施、加大宣传告知力度等措施强化布病防控。