猪STAB2基因启动子的克隆及转录活性分析

旨在克隆和分析猪STAB2基因启动子及其转录活性。利用基因克隆、双荧光素酶报告基因系统以及生物信息学分析等方法,克隆得到了STAB2基因转录起始位点上游1 997 bp的候选启动子序列并对其序列特征进行了分析,同时,构建了不同长度的5'端缺失的重组载体并利用双荧光素酶报告基因系统分析了其荧光素酶活性,进而确定了STAB2基因的核心启动子区域及关键调控区域,并对关键调控区域内的转录因子及其结合位点进行了分析。结果表明:STAB2基因的候选启动子区域内包含4个核心启动子和1个Cp G岛;-309--39 bp为STAB2基因的关键调控区域,-1 045--309 bp可能存在一个正向调控元件,而-1 506--1 045 bp可能存在一个负向调控元件; STAB2基因的关键调控区域内包含72个转录因子结合位点,部分转录因子在这一区域具有多个结合位点,如Arnt∶∶Ahr、ZNF354C、Klf4和KLF5,并且,转录因子结合位点之间也存在重合区。为进一步研究猪STAB2基因的表达调控机制以及其在调控猪抗病和肌肉品质中的功能提供了理论依据。     

猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析

[目的]克隆猪EIF2S3基因mRNA全长,并进行生物信息学分析及检测其在猪各组织中的表达特征,为研究真核翻译起始因子2(eIF2)蛋白γ亚基的生物学功能打下基础.[方法]以荣昌猪胸腺mRNA为模板,采用RCAE-PCR克隆EIF2S3基因的mRNA全长序列,在线完成各种生物信息学分析后,利用实时荧光定量PCR分析猪EIF2S3基因的组织表达特征.[结果]猪EIF2S3基因mRNA全长1813 bp,其中蛋白质编码区(CDS)长1419 bp,5'UTR区、3'UTR区分别长14和380 bp,编码472个氨基酸.EIF2S3蛋白分子量51.1 kD,理论等电点(pI)8.62,包含58个带正电的氨基酸和52个带负电的氨基酸,其前体蛋白靠近N端区域有一个强疏水区;EIF2S3蛋白的空间结构由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成.EIF2S3蛋白氨基酸序列与狗和大白鼠的相似性最高(99.6%),其次是马、猫、牛、羊和人类(99.4%),与斑马鱼的相似性最低(96.6%).EIF2S3基因在猪的心脏、胸腺和淋巴组织中表达量较高,在脾脏和肌肉中呈中度表达,在肾脏中的表达量较低,而在肝脏中基本不表达.[结论]猪EIF2S3基因全长1813 bp,在核酸和氨基酸水平上与其他物种的EIF2S3基因高度同源,尤其与狗和大白鼠的遗传距离最近;其在猪心脏、胸腺和淋巴组织中的表达量较高,在肝脏中基本不表达,据此推测EIF2S3参与合成的蛋白更多地参与心脏泵血和免疫相关功能,基本不发挥能量代谢功能.     

湿热环境中温度和风速对妊娠母猪血清生化指标的影响

【目的】本研究旨在研究湿热环境中不同温度和风速对妊娠母猪的相关生化指标的影响。【方法】本实验选取年龄、体重相近、身体健康的妊娠母猪共20头,饲养于水帘风机猪舍,分别测定不同风速区间、温度中猪只的皮质醇(Cortistatin,CORT),丙二醛(Malondialdehyde,MDA),热应激蛋白70(Heat Shock Protein 70,HSP70)水平。【结果】风速、温度以及二者的互作效应能显著影响妊娠母猪血清中CORT的浓度(P0.05);血清中MDA和HSP70的浓度受到环境参数的显著影响,当温度超过等热区时,随着温度升高,血清中MDA和HSP70浓度显著升高(P0.05),风速对这二者的影响不显著(P0.05)。【结论】该实验结果显示,在我国西南地区,湿热环境会影响猪只体内的生化指标,造成一定的热应激,合理的增强圈舍风速,降低舍内温度能够一定程度的降低妊娠母猪的热应激。     

荣昌猪、长白猪先天免疫候选基因筛选

旨在探究影响荣昌猪和长白猪机体先天免疫功能的候选基因.以新生荣昌猪、长白猪胸腺为研究对象,利用RNA-seq分析荣昌猪、长白猪胸腺组织中的差异表达基因,同时对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,并通过qRT-PCR验证RNA-seq结果的准确性.结果表明:在新生荣昌猪和长白猪胸腺中,差异倍数在2倍以上的基因共421个,其中,荣昌猪相对长白猪上调的有231个,下调的有190个.GO富集分析发现,这些差异表达基因主要富集在清道夫受体活性、G蛋白偶联受体结合、T细胞活化、细胞分泌调节、胞吐作用调节、SNARE复合物组装调节等生物学过程.KEGG通路分析发现,这些差异表达基因主要参与细胞因子-细胞因子受体互作、cAMP信号、代谢(磷脂酶D、半胱氨酸和蛋氨酸)及一些疾病(非洲锥形病、癌症)相关信号通路.6个差异表达基因的RT-qPCR结果表明,此次RNA-seq的结果准确可靠.综合差异表达基因、GO和KEGG信号通路结果发现,TMSB15A和STAB2、SAA1和HP分别是荣昌猪和长白猪胸腺先天免疫的候选基因.     

氯前列醇钠与卡贝缩宫素对荣昌猪和涪陵黑猪母猪分娩时间的影响

氯前列醇钠作为人工合成的前列腺素类似物被广泛的应用于诱导各种母畜的分娩。卡贝缩宫素作为一种具有长效特性的新型催产素类样分子,有望在母猪分娩过程中替代缩宫素起到收缩子宫启动分娩的作用。试验一主要对氯前列醇钠注射部位和剂量进行研究,将母猪随机分为自然分娩组(n=74)、2 mL肌肉注射组(n=52)、2 mL后海穴注射组(n=63)和1 mL后海穴注射组(n=57)。研究结果表明,2 mL后海穴注射组的母猪分娩时间上表现更为集中,产仔持续时间最短(228 min),白天分娩比例最高(90.48%)。说明通过调整母猪注射氯前列醇钠时间、剂量以及部位等因素能够一定程度的缩短母猪产仔时间,提高母猪白天分娩率。试验二主要对卡贝缩宫素(CBT)与氯前列醇钠的联合应用进行研究,试验将母猪随机分为自然分娩组(n=81)、氯前列醇钠注射组(n=70),CBT注射组(n=67),氯前列醇钠+CBT注射组(n=64)。研究结果表明,氯前列醇钠与卡贝缩宫素联合应用能够缩短母猪产仔持续时间(205 min),并且大幅提高母猪在白天工作时间分娩比例(95.31%)。     

合川黑猪保种群遗传结构及选择信号分析

旨在研究合川黑猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系、近交系数、家系结构和选择信号,以期更好地保护和利用合川黑猪这一遗传资源。本研究利用猪50K SNP芯片,对合川黑猪保种群内所含的58头健康成年种猪进行SNP检测;计算群体的有效含量、多态信息含量、多态标记比例、期望杂合度、观测杂合度、有效等位基因数以及最小等位基因频率,分析保种群体的遗传多样性;利用Plink软件构建状态同源(identity by state, IBS)矩阵和分析每个样本的连续性纯合片段(runs of homozygosity, ROH),Gamatrix(V2)软件构建基因组关系G矩阵,分析合川黑猪保种群的亲缘关系;利用Mega X(V10.0)软件进行群体聚类分析,研究合川黑猪保种群的家系结构;运用Tajima’s D和iHS方法分析合川黑猪群体基因组上受选择的信号区域,挖掘潜在的候选基因。结果表明,合川黑猪保种群体的群体有效含量、平均多态信息含量、多态标记比例、平均有效等位基因数、最小等位基因频率分别为4.2、0.156、0.534、1.38、0.141,说明合川黑猪保种群体的遗传多样性较丰富;群体的平均期望杂合...     

批次化管理对地方猪种繁殖性能的影响研究

批次化管理能够优化劳动力的配置,提高猪场生产效率。本文对地方品种母猪实施批次化管理前后繁殖性能进行对比研究,着重分析地方品种每批母猪受胎率、配种分娩率、总产仔数等指标。并着重对季节、胎次等因素母猪断奶后不在批次计划时间内发情配种的原因进行分析讨论,为地方品种批次化生产管理提供参考和借鉴。     

饮用温水对断奶仔猪的影响

断奶仔猪的保育工作是养猪生产过程中重要的环节,如何提高断奶仔猪的生长性能,提高保育工作效率是大量科研人员以及猪场工作人员的研究议题,但大量研究、探索都停留在对仔猪生存环境的改善方面,对仔猪饮水温度的关注相对较少,通过对断奶仔猪饮用温水对其生长性能、消化能力等方面的影响进行综述,以期对养猪生产工作者提供一些帮助。     

我国物联网猪场应用现状与发展趋势

随着科技的进步和发展，物联网技术在人类生产、生活中的应用愈加广泛。目前，我国养猪业处在转型升级的关键时期，生猪行业处在分散至集中的整合期，养殖场数量减少，养殖规模逐渐扩大，规模化、集约化水平显著提高，相较于传统养殖方式，物联网技术在猪场的应用能够减少劳动力成本、提高生产效率，在规模化养猪生产中具有十分重要的意义，近年来物联网技术在养猪生产过程中得到越来越广泛的应用。文章从猪只识别、环境控制、智能化饲喂、产品追溯以及生物安全防控等方面阐述物联网技术在我国规模化猪场中应用现状及发展趋势，以期为我国物联网猪场建设与使用提供一些帮助。     

基于SNP芯片的盆周山地猪群体选择信号分析

为了分析盆周山地猪群体的选择信号，本研究利用猪50K基因芯片，运用Tajima’s D方法分析盆周山地猪群体基因组上受选择的信号区域，并通过生物信息学分析筛选受选择的候选基因。结果表明，盆周山地猪群体基因组上受选择的区域有252个，这些区域共包含267个候选基因，其中，在猪上已注释的基因184个，如免疫性状相关基因MYO1G、CD86、IKF2，肉质性状相关基因PRKAG3、PRDM16、SND1，繁殖性状相关基因FSHR、LTF、AP3B1和生长性状相关基因SREBF2、SDC3、SLIT3。候选基因GO功能富集表明，这些基因参与了机体的免疫、行为、心管发育等生物学进程。KEGG信号通路分析发现，部分基因可能与催产素信号通路相关。本研究首次构建了盆周山地猪全基因组水平上的选择信号图谱，筛选了受选择的重要经济性状候选基因，研究结果为更好地保护、开发和利用盆周山地猪奠定了理论基础。