硒都黑猪AOPEP基因SNP筛选鉴定及其与肌内脂肪含量的关联分析

肌内脂肪（IMF）含量是影响猪肉风味的重要指标。本研究通过重测序方法筛选出影响猪IMF含量的SNP位点，并进一步利用SANGER测序法在硒都黑猪群体中筛选鉴定出猪AOPEP基因rs340610840、rs3470100435、rs34724762003个SNPs位点。通过关联分析发现这3个SNPs位点均与IMF含量显著相关，且3个SNPs位点紧密连锁，所构成的不同单倍型组合也与IMF含量显著相关。通过RNA稳定性分析发现，rs3470100435的C>A突变导致编码氨基酸由精氨酸变成甲硫氨酸，显著影响了AOPEPmRNA质心二级结构，且AOPEP蛋白与AGT、KRR1、LDLRAP1等10个蛋白存在相互作用。本研究发现了3个影响猪IMF含量的分子标记，且rs3470100435位点导致AOPEPmRNA二级结构发生变化，AOPEP可能与AGT和LDLRAP1蛋白互作，进而影响IMF性状。     

加系大白猪乳头数性状的全基因组关联分析

乳头数是母猪重要繁殖性状,影响断奶仔猪存活率。研究者对不同品种和品系的猪相继开展了乳头数性状相关数量性状座位(Quantitative Trait Locus,QTL)鉴定,但目前关于加系大白猪乳头数性状相关QTL的研究较少。本研究以944头加系大白猪群体为研究对象,对乳头数性状进行全基因组关联分析(GWAS)。GCTA软件计算左、右、总乳头数性状的遗传力分别为0.1、0.12、0.16。利用rMVP软件在SSC7上分别检测到4、1、4个与左、右和总乳头数基因组水平显著相关(P<1.26×10-6)的SNP,其中1个SNP位于SSC7的14.1 Mb,剩余3个SNP位于SSC7的97.6～102.0 Mb。在SSC3、SSC4、SSC6、SSC7、SSC9、SSC11、SSC13上分别鉴定到4、1、4、5、1、1、5个与乳头数性状潜在显著相关(P<2.52×10^-5)的SNP。进一步扫描25个显著相关SNP上下游200 kb位置处的基因,共获得84个候选基因,其中SSC7上获得39个候选基因,包括FAM71D、MPP5、EIF2S1、PIGH、ARG2...     

地中海奶水牛乳房形态结构与泌乳性能的关联分析

本研究通过分析不同胎次乳房性状之间的相关性以及乳房性状与泌乳性能之间的相关性,建立地中海奶水牛乳房线性性状的入选主成分评估模型,为培育具有优良乳房性状的高产奶水牛提供参考。收集意大利牧场123头地中海水牛共1 107条生产记录信息,利用SAS 9.2 CORR过程进行相关性分析,运用PRINCOMP过程建立入选主成分评估模型。结果表明,1~4胎时,270 d泌乳量随着胎次的增加而增加;在1~2胎时,前乳头长与后乳头长呈极显著正相关（P<0.01）;3胎及3胎以上时,前乳头长与后乳头长呈显著正相关（P<0.05）;1~4胎时,乳区面积与前乳头距、前后乳头距、后乳头距呈极显著正相关（P<0.01）,且前乳头距与后乳头距呈极显著正相关（P<0.01）;在≥ 4胎时,前后乳头距与泌乳量、乳蛋白量呈显著正相关（P<0.05）,并与乳脂量呈极显著正相关（P<0.01）,同时乳区面积与泌乳性能呈显著正相关（P<0.05）;在第1~2、4胎及以上时,泌乳量、乳蛋白量和乳脂量之间呈极显著正相关（P<0.01）,且在第3胎时泌乳性能之间呈显著正相关（P<0.05）。入选主成分评估模型为：Y=0.2631x1+0.1186x2+0.0862x3+0.0796x4+0.1039x5+0.0042x6-6.9689,式中,x1,前乳头长;x2,后乳头长;x3,前乳头距;x4,前后乳头距;x5,后乳头距;x6,乳区面积。本研究进一步阐明了地中海奶水牛不同胎次乳房性状之间存在相关性,而乳房性状与泌乳性能之间的相关性受胎次的影响。     

硒都黑猪体重与体尺指标的通径分析及最优回归模型的建立

为了探讨硒都黑猪体重与体尺指标的相关性,研究体尺指标对体重的直接和间接作用,构建体重与体尺的最优回归模型,试验选取190日龄硒都黑猪167头,测量体重(Y)与体高(X₁)、体长(X₂)、胸围(X₃)、腹围(X₄)、臀长(X₅)、臀宽(X₆)、臀围(X₇)等各项体尺指标,并进行相关性分析、通径分析、逐步线性回归分析。结果表明,硒都黑猪公猪和母猪体重与各项体尺指标均呈极显著正相关(P<0.01),公猪体尺指标与体重相关系数最大是体长(r=0.846),母猪体尺指标与体重相关系数最大为胸围(r=0.739)。硒都黑猪公猪胸围、体长、臀围对体重直接作用较大,腹围、体高、臀长对体重间接作用较大;硒都黑猪母猪胸围、体长、臀围、体高、臀长对体重直接作用较大,腹围、臀宽、臀长、臀围对体重间接作用较大。公猪和母猪的最优回归方程分别为Y公=0.627 X₂+1.153 X₃+1.919 X₇-179.953,Y母=0.435X₁+0.425 X₂+0.91 X₃+1.289 X₅+1.302 X₇-172.412。在硒都黑猪培育过程中,公猪应注重胸围、体长、臀围的选择力度,母猪应注重胸围、体长、臀围、体高、臀长的选择力度,以达到最大限度提高体重的目的。     

妊娠母猪疥螨病的防治

猪疥螨病是我国猪场常见的高度接触性的寄生虫病,虫体在皮肤深层挖凿隧道,以皮肤组织和渗出的淋巴液为食,在隧道内发育和繁殖,能够引起皮肤瘙痒,猪只摩擦或以肢蹄搔擦患部,导致脱毛、结痂,皮肤肥厚,形成皱褶和龟裂等。     

猪SRRM3基因多态性与母猪产仔数性状的关联分析

本实验旨在探究猪SRRM3基因单核苷酸多态性（SNP）位点rs326267396与母猪产仔数性状的关系。基于前期GWAS数据筛选出与母猪产仔数性状相关的候选基因SRRM3,本研究选取465头大白猪作为实验对象,通过Sanger测序检测SRRM3基因内SNP位点,并与母猪产仔数性状进行关联分析。SRRM3基因rs326267396位点存在G>T突变,且检测出GG、GT、TT 3种基因型。结果显示GT基因型个体较多,GG基因型和GT基因型个体的总产仔数、产活仔数和健仔数都显著高于TT基因型个体,且总产仔数和产活仔数的加性效应达到显著水平,而健仔数的加性效应与母猪产仔数的显性效应均未达到显著水平。此外,定量结果显示猪SRRM3基因在卵巢、子宫和心脏组织中高表达,其中在子宫组织中表达量最高;采用生物信息学方法预测出与SRRM3基因rs326267396位点不同亚型结合的转录因子发生变化;以及SRRM3基因可能通过与CDC5L蛋白（调节卵母细胞的减数分裂和成熟）结合参与调控母猪的繁殖性能。综上,SRRM3基因rs326267396位点与产仔数性状显著相关,推测SRRM3基因可作为大白猪繁殖...     

饲料禁抗条件下猪场的生产

抗生素的使用,在促进养猪业发展的同时,也带来了细菌耐药、产品抗生素残留等一系列问题。对此,我国实施了一系列针对限制抗生素使用的相关办法。饲料禁抗的全面实施,将会对整个养猪行业产生巨大的影响。文章主要介绍了在禁抗时代猪场的一些应对措施和处理办法。     

利用二元母猪生产父母代母猪的方法

三元猪作为母猪使用，其繁殖性能低下，猪场外购二元母猪补充更新猪群，费用高且有很大的疫病传入风险，文章介绍了一种使用二元母猪生产父母代母猪的方法。     

基于转录组测序探究地塞米松在前体脂肪细胞成脂分化过程中的作用机制

试验旨在研究地塞米松（DEX）在前体脂肪细胞成脂分化过程中的作用机制,为后续体外研究猪肌内脂肪（IMF）沉积的调控机制奠定前期基础。试验分别使用DEX及常用成脂诱导剂MDI(3-异丁基-1-甲基黄嘌呤0.5 mmol/L、地塞米松1μmol/L、胰岛素10μg/mL)处理3T3-L1细胞,利用GO Term和KEGG PATHWAY对差异基因进行功能及信号通路分析。结果发现：相比阴性对照组,MDI组和DEX组分别筛选到2280个、1188个差异表达基因,差异基因富集到血管相关平滑肌收缩、脂质生物合成、脂肪细胞分化等生物学过程;对2处理组间的差异基因集进行Venn分析,获得779个共有差异表达基因,其中上下调模式一致的差异表达基因751个,且显著富集到脂肪细胞分化、脂肪酸代谢过程和PPAR信号通路等。本研究鉴定出通过DEX诱导前体脂肪细胞成脂分化过程的关键基因Selenbp1、Arid5b、Rgs2、Metrnl、Acsl6、Hmgcs1等。     

大白猪繁殖性状全基因组关联分析

本研究利用全基因组关联分析（GWAS）挖掘与大白猪总产仔数（TNB）、产活仔数（NBA）和健仔数（NHP）相关的候选基因。选择1 100头大白猪为实验材料，通过提取耳尾组织样DNA并利用“中芯一号”芯片进行基因型分型，采用PLINK v1.9对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究。rMVP软件对每个SNP与性状做关联分析，确定出显著位点。结果表明：对于TNB性状共有3个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著；NBA性状共有4个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著；NHP分析得到18个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著。在上述显著SNPs附近共有23个候选基因，根据基因功能注释推测ESR1、ZP3、YWHAG、HSPB1、MDH2、PCCB是能够影响繁殖性状的重要候选基因。