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为了解贵州地区猪伪狂犬病毒的分子流行现状,本研究提取实验室分离并保存的PRV GZJS2017株病毒核酸作为PCR扩增模板,并对其进行TA克隆、序列测定和用生物学软件进行遗传信息分析。结果表明:本次分离得到的GZJS2017株gE基因所测长度1740 bp,GC含量为73.97%,通过系统进化树分析结果显示PRV不同地域毒株之间同源率达98.8%~99.9%,说明该毒株gE基因具有高度的保守性。本研究可为今后深入开展PRV gE基因的功能研究提供一些依据。 相似文献
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为了了解贵州分离株PRV GZDZ2016株gE基因的遗传变异情况,试验采用克隆与测序方法对PRV GZDZ2016株进行了研究,并利用生物信息学软件分析gE蛋白的抗原性和疏水性。结果表明:PRV GZDZ2016株与GenBank上PRV变异毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.7%~99.9%和99.1%~99.8%;gE蛋白抗原表位与疏水性分析表明,由于gE基因48位和496位各有一个天冬氨酸(D)的插入,同时236位由亮氨酸(L)变为脯氨酸(P),导致相应的抗原表位和疏水性区域发生了相应改变。 相似文献
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为了查明贵州省遵义市某猪场保育猪发生腹泻、咳喘、消瘦死亡的原因,试验采用PCR/RTPCR技术对送检样品分别进行了猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV-2)和猪圆环病毒3型(PCV-3)的检测,并对PCR产物进行了测序分析。结果表明:送检的发病保育猪为PCV-3和PCV-2双重感染,序列分析显示该PCV-2毒株全长1 767 bp,属于PCV-2d型,且PCV-2 ORF2编码的氨基酸与疫苗株DBN-SX07-2同源性最高(94.2%)、与LG株同源性最低(91.8%);获得的PCV-3序列大小为649 bp,属PCV-3c型,与PCV-3/KU-1609毒株核苷酸同源性最高(99.2%),与PCV-3-China/GD2016毒株核苷酸同源性最低(96.4%),遗传进化关系相对复杂;抗原表位分析发现,PCV-3毒株有多个核苷酸位点突变,但变异位点均不在预测的抗原表位中。说明在贵州省不仅有PCV-3的流行,还有PCV-3和PCV-2混合感染现象的存在。 相似文献
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