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1.
在鲤(Cyprinus carpio)基因组中鉴别出一个新的具有潜在转座活性的Tc1类转座子,并命名为CCTN转座子(Cyprinus carpio Transposon,CCTN)。CCTN转座子全长1 611 bp,由两端约214 bp的反向重复序列(Inverted Repeat,IR)和中间不间断的996 bp的转座酶开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)组成。CCTN转座子推测的转座酶序列中存在完整的DD(34)E结构域,此结构域是Tc1类转座酶作用的必需位点之一。采用实时荧光定量PCR评估CCTN转座子在鲤基因组中的拷贝数约为2.28×103,占全基因组的0.21%。分子系统学研究表明,CCTN转座子是一个新的鱼类Tc1类转座子,其与斑马鱼(Danio rerio)Tzf-28、大西洋鲑(Salmo salar)SALT1和鲽(Pleuronectes platessa)PPTN2等Tc1类转座子亲缘关系较近。  相似文献
2.
Putative nonautonomous transposable elements from channel catfish (Ictalurus punctatus) were identified. They were named Tipnon elements for Tc1-like transposable elements from channel catfish that are nonautonomous. These elements were defined by their terminal repeats that share identity to members of the known Tc1/mariner transposon superfamily. They show structural similarities to Tc1-like elements, but share little sequence identity beyond the terminal inverted repeats. They do not harbor any amino acid blocks that show similarities to the Tc1-like or other transposases and thus may represent truly nonautonomous transposons in channel catfish. They are abundant in the channel catfish genome with a copy number of 32000, having 500 base pair per copy, this family of nonautonomous transposon-like elements account for 1.6% of the channel catfish genomic DNA. Their high abundance and transposon-like terminal repeats indicate that they may play important roles in gene evolution and in genomic architecture of catfish. Similarity search for potential coding capacity of the Tipnon elements revealed that they contain sequence blocks that can potentially encode amino acid blocks similar to the para-type sodium channel proteins in cockroaches or house flies, proteins that function in the central nervous system as voltage-gated sodium transporters. Sequences surrounding the terminal inverted repeats are divergent from those used by the reconstructed Sleeping Beauty fish transposase.  相似文献
3.
在鲤(Cyprinus carpio)基因组中鉴别出一个新的具有潜在转座活性的Tc1类转座子,并命名为CCTN转座子(Cyprinus carpio Transposon,CCTN)。CCTN转座子全长1 611 bp,由两端约214 bp的反向重复序列(Inverted Repeat,IR)和中间不间断的996 bp的转座酶开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)组成。CCTN转座子推测的转座酶序列中存在完整的DD(34)E结构域,此结构域是Tc1类转座酶作用的必需位点之一。采用实时荧光定量PCR评估CCTN转座子在鲤基因组中的拷贝数约为2.28×103,占全基因组的0.21%。分子系统学研究表明,CCTN转座子是一个新的鱼类Tc1类转座子,其与斑马鱼(Danio rerio)Tzf-28、大西洋鲑(Salmo salar)SALT1和鲽(Pleuronectes platessa)PPTN2等Tc1类转座子亲缘关系较近。  相似文献
4.
ToI2转座子是从青口(Oryzias latipes)中发现的唯一一个具有自主转座活性的转座子,是hAT转座子家族的一员。研究表明,ToI2在多种模式动植物中都有转座活性,如斑马鱼(Danio rerio)、小鼠、非洲爪蟾等,并已得到了广泛应用。本文综述了ToI2转座子的特性、转座机制以及其在斑马鱼、青锵和罗非鱼等鱼类中的最新研究进展,以期为ToI2转座子在转基因养殖鱼类中的应用研究提供参考。  相似文献
5.
高波  陈才  张丽  沈丹  王赛赛  陈伟  王伟  产舒恒  宋成义 《水产学报》2017,41(11):1660-1666
转座子在生物基因组中占据重要的组成部分,是基因组中可移动和扩展的重要元件,其转座活性受外界环境因子调控.为了探讨环境应激对基因组转座子表达活性的影响,用环境污染物二噁英(TCDD)和重金属Cu2+或Cd2+处理斑马鱼早期胚胎,通过荧光定量PCR(qRT-PCR)比较处理前后9种结构完整的转座子转录活性变化,这9种转座子分别是DNA转座子Tc1家族的Tc-a、Tc-b、Tc-c、Tc-d、Tc-e,反转录转座子病毒家族ZB-ERV-1、ZB-ERV-2、反转录转座子LINE家族L1-323和L1-21.结果发现,TCDD使8个转座子转录活性明显下调,1个转座子显著上调;Cu2+导致7个转座子上调,2个显著下调;Cd2+导致6个转座子上调,3个显著下调.研究表明,斑马鱼转座子转录活性受环境因素影响显著,环境胁迫可能是转座子活性变化的原因之一.本研究对了解和评估环境因子对鱼类转座子活性的影响作用具有重要的意义,为进一步研究生物基因组的进化机制提供参考.  相似文献
6.
为了探讨刀鲚2种不同生活史种群的遗传结构差异以及成因,本研究利用分子克隆及转座子展示技术,从刀鲚基因组中分离、鉴定出一类新的、命名为Cn-Tc1的转座子.该转座子全长1896 bp,为鳀科鱼类第一类被挖掘的Tc1转座子.Cn-Tc1自身包含另一个长度为1040 bp的类Tc1,表明Cn-Tc1在基因组内的转座经历过多次迸发.Cn-Tc1的5'和3'末端反向重复序列长度分别为64和83 bp,转座插入位点具有"TATA"基序.预测的Cn-Tc1转座酶具有与DNA结合的保守结构,提示其仍具有转座潜能.Cn-Tc1插入位点侧翼序列的GC含量呈不均匀分布,均值低于AT含量.运用荧光定量PCR方法,估算了靖江、象山、洞庭湖、鄱阳湖、太湖以及崇明等水域刀鲚种群基因组中Cn-Tc1拷贝数,分别为3.140×103、2.992×103、6.876×103、5.205×103、5.531×103和3.046×103个.单因素方差分析发现,象山、崇明、靖江种群间的拷贝数差异性不显著,而与其他种群的差异性均显著;鄱阳湖、太湖和洞庭湖种群之间差异性亦不显著,但与其他种群均呈显著性差异.研究结果表明,Cn-Tc1促进了遗传结构的改变,为刀鲚种群的适应性进化提供了自然选择的基础.  相似文献
7.
In recent years, infectious disease caused by Streptococcus agalactiae has increased in aquaculture, threatening the healthy development of tilapia and resulting in substantial economic losses. Cultivating disease‐resistant tilapia by transgenic technology is one strategy that has been developed to address this issue. Here, we used a transposon system to investigate gene expression and tissue lytic activity in transgenic zebrafish expressing the tilapia lysozyme. The transpose vector contained the Tgf2 transposon skeleton, tilapia heat shock protein 70 promoter (Hsp70) and two target genes (tilapia C‐type lysozyme 3 [lysozyme‐C3] and green fluorescent protein [GFP]). The transgenic zebrafish F0 generation was obtained by microinjecting the donor vector and transposase mRNA into fertilized zebrafish eggs. There was 45% green fluorescence in the zebrafish F0 generation, which was spread over the entire body based on microscope observation. The F0 generation was reared to sexual maturity, at which point individuals were mated with wild‐type zebrafish to produce the F1 generation. Tilapia lysozyme‐C3 expression was detected in the liver of F1 generation by RT‐PCR and western blotting, but was not detected in the skin, intestine, or muscle. Significantly higher liver bacteriolysis activity was detected in transgenic zebrafish compared with wild‐type zebrafish. Therefore, transgenic zebrafish may have an increased potential for bacterial resistance.  相似文献
8.
采用转座子mini-Tn10/Km构建了致病性溶藻弧菌的突变库,采用半固体双层平板初筛到73株运动缺陷突变株,初筛的突变株纯化及重复筛选后获得运动性缺陷表型稳定的突变株ND-01MM,Southern鉴定确定其为单位点插入。野生型菌株ND-01和运动缺陷突变株ND-01MM对致病性溶藻弧菌的天然宿主大黄鱼粘液的趋化、粘附以及在大黄鱼吞噬细胞内存活能力等生理功能的比较研究发现,溶藻弧菌运动缺陷后趋化及粘附能力均极显著下降(P<0.01),但在吞噬细胞内的存活能力则与野生型菌株差异不显著(P>0.05)。采用腹腔注射和浸泡两种方式感染大黄鱼,结果发现运动缺陷对浸泡感染的影响较为明显,但对腹腔注射的感染方式影响不大。  相似文献
9.
为了探讨piggyBac转座子在鲤科鱼类及鳅科鱼类转基因中的适用性,实验通过将PAβ启动子控制的DsRed表达元件插入pigA3GFP中,构建转基因载体pigA3 GFP-AβDsRed.用该载体对草鱼肾脏(CIK)细胞转染,结果显示,通过piggyBac转座子可将外源基因导入到CIK细胞的基因组中,来源于家蚕的A3启动子和来源于巨细胞病毒的CMV启动子在CIK细胞均具有活性.将转基因载体pigA3GFP、pigA3GFP-AβDsRed分别与辅助质粒helper-pigA3混合后以精子介导法导入金鱼和泥鳅的受精卵后,经荧光观察、PCR鉴定、Dot blotting鉴定,证实获得了转基因金鱼和转基因泥鳅.研究表明,PB转座子在鲤科鱼类及鳅科的一些鱼中具有转座活性.  相似文献
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