微卫星DNA标记对乌苏里江哲罗鱼遗传多样性的分析

从网上查询获得鳟微卫星标记30对，并对乌苏里江哲罗鱼的基因组进行遗传多样性分析，结果筛选出10对具多态性的微卫星标记。并用其中6对微卫星引物对17尾乌苏里江哲罗鱼进行基因组DNA扫描检测。用2％的琼脂糖凝胶电泳检测微卫星标记的PCR扩增产物，并对扩增结果进行了统计分析，计算了6个基因座的等位基因频率、杂合度等。结果表明，乌苏里江哲罗鱼等位基因频率为0．0455～0．7857，多态信息含量(PIC)为0．2801～0．6351，杂合度(H)为0．3368～0．6563。统计结果初步表明乌苏里江哲罗鱼的遗传多样性程度处于中等偏下水平。同时，结合资源量下降的事实，建议在保护遗传多样性的前提下对其采取人工繁殖和放流的方法增加其种群数量。  

鲫鱼4群体基因组DNA遗传多样性及亲缘关系的微卫星分析

采用微卫星技术，用9对微卫星引物对4个鲫鱼群体普通鲫鱼(C．auratus auratus)、红鲫(C．suratus red var)、白鲫(C．auratus cuvieri)和彭泽鲫(C．auratus auratus var．Pengze)的遗传多样性及亲缘关系进行研究。结果表明，4种鲫鱼的平均遗传杂合度值在0．607～0．721，其中自鲫0．721、红鲫0．652、彭泽鲫0．629、鲫鱼0．607；平均多态信息含量值在0．530～0．670，其中自鲫0．670、红鲫0．586、彭泽鲫0．549、鲫鱼0．530。由此可见，4个鲫鱼群体的遗传多样性总体水平较高，但白鲫的遗传多样性最高，鲫鱼的遗传多样性最低。在4种鲫鱼群体间，鲫鱼和白鲫群体间的遗传相似性指数最小(0．714)，遗传距离值最大(0．286)，说明这两种群体亲缘关系较远；白鲫与红鲫群体间遗传相似性指数最大(0．812)，遗传距离值最小(0．188)，这可推断白鲫与红鲫亲缘关系较近。聚类分析结果表明，白鲫和红鲫亲缘关系较近，而鲫鱼和彭泽鲫亲缘关系较近。研究鲫鱼遗传多样性对鲫鱼种质资源的保护和遗传改良具有重要意义。  

巨蛎属牡蛎遗传多样性研究

用ＲＰＤ方法获得的几种牡蛎间的遗传距离表明，我国北方海域确定存在大连湾牡蛎，褶牡蛎和近江牡蛎三种自然种。，它们同属巨蛎属。大连湾牡蛎，褶牡蛎和太平洋牡蛎互为姊妹种，近江牡蛎与它们互为非姊妹种。有无长牡蛎以及长牡蛎与上述三种牡蛎的关系有待进一步研究  

中国鲤几个代表种群基因组DNA遗传多样性分析

中国鲤具有悠久的养殖历史和重要的经济价值,无论是天然种群还是养殖品种,年产量远超过其它鱼类。近几十年来,养殖新品种的开发获得成功,大大提高了产量,改善了品质。但是由于盲目的开发利用,许多重要的鲤养殖种类的种质资源遭到破坏。"江西三红"(Cyprinuscarpiovar.xingguonensis、Cyprinuscarpiovar.wuyuanensis、Cyprinuscarpiovar.wananensis)、黄河鲤(Cyprinusycarpiovar.)和黑龙江野鲤(Cyprinuscarpiohaematopterus)是中国鲤几个具有代表性的养殖品种和野生种,在我国鲤鱼遗传育种研究中均占有非常重要的地位。应用第二代分子标记,即微卫星标记(microsatellite)84个,对以上5个具有代表性的中国鲤进行了全基因组DNA检测。结果表明,当退火温度提高至60℃时,有43对标记引物扩增出清晰的条带,其中有14对在群体间呈现多态性,扩增等位基因位点为2～4个。微卫星座位MFW4,MFW19,MFW23和MFW26在群体内显示了高度的多态性,扩增等位基因位点为7～13个。统计实验结果发现,"江西三红"3个品种间遗传差异较小,兴国红鲤和荷包红鲤的亲缘关系较近(0.93);属于同一亚种不同地理种群的黄河鲤和黑龙江野鲤具有较高的遗传相似性(0.89)。另外,根据微卫星多态性分析结果,探讨了这5种鲤的遗传多样性。  

RAPD方法对中华绒螯蟹长江、辽河、瓯江三群体的遗传多样性分析

用RAPD技术检测了中华绒螯蟹（E．sinensis）长江、辽河、瓯江三个群体各10个个体的基因组DNA的多态性。经20个随机引物扩增得到每一个体的多态片段，通过对群体内及群体间共享片段的分析，得到三群体间的相似率数据，为中华绒螯蟹的种群关系的研究提供了重要的资料。  

合浦珠母贝2个野生种群的遗传多样性

用形态特征比较与同工酶电泳分析相结合的方法，对产于我国部湾和大亚湾的野生合浦珠母贝（pinctada martensii)的遗传多样性进行研究，结果表明，在贝壳形态方面，北部湾种群的平均壳长与壳高都略大于大亚湾种群，壳高与壳长呈乘幂相关，壳宽与壳长呈对数相关，大亚湾种群的壳宽指数，壳重指数和肥满度指标都大于北部湾种群，用聚丙烯酰胺梯度凝胶电泳检测由26个位点编码的12种同工酶，2种群都显示出较高的多态性，北部湾种群多态位点的比率为38．46％，大亚湾种群则为46．15％，都表现出明显的杂合子缺失现象，北部湾种群的平均杂合度（0．0999）小于大亚湾种群（0．1243），2种群之间的遗传距离为0．0159,本文还讨论了引种2种群杂合子缺失现象的原因，并认为生化遗传分析的结果与2个种群的形态特征是相关联的。  

合浦珠母贝3个养殖群体的RAPD分析

利用RAPD标记技术检测了广西省北海市、海南省三亚市、广东省深圳市等 3个地理种群养殖合浦珠母贝(Pinctadamartensii)基因组DNA的多态性 ,并对其遗传结构进行了初步分析。从 4 0个随机引物中筛选出 13个10bp引物 ,它们在 3种群中共扩增出了 14 0条DNA片段 ,3种群共有片段 16条 ,DNA片段数分别为 5 8、91和 71条 ,多态性位点比例分别为 4 1 4 % ,6 5 0 %和 5 8 4 %。遗传距离分析表明 ,广西种群与广东种群的亲缘关系较近 ,而与海南种群亲缘关系较远。 13个引物中 ,引物S11和S3 58扩增出的 3种群指纹图谱差异显著 ,可作为 3种群鉴定的分子标记。  

5种鲟、鳇鱼基因组DNA遗传多样性分析

以史氏鲟(Acipenserschrencki)、达氏鳇(Husodauricus)俄罗斯鲟(A.gueldenstaedti)、小体鲟(A.ruthenus)西伯利亚鲟(A.baeri)的基因组DNA为实验材料,用改进的DNA提取方法获得了完整的基因组DNA片段。通过25个SSLP及Ⅰ型引物对5种鲟鳇鱼的基因组DNA进行PCR多态性引物筛选,获得11个能扩增出遗传多态性的有效引物,通过对5种鱼的PCR分析,平均遗传距离为0.748,遗传距离最大的为达氏鳇和小体鲟之间为0.9355,DNA分析结果还显示,鲟鳇鱼的遗传多样性程度十分低下(47.93%)。同时建立了5种鲟鳇鱼的聚类图。  

象山缢蛏养殖群体和野生群体遗传多样性的比较

于2001年4月，在浙江象山港虾塘和象山外海滩涂分别采集100个缢蛏(Sinonovacula constricta Lamarck)样品，采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，分析了2个群体各38个样本的EST、ADH、MDH、IDH、ME、LDH、GDH、SOD、SDH、ATP等10种同工酶，分别记录了30、29个基因位点。其中s-MDH-1、SDH、s—ME、ATP-1、ATP-2等5个位点为多态位点。象山野生缢蛏群体的多态位点比例(17．24％)和群体平均杂合度观察值(0．0377)都明显高于养殖群体(16．67％，0．0314)。结果表明，与其他贝类比较缢蛏象山养殖和象山野生群体拥有较低的遗传变异水平，其中象山野生群体比养殖群体遗传变异水平高。  

青海湖裸鲤繁殖群体线粒体基因组D-loop区序列多态性

利用PCR技术扩增青海湖3个不同地区（黑马河，布哈河，沙柳河）的青海湖裸鲤（Cormnocypris przewalskii（Kessler））线粒体D-loop基因片段，测定该基因片段1 005bp序列。通过线粒体基因组D-loop区序列比较分析，对比3个不同地区的83尾青海湖裸鲤的遗传结构进行研究，共检测出多态性位点65个，其中有1个插入位点（b3，nt-569），2个缺失位点（s6和b37，nt-169、nt-170），多态性位点数62。3个群体内的多态性位点分别为黑马河51个、布哈河38个、沙柳河39个，平均核苷酸位点差异数分别为9.377、7.782和7.510。结果表明，不同地区的遗传距离分别为黑马河群体与布哈河群体间的平均遗传距离最小（0.01093），布哈河群体与沙柳河群体次之（0.01423），黑马河群体与沙柳河群体的遗传平均距离最大（0.01909）。3个群体间的遗传平均距离都在0.01以上，而且3个群体间总的遗传分化指数为0.01926，基因流为12.73。UPGMA法构建的分子系统树中，沙柳河群体聚成一支，黑马河和布哈河群体混杂在一起，聚成一支。从序列差异的分析中得出，沙柳河群体与黑马河和布哈河群体的亲缘关系较远；黑马河和布哈河群体亲缘关系较近。以上数据还表明，青海湖裸鲤3个繁殖群体间具有较弱的遗传分化，洄游到同一河流里进行交配繁殖的群体内基因交流作用比较大，而洄游到不同河流进行繁殖的群体间的基因交流相对较小。