中华鳖GHITM cDNA基因克隆及表达分析

为研究GHITM基因在中华鳖(Trionyx sinensis)胚胎发育及生长中的作用，本研究通过RT-PCR和RACE方法获得了中华鳖GHITM全长cDNA序列；采用实时荧光定量PCR对GHITM mRNA组织表达及不同温度孵化胚胎发育过程中的表达特性进行分析。结果显示，中华鳖GHITM cDNA序列长度为2650 bp，开放阅读框为1050 bp，5?非编码区为123 bp，3?非编码区为1477 bp，编码349个氨基酸，编码蛋白的等电点为10.01，分子量为37.12 kDa。GHITM编码氨基酸序列由胞外区、跨膜区和胞内区组成，7个跨膜域组成跨膜区。GHITM编码氨基酸序列的同源性分析显示，中华鳖与锦龟(Chrysemys picta bellii)和绿海龟(Chelonia mydas)同属一个分支，3种鳄鱼构成一个分支，7种鸟类形成一个分支。实时荧光定量检测显示，GHITM基因在肝脏、肌肉和脑垂体中的表达水平较高，显著高于心脏、性腺、肠、肾脏和脾脏组织(P<0.05)；50 g左右和500 g左右雄性个体肝脏中的GHITM基因表达量显著高于雌性个体(P<0.05)；低温胁迫孵化能显著抑制胚胎肝脏中GHITM基因的表达(P<0.05)。上述研究结果表明，GHITM基因与中华鳖生长和胚胎发育密切相关，其在中华鳖胚胎中的表达受孵化温度调节。本研究为探讨中华鳖胚胎发育和生长提供理论依据。     

血根碱对中华鳖生长和体组成及血清指标的影响

将480只中华鳖分为4组,每组3个重复,分别投喂对照(对照)或分别添加含50、100、150 mg/kg的血根碱制剂的试验饲料,试验期75 d,研究血根碱对中华鳖生长、体成分和血清指标的影响。结果表明:饲料中血根碱添加量为50、100 mg/kg的中华鳖的成活率显著高于添加量为150 mg/kg和对照的;添加量为50、100 mg/kg的中华鳖的饲料系数显著低于对照的;添加量为50mg/kg的中华鳖的肌肉中鲜味氨基酸总量比对照的提高1.7mg/g,但差异无统计学意义;随着饲料中血根碱的添加量增加,中华鳖体组成中粗蛋白的占比呈先增加后降低的趋势,添加量为50 mg/kg的中华鳖体组成中粗蛋白的占比显著高于添加量为150 mg/kg和对照的;随着饲料中血根碱的添加量增加,中华鳖血清中的葡萄糖含量呈先降低后升高的趋势,添加量为50、100 mg/kg的中华鳖血清中葡萄糖含量显著低于添加量为150 mg/kg和对照的;添加量为50 mg/kg的中华鳖血清中碱性磷酸酶活性显著高于对照的,谷胱甘肽过氧化物酶活性显著高于其他处理;添加量为50、100 mg/kg的中华鳖血清中谷草转氨酶活性显著低于对照的。可见,在本试验条件下,基础饲料中添加50～100 mg/kg血根碱较为适宜。     

泥东风螺EST-SSR开发及其群体遗传多样性分析

本研究采用MISA软件分析泥东风螺(Babylonia lutosa)转录组中微卫星信息。结果显示，从转录组中共获得16324个SSR，共有181种重复基元；泥东风螺转录组中不同类型微卫星的重复基元具有不同的分布特征，其中，二核苷酸重复基元中AC/GT(70.58%)重复基元以重复6次出现频率占优；长度为12~20 bp的SSR占63.95%，长度为21~25 bp的SSR占9.14%，总体的平均长度为18.4 bp。随机选取其中50条序列设计引物，通过对福建野生泥东风螺群体(WP)DNA样本进行PCR扩增和分型，结果获得23个多态性位点，等位基因数目为2~7个不等，期望杂合度(Ne)为0.190~0.937，观察杂合度(No)为0.065~0.936，多态性信息含量(PIC)为0.061~0.777，有4个位点显著偏离哈迪温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE) (P<0.05)。对野生群体和养殖群体(BP)遗传多样性分析显示，野生群体和养殖群体的平均Ne分别为0.491和0.544，平均No分别为0.477和0.564，平均PIC分别为0.541和0.407。Fis结果显示，野生群体和养殖群体分别有13个和9个位点杂合子过剩。群体间遗传分化指数(Fst)为0.001~0.655，平均值为0.053 (0.05相似文献   

高通量测序分析血根碱对中华鳖肠道菌群结构的影响

为研究血根碱对中华鳖(Trionyx sinensis)肠道菌群多样性及丰度的影响，选取480只初始体重为(31.75±7.20) g的中华鳖，设置添加0的对照组(RS1)和添加50 (RS2)、100 (RS3)和150 mg/kg (RS4)的3个实验组。实验结束后，提取中华鳖中肠组织的总DNA，进行16S rRNA V3-4区基因组测序。结果显示，实验组的总操作分类单元(Operational taxonomic units, OTUs)数量显著高于对照组，肠道菌群复杂度及丰富度较对照组有明显增加。肠道菌群结构组成分析发现，RS1与RS2结构较为接近，而RS1与RS3、RS4较远。在门分类水平上，变形菌门(Proteobacteria)和衣原体门(Chlamydiae)是优势菌群；在属分类水平上，螺杆菌属(Helicobacter)占绝对优势。通过比较发现，实验组中螺杆菌属丰度较对照组显著下降，而不动杆菌属(Acinetobacter)、乳杆菌属(Lactobacillus)和双歧杆菌属(Bifidobacterium)丰度均有明显上升。研究表明，在饲料中添加适量的血根碱(100~150 mg/kg)能有效提高中华鳖肠道菌群多样性及丰富度，并能改善肠道菌群结构。