基于Cytb及AFLP标记探讨仿石鲈科及相关科属分子系统进化关系

为从分子水平澄清我国仿石鲈科(Haemulidae)鱼类分类争议, 研究测定分析了仿石鲈科及其相关科属共 66 种鱼类的线粒体 DNA 细胞色素 b (Cyt b)部分序列, 结合 AFLP 标记信息, 共同探讨仿石鲈科及相关争议科属系统分类关系。结果表明, 在 Cyt b 基因上, 66 种鱼类一致序列为 729 bp, 编码 243 个氨基酸; AFLP 图谱中, 6 对引物组合共得到 669 条清晰条带, 多态性条带 669 条, 多态性比率 100%。基于 Cyt b 基因利用最大似然法与 AFLP 标记基于 UPGMA 聚类法构建的系统进化树大致相同, 进化树上, (1)仿石鲈科鱼类主要形成石鲈亚科(Haemulinae)与胡椒鲷亚科(Plectorhynchinae)两大分支, 石鲈属(Pomadasys)、仿石鲈属(Haemulon)、异孔石鲈属(Anisotremus)等 7 个属聚为石鲈亚科分支, 胡椒鲷属(Plectorhinchus)、少棘胡椒鲷属(Diagramma)与矶鲈属(Parapristipoma) 3 个属聚为胡椒鲷亚科分支。(2)髭鲷属(Hapalogenys)与眶棘鲈属(Scolopsis)没有与仿石鲈科聚在一起, 髭鲷属独自形成一支, 眶棘鲈属与金线鱼科(Nemipteridae)聚为一支。(3)鯻科(Teraponidae)的种类也没有与仿石鲈科鱼类相聚, 鯻科与舵鱼科(Kyphosidae)、石鲷科(Oplegnathidae)存在更近的亲缘关系。对于仿石鲈科及相关科属的分类争议, 研究支持仿石鲈科分为石鲈亚科与胡椒鲷亚科两个亚科, 以及鯻科、眶棘鲈属、髭鲷属不应该归为仿石鲈科的观点。     

基于16S rRNA序列探讨我国海鳝科鱼类分子系统进化关系

为从分子水平分析海鳝科鱼类分子系统分类关系，澄清物种分类争议，实验通过PCR扩增获得我国海鳝科9个属26种鱼类16S r RNA序列片段，结合GenBank下载的其他海鳝科鱼类的序列进行分析。结果显示，进化树上，海鳝科主要形成裸海鳝亚科与海鳝亚科两个分支，裸海鳝亚科包括尾鳝属与鞭尾鳝属，海鳝亚科包括裸胸鳝属、裸海鳝属、勾吻鳝属、蛇鳝属等8个属，与形态分类结果一致。裸海鳝亚科分支中，尾鳝属与鞭尾鳝属形成平行的姐妹分支；海鳝亚科分支中，斑马裸海鳝单独形成一支，位于该分支基部，其他种类聚为另一支。分支I中裸胸鳝属、勾吻鳝属、蛇鳝属、海鳝属等属均无法形成单系，揭示这些种属可能是多系起源，与近期的分子水平研究观点相似。研究结果支持将斑马裸海鳝归为裸海鳝属，为单型属物种；虎斑鞭尾鳝归为鞭尾鳝属，与尾鳝属平行进化；拟蛇鳝从长海鳝属分离出来，归为拟蛇鳝属等分类观点。豹纹勾吻鳝与海鳝属关系十分接近，但其形态上还具有多个勾吻鳝属的基本特征，至于是否归为海鳝属，还需后续更多的分子与形态学研究加以验证。