RNA二级结构遗传预测算法中的选择操作研究

在利用遗传算法设计RNA二级结构预测算法时,需要解决两类重要问题,即选择压力和种群多样性。选择压力有利于引导算法利用适应度标准更多地开发新个体,使得更多优秀的个体参与到迭代之中;而种群多样性是种群进化的基础。通过仿真试验对遗传算法中的选择操作进行性能分析和比较,找出适用于RNA二级结构预测的选择操作。     

pH值对绿色木霉合成纤维素酶的影响

以绿色木霉(Trichoderma viride)为产酶菌,研究了不同pH值控制方法对绿色木霉合成纤维素酶的影响。结果表明,初始pH值对绿色木霉合成纤维素酶的影响较大,当初始pH值为4.5时,纤维素酶活力到第7天达到40.74 IU/ml;而初始pH值为6.0时,纤维素酶活力到第7天仅有29.02 IU/ml。采用产酶过程调控pH值,当pH值7.5为最佳调控点,此时纤维素酶活力最高可达41.35 IU/ml。采用0.1mol/L的柠檬酸缓冲液调节产酶过程中的培养基pH值;经过6 d培养;纤维素酶活力可达58.70 IU/ml。     

玉米ZmNLP5与ZmSTP1、ZmAAP2基因启动子区域相互作用的鉴定

氮(N)是控制玉米产量的主要限制性因素,玉米对氮素的利用效率可以通过增加碳(C)的有效性得以改善。玉米转运蛋白ZmSTP1和ZmAAP2在植物C/N产物的运输和卸载过程中起着重要作用,且两个基因的启动子区域均含有一个硝酸盐响应顺式元件(nitrate responsive cis element,NRE)。NIN-like protein(NLP)是一类保守的植物特异性转录因子,已在多种植物被证实在调控N响应中发挥关键作用,其中玉米ZmNLP5是介导氮信号转导和代谢分子网络的中枢基因之一。为了明确ZmNLP5是否能与ZmSTP1和ZmAAP2基因启动子区域的NRE结合,以玉米B73为实验材料,首次利用酵母单杂交技术检测ZmNLP5与ZmSTP1、ZmAAP2基因启动子区域的相互作用。结果表明,将pGADT7-ZmNLP5-1/2分别转化Y1H (pAbAi-ZmSTP1)和Y1H(pAbAi-ZmAAP2)菌株后,在SD/-Leu培养基上均有菌落生长,在含AbA抗生素浓度为200 ng·mL^-1的SD/-Leu培养基中只有Y1H(pAbAi-ZmAAP2/pGADT7-ZmNLP5-1 )菌株能正常生长。结果说明,ZmNLP5只与ZmAAP2基因启动子区域相互作用,ZmNLP5是能与ZmAAP2基因启动子NRE结合的转录因子。本研究结果不仅有助于进一步了解玉米硝酸盐信号转导的调控途径,也为今后其他植物硝酸盐信号转导的研究提供理论依据。     

南京城市森林生态系统生产力与碳储量的计算

基于遥感数据Landsat TM影像与气象数据,利用温度、水分胁迫系数改进CASA模型,对南京市森林生态系统NPP与碳储量进行估算。结果表明,南京城市森林生态系统植被NPP空间分布较均匀,平均在200～1400g/(m2.a)之间;河流、市城区裸地植被NPP最小,在0～100g/(m2.a)之间;整个南京市植被NPP空间分布由北向南呈现逐渐增加趋势,由于最南部地区为自然森林区,保留了原始的自然环境状态,NPP最大。而分布在南京市的各个森林区,森林植被NPP均在1300～1426g/(m2.a)之间。利用生物量-蓄积量方程计算出南京市针叶林、阔叶林、针阔混交林碳储量分别占全市森林碳储量的24%、59%、17%。全市森林生态系统碳储量为111.73万t,平均森林植被碳密度为17.38t/hm2,郊区和县的森林植被碳储量远远高于市区,但是两者的碳密度并无很大的差异。     

遗传算法在RNA二级结构预测中的应用

介绍了几类遗传算法在RNA二级结构预测中的应用,并探讨该领域进一步的研究方向。     

强化木地板的“碳足迹”计算分析

随着国内外社会碳减排关注度不断提高,研究林产品全生命周期的碳足迹具有重要的意义。以强化木地板产品为例,对其碳足迹的核算方法和步骤进行了探讨。研究结果表明,强化木地板产品的碳排放主要来自其原辅料(约占50%)及强化木地板产品的生产制造过程(约占25%)。     

白斑综合征病毒囊膜蛋白VP19及VP28的研究进展

自二十世纪90年代,白斑综合征病毒(WSSV)就因其暴发范围广、致死率高得到了广泛的关注。研究主要集中在确定该病毒蛋白的结构及功能,以及利用其囊膜蛋白制备亚单位疫苗、研发DNA疫苗等来提高对虾抵抗白斑综合征病毒的能力,尽管免疫防治目前在实验室阶段已取得了显著的保护效果,但因其给药方式局限以及成本较高等因素一直没有应用于实际生产中。VP19和VP28是白斑综合征病毒主要的囊膜蛋白,在WSSV感染对虾的过程中起着非常重要的作用。本文从WSSV的基因组学、VP19和VP28的蛋白质结构及其在免疫防治中的应用等方面概述了VP19和VP28的研究进展,包括蛋白亚单位疫苗、DNA疫苗、RNA疫苗以及相关抗体的研究。在总结了不同类型疫苗的保护效果后发现,VP19和VP28的双价疫苗的保护率较高,为今后制定有效的WSSV控制方法提供了参考。     

桑椹红色素的研究现状与进展

从桑椹红色素的有效成分、提取工艺、稳定性及其生物活性等方面进行了综述。