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凡纳滨对虾EST微卫星标记初步筛选   总被引:3,自引:0,他引:3       下载免费PDF全文
对161 075条凡纳滨对虾dbEST(database of “Expressed Sequence Tags”)的数据进行SSR序列筛选,搜索参数为二~六核苷酸重复6次以上(包括6次),共获得含SSR的EST序列12 600条,占整个凡纳滨对虾dbEST数据库的7.8%,其中二核苷酸重复10 104条,占总ESTSSR序列的80.2%; 三核苷酸重复2 036条(16.1%),四核苷酸重复336条(2.7%),五核苷酸重复35条(0.3%),六核苷酸重复89条(0.7%)。大部分发现的微卫星序列为完美型(perfect)的重复序列。在二核苷酸所获得的SSR重复单元中,AG/CT是优势重复单元,共分布4 820条,占二核苷酸各重复单元的47.8%;其次是AC/GT重复,共分布3 584条,占二核苷酸各重复单元的35.4%;最后是AT/TA 和CG/GC,分别占二核苷酸各重复单元的16.6%和0.2%。通过对凡纳滨对虾EST序列中SSR位点信息的发掘分析,共设计77对微卫星引物,在10个个体中成功扩增的引物有54对,成功扩增率为70.1%。其中多态性丰富的引物28对,多态率为51.9%。等位基因数为2~5,PCR产物大小为140~600 bp。本研究筛选的ESTSSR标记将为凡纳滨对虾的分子遗传学研究、种质鉴定等提供可靠的工具。  相似文献
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海水养殖鱼类病毒性神经坏死病防控技术研究进展   总被引:1,自引:0,他引:1  
神经坏死病毒(Nervous necrosis virus,NNV)是一种能导致海水鱼脑、中枢神经及视网膜等神经系统坏死的病毒,该病毒引发的鱼类病毒性神经坏死病主要发生在稚鱼和幼鱼期,较强的致病力及高致死率给海水鱼养殖业带来了沉重的打击,成为海水鱼类养殖产业可持续发展最重要的限制因素之一。文章主要综述了NNV的基本特征、诊断技术、病毒传播、疫苗免疫学等研究进展,介绍了NNV的防控技术及策略,为海水养殖鱼类NNV的防控工作提供参考。  相似文献
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文章介绍了内蒙古自治区扎赉特旗规模性发展稻渔综合种养产业的基础条件及现状,分析了区域内产业发展中养殖条件和技术方面、稻谷价值、产业组织化、种养户文化程度等方面存在的问题,提出了今后产业发展相关对策。  相似文献
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摘要:开展羊卓雍错水体可培养细菌多样性研究,探究水体理化因子对水体可培养细菌多样性的影响。采用平板涂布法从羊卓雍错10个样点中分离细菌,结合16S rDNA区域序列分析和经典分类法对细菌菌株进行鉴定,运用R 3.6.1和SPSS 20.0等软件分析细菌多样性及其与理化因子之间的关系。结果显示,从羊卓雍错水体中共分离得到322株细菌,分属于12个属15个种,优势种为Aeromonas salmonicida、Raoultella terrigena以及Escherichia coli,分别占总菌株数的24%,22%和12%。相关性分析显示,羊卓雍错各样点水体可培养细菌总丰度与水体化学需氧量呈极显著正相关,与水体浊度、总氮呈显著正相关;各区域水体可培养细菌属数与水体电导率、总溶解固体量以及盐分含量呈显著正相关。本研究表明,羊卓雍错水体细菌资源比较丰富,水体可培养细菌多样性受水体理化因子与人为活动共同影响。  相似文献
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