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1.
为研究烟草中多酚氧化酶基因的功能,本研究从GenBank中挑选一个烟草多酚氧化酶基因Polyphenol oxidase E(基因登录号:NW_015916967.1),命名为NtPPOE。构建NtPPOE基因的CRISPR载体和超表达载体,分别得到NtPPOE基因抑制/过量表达的转化植株。研究表明,基因敲除植株NtPPOE基因相对表达量降低,PPO活性降低,多酚类物质含量升高;超表达植株NtPPOE基因相对表达量升高,PPO活性升高,多酚类物质含量降低。NtPPOE基因表达量与PPO酶活性呈正相关,与多酚类物质含量呈极显著性负相关,NtPPOE基因的表达影响了烟草多酚代谢。本研究通过分析NtPPOE基因差异表达产生的效应,初步验证了NtPPOE基因的功能,并得到了NtPPOE基因抑制/过量表达的突变植株,为PPO基因功能研究和不同PPO活性品种的育种提供材料基础。  相似文献   
2.
基于基因组重测序的分子标记研究是一种新的方法。本研究在普通烟草基因组序列已完全测定的基础上重测序了4个烟草品种(系),包括烤烟类型(LY1306,秦烟96)2个,晒烟类型(Wanmao 3)1个,马里兰烟草类型(Wufeng 1)1个。结合在NCBI中测序并发布的K326和TN90品种的基因组序列,分析了这4个重测序的烟草品种的InDel突变和SNP突变位点,鉴定出7个具有品种多态性的SSR候选位点,其中5个SSR位点可扩增出DNA片段。通过对包括不同烟草类型在内的10个烟草品种进行PCR检测,表明本研究选出的SSR位点可用于烟草品种或烟草类型的分类,其中NW-015889872.1、NW-015854676.1和NW-015890969.1等3个SSR位点可有效区分烤烟、白肋烟和马里兰烟以及晒烟烟草类型。  相似文献   
3.
[目的]采用生物信息学方法预测鼠李糖乳杆菌LGG细胞壁蛋白和功能分析。[方法]以鼠李糖乳杆菌LGG基因组编码蛋白序列为研究对象,采用Phobius和Signal P 4.0软件分析该菌株的细胞壁蛋白,同时采用COG功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能分析。[结果]鼠李糖乳杆菌LGG基因组中含有41个细胞壁蛋白,这些蛋白的功能分析结果显示,41个细胞壁蛋白中,25个蛋白没有功能注释,16个有功能注释,主要与细胞壁和细胞膜的生物合成,碳水化合物的代谢与转运,蛋白质的翻译后修饰等功能有关。[结论]该研究从结构和功能上分析鼠李糖乳杆菌细胞壁蛋白,为分析益生菌适应环境的分子特征打下基础。  相似文献   
4.
作为藻类和维管植物之间的过渡类群,苔藓植物不仅占有重要的进化地位,它同时可作为园艺上的观赏植物。目前对很多苔藓植物的培养条件、基因组大小等信息非常缺乏,且已进行基因组测序的苔藓物种较少,这些都严重制约了苔藓植物系统学的研究和资源利用。本研究以基因组大小为942 Mb的野生番茄(Solanum pennellii)为内标,采用流式细胞术对5种苔藓植物的基因组大小进行测定,结果表明,拟短月藓(Brachymeniopsis gymnostoma)的基因组大小约为391.40 Mb,绒叶青藓(Brachythecium velutinum)的基因组大小约为386.96 Mb,尖叶梨蒴藓(Entosthodon wichurae)的基因组大小约为441.01 Mb,桧叶白发藓(Leucobryum juniperoideum)的基因组大小约为493.21Mb,明叶藓(Vesicularia montagnei)的基因组大小约为337.94Mb。本研究为苔藓植物的全基因组测序、分子生物学研究、亲缘进化研究以及园艺苔藓品种开发和育种等方面提供重要信息。  相似文献   
5.
远缘杂交及异源多倍化导致许多重要作物的起源与进化,而芸薹属栽培异源四倍种是研究作物异源多倍化的模式系统之一。异源多倍体是如何调控及协调来自不同二倍体祖先的不同基因组的遗传行为及基因表达,是过去二十年间的研究热点和重要的生物学问题。利用不断发展的分子生物学技术,一方面揭示出芸薹属及其他多倍体物种基因组表现出动态性质,即在形成初期及长期进化过程中持续发生遗传及表观遗传的变化;另一方面发现异源多倍化过程中伴随着大量的基因表达模式改变,包括非加性表达、超亲表达、表达水平显性、部分同源偏向表达、基因剂量平衡效应等现象。上述基因组结构、表观遗传改变以及基因表达模式的调控,使新产生的多倍体得以成功进化为新物种。  相似文献   
6.
[目的]测定一株鸡传染性法氏囊病病毒基因组序列及其分子特征。[方法]分离出一株具有特殊分子特征的鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)超强毒株(vvIBDV)HLJ-0504,并对其基因组进行了克隆和测序。[结果]序列分析显示,HLJ-0504的基因组A节段属于超强毒株,而其B节段则来源于另外一个独特的祖先。动物实验表明,HLJ-0504对SPF雏鸡的致病率和致死率分别为100%和86.7%。[结论]具有独特基因组B节段的vvIBDV仍在我国流行,我国IBDV的进化特征存在多样性。IBDV的毒力不是由基因组的A或B单独决定的。  相似文献   
7.
Fusarium oxysporum (Fo) is an important soil-borne fungus that cause huge economic losses worldwide. Fungal-specific Common in Fungal Extracellular Membrane (CFEM) proteins are known to be involved in some important physiological processes associated with pathogenicity. To date, few Fo CFEM proteins have been characterized. The recent publication of several genomes of Fo has allowed us to conduct a genome-wide comparison analysis of CFEM proteins in Fo. In this study, we identified CFEM proteins for 12 different Fo formae speciales(f. sp) and obtained an average of 16 CFEM proteins for each Fo. The Fo CFEM proteins were classified into three groups (groups 1–3) according to structural features. Importantly, we identified a new conserved motif containing about 50 amino acids (DR motif) in group 1 members. CFEM proteins containing DR motif (CFEM_DR proteins) are remarkably conserved among Fo, and their number is greater in Fo compared with other fungi. We found the expansion of CFEM_DR proteins in Fo can be attributed to the segmental duplications in the genomes. Expression analysis revealed that CFEM_DR genes had a higher expression level in mycelium than conidia, and their expressions increased dramatically in the host roots at 3 days post inoculation, indicating that Fo CFEM_DR genes have roles while colonizing and infecting their hosts.  相似文献   
8.
《Veterinary microbiology》2015,175(2-4):185-194
Cyprinid herpesvirus 3 (CyHV3), also known as koi herpesvirus (KHV), can be subdivided primarily into European and Asian genotypes, which are represented by CyHV3-U or CyHV3-I and CyHV3-J, respectively. In this study, the whole genome sequence of a novel Chinese CyHV3 isolate (GZ11) was determined and annotated. CyHV3-GZ11 genome was found to contain 295,119 nucleotides with 52.9% G/C content, which is highly similar to those of published CyHV3-U, CyHV3-I, and CyHV3-J strains. With reference to CyHV3-U, CyHV3-I, and CyHV3-J, CyHV3-GZ11 was also classified into 164 open reading frames (ORF), which include eight repeated ORFs. On the basis of the 12 alloherpeviruses core genes, results from phylogenetic analysis showed that CyHV3-GZ11 had closer evolutionary relationships with CyHV3-U and CyHV3-I than with CyHV3/KHV-J, which were also supported by genome wide-based single nucleotide substitution analysis and the use of a series of developed molecular markers. This study was the first to reveal the presence of a distinct European CyHV3 genotype in East and Southeast Asia at a whole genome level, which will evoke new insights on exploring the origin, evolution, and epidemiology of the virus.  相似文献   
9.
雄性不育是水稻杂种优势利用的重要资源,对雄性不育现象的研究具有重要理论意义和实践价值。本研究以自然突变的水稻雄性不育突变体012S-3为试验材料,对其表型特征和花粉育性等进行调查,并构建遗传群体,利用分子标记对目的基因进行初步定位,然后应用基因组重测序技术对其进行精细定位。结果表明,012S-3是一个典型的无花粉普通型雄性不育材料,其不育性状受1对隐性核基因控制。初步定位分析目的基因与SSR标记RM6081存在连锁关系,其遗传距离约为34.4 c M;进一步的精细定位分析,找到3个候选基因:LOC_Os07g35880、LOC_Os07g35920和LOC_Os07g35940,其中LOC_Os07g35880和LOC_Os07g35940编码β-淀粉酶,属于水稻中新发现的花粉致死基因。该不育基因的成功定位为其进一步的分离克隆及其在水稻分子设计育种中的应用奠定了基础。  相似文献   
10.
从构建完整的教学内容、灵活运用多种教学方法两方面探讨了基因组学与蛋白质学课程的教学改革。教学内容改革包括教材的合理选用、"宽口径、厚基础、重能力"教学内容的改革、教学内容的优化与更新,多种教学方法的运用包括多媒体与板书相结合、案例教学法、录像教学法、启发式教学法、网络教学法。  相似文献   
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