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人类基因启动子识别是医学研究的基本需要.提取DNA序列碱基的PZ曲线特征、二核苷酸空间结构特征、保守信号似然得分,以及K联体似然得分,结合GC含量变化和非均匀指数,构建基于粒子群优化的支持向量机算法来识别人类基因启动子.利用粒子群优化支持向量机参数进行优化避免了人为选择的随机性,并且在分类问题中表现出较好的稳健性.对测试集的10-折交叉检验结果为:敏感性为92%,特异性为91%,马修斯关联系数为0.83.该结果表明,基于粒子群优化的支持向量机算法能有效识别启动子序列.  相似文献
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