北京鸭含有VHδ基因的TCRδ位点结构、表达及其进化特点

为分析北京鸭含有VHδ基因的TCRδ位点的结构、表达及进化特点,本研究通过筛选北京鸭基因组DNA的细菌人工染色体(Bacterial artificial chromosome,BAC)文库,并对筛选到的BAC克隆进行全长测序,获得包含北京鸭第二个TCRδ位点的约136 Kb的基因组序列;深入分析北京鸭第二个TCRδ位点基因序列,发现北京鸭第二个TCRδ位点上的VHδ、Dδ和Jδ之间没有内含子序列,已在基因组水平已经完成了VDJ的重组;同线性分析显示该基因位点结构为SPPL2A-VHδ-Dδ-Jδ-Cδ-OR-OR,与鸡的第二个TCRδ位点5’端具有同线性关系;通过Q-PCR得到了北京鸭二个TCR位点上基因的组织特异表达特点;全面分析鸟类第二个TCRδ位点上各基因的进化关系,结果显示所有鸟类的祖先中已出现了第二个TCRδ位点;但在进化过程中不同鸟类Cδ基因经历了基因的丢失或者基因的复制。