西北马鹿群体遗传多样性及系统地位

【目的】揭示西北马鹿(Cervus elaphus)群体的遗传多样性及系统地位,为科学地保护和利用我国西北地区马鹿资源提供基础研究材料。【方法】对塔里木马鹿、阿尔泰马鹿、天山马鹿、甘肃马鹿及阿拉善马鹿5个群体108个个体的D-loop全序列进行扩增、测序,分析其碱基组成及变异,构建系统发育树,研究西北马鹿群体遗传结构、群体遗传多样性及其系统地位。【结果】共检测到40个单倍型,平均单倍型多样度(Hd)为0.998±0.006,平均核苷酸多样度(Pi)为0.041±0.005,平均核苷酸差异数(K)为36.08。构建NJ和MP分子系统发育树发现,塔里木马鹿与其他马鹿遗传距离较远,分属于不同的类群;阿尔泰马鹿、天山马鹿及甘肃马鹿之间均存在基因交流,可能是群体间引种杂交所致。【结论】西北地区马鹿整体遗传多样性丰富;中国马鹿可能起源于欧洲;部分马鹿群体间存在基因交流情况。     

利用微卫星标记分析3个鹅品种的遗传多样性

为进一步验证伊犁鹅与非洲雁的起源,以伊犁鹅、灰雁、非洲雁为对象,利用微卫星标记技术对3个鹅品种资源的遗传多样性进行研究。结果表明,5对微卫星引物在3个品种的平均期望杂合度(He)为0.513 5~0.644 7,平均多态性信息含量(PIC)为0.425 8~0.588 3。3个品种的平均杂合度都较高,非洲雁最高(0.573 7),伊犁鹅最低(0.546 6),说明各鹅品种的杂合度和遗传多样性水平都较高,而且杂合度的高低与PIC的大小有较高的一致性。通过计算Nei’s标准遗传距离发现,3个品种的遗传距离较远;UPGMA聚类结果将新疆的伊犁鹅和灰雁聚为一类,再与非洲雁聚到一起。     

新疆马鹿群体遗传多样性及起源进化研究

为了科学评价、保护和利用新疆马鹿遗传资源,检测新疆马鹿群体遗传多样性和确定新疆马鹿起源进化的系统地位。对新疆塔里木马鹿、阿尔泰马鹿、天山马鹿3个群体,及与其距离相近的阿拉善马鹿、甘肃马鹿2个群体共108个个体的D-loop全序列扩增、测序,分析其碱基组成及变异。结果:共检测到40个单倍型,单倍型多样度(Hd)0.998±0.006,核苷酸多样度(Pi)0.041±0.005,平均核苷酸差异数K=36.08。构建NJ和MP分子系统发育树发现,塔里木马鹿与其他马鹿遗传距离较远,分属于不同的类群;阿尔泰马鹿、天山马鹿及甘肃马鹿之间都存在基因交流情况,可能是群体间引种杂交所致。结论:新疆马鹿遗传多样性丰富,新疆塔里木马鹿可能起源于欧洲,其他马鹿起源于亚洲。部分群体间存在基因交流情况。     

白唇鹿的微卫星遗传多态性分析

为科学评价、保护和利用白唇鹿资源,采用微卫星DNA标记技术,从牛微卫星引物中筛选出13对引物对38头白唇鹿进行遗传多样性分析。结果显示,共检测到39个等位基因,其中位点RT1、RT13、CSSM19呈单态性;其余10个位点中,多态信息含量(PIC)和杂合度(He)分别为0.049 9～0.652 6,0.051 9～0.702 8,白唇鹿群体的平均PIC为0.320 2,平均期望He为0.396 5。Shannon信息指数(I)为0.121 7～1.369 3,平均为0.694 2。位点NVHRT48的3项指标都最大,说明其变异水平最高,具有明显的遗传优势。3项指标都表明白唇鹿群体属于中度多态性,应加以重点保护和合理利用。研究结果进一步验证了PIC与He的相关性。