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4株新城疫病毒F蛋白和HN蛋白的计算机模建与表面抗原分析 总被引:1,自引:0,他引:1
选取新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)广东分离毒GM株(强毒株)和JM株(弱毒株)以及疫苗毒La-Sota株和标准强毒F48E9株,对其融合蛋白(F)和神经氨酸酶(HN)的编码基因序列进行分析,并利用Insight II软件包(Version 2000)进行F蛋白和HN蛋白C端蛋白单体的空间结构模建.结果显示,4个NDV毒株F蛋白单体分子的空间结构极为相似,大致分为3部分,即头部、茎部和柄部.其中头部结构主要由一些折叠股组成,茎部和柄部主要由螺旋结构组成.比较各毒株F蛋白表面蛋白溶剂可及表面积(ASA)后发现,该蛋白有5个线性B细胞表位和8个比较保守的抗原决定簇位点,蛋白头部残基的空间位置随毒株的不同而变异较大.GM株与F48E9株存在36个氨基酸残基的差异,JM株和LaSota株存在20个氨基酸残基的差异.研究结果还表明,4个NDV毒株的HN蛋白C端空间结构较保守,由多个折叠股和4段螺旋结构组成,其抗原决定簇位点也高度保守,只有4个氨基酸残基存在差异. 相似文献
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Britten利用变性一复性实验,通过cot曲线分析发现基因组中的DNA重复序列可分为三种类型:①高度重复序列,即在整个二倍体基因组中重复数超过10^5拷贝的序列;②中度重复序列,包括二倍体基因组所有重复数为10^2~10^5拷贝的序列;③低度重复序列,包括二倍体基因组中所有重复数为2~100拷贝的序列,而Weber等将它们分为三类, 相似文献
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1发病情况及临床症状该养殖户2003年11月20日从外地购进4月龄种鸽600只,引种前免疫情况不详,2003年12月10日胸肌注射新城疫I系苗,每羽3倍量,第2天采食量下降,精神沉郁,食欲减退,以后出现各种症状,流泪、眼肿、个别失明,拉黄绿色稀粪,有神经症状(转圈、扭头、站立不稳),从发病到死亡约15天左右,最快7天,发病300多只,死亡100多只。发病后饲喂或饮用VC、葡萄糖、青霉素与链霉素、柱精白霉素、泰乐菌素等,效果均不理想。2剖检变化送检活肉鸽剖检可见,眼睑肿胀,有干酪样分泌物,胸肌有小出血点,肝脏可见少许土黄色条纹,气囊混浊,心包炎,肝周炎,… 相似文献
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河南IBV肾变型地方分离株的分型研究 总被引:2,自引:0,他引:2
在气管环上进行交叉中和试验,结果显示河南分离的肾变型宜毒株与除T株以外的其余标准血清型毒株(M41、Holte、Arka、Conn、Gray)均有不同程度的交叉,但与Ark株相关性最大,为25%.将除Holte株以外的5株标准株和宜株的0.6kb扩增产物,用三种限制性内切酶AluⅠ、TaqⅠ和AfaⅠ进行酶切,RFLP分析可分为三种模式,宜株与Ark株、Gray株、CoNn株属同一模式,AluⅠ和AfaⅠ酶切阳性而TaqⅠ酶切阴性.另AluⅠ、TaqⅠ、AfaⅠ酶切均阳性的M41模式和TaqⅠ、AfaⅠ酶切阳性而AluⅠ酶切阴性的T株模式.将地方株宜株的0.6kb扩增片段进行测序并与标准株Ark株、Gray株、Conn株、Holte株和M41株的相应序列进行分析比较,核苷酸、氨基酸同源性的分析显示,宜毒株与同一酶切类型的Ark-1529-29株同源性最高,核苷酸同源性为93%,氨基酸同源性为91.6%.推测宜株可能是Ark血清型毒株的变异株.宜株与Ark株在血清学分型与基因分型上的一致性,表明这两种分型方法之间有一定的内在联系. 相似文献
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