基于SSR标记的肇庆地区柑橘品种分类地位研究

评价广东省肇庆地区地方柑橘品种与其它部分柑橘属和近缘属植物的亲缘关系,为其分类和育种提供理论依据。从34对柑橘SSR引物中筛选到13对多态性较好的SSR引物,对8份肇庆地方柑橘品种和22份柑橘属、枳属、酒饼簕属植物材料进行PCR扩增,并采用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,用遗传相似性和聚类分析等方法分析检测结果。13对引物共扩增出83条谱带,多态检出率为100%,通过聚类分析能够有效的区分柑橘属、枳属和酒饼簕属,以及柑橘属内的种、品种甚至品系。结果表明SSR分子标记技术能够用于肇庆柑橘种质资源分类地位研究,并且供试的肇庆地方柑橘品种亲缘关系较近。     

万寿菊粉碎物对柑橘根线虫的防治效果研究

本研究将万寿菊茎叶和根的粉碎物施加于红橘、枳壳、枳橙、酸橘和红柠檬等不同柑橘砧木的根际土壤上，探讨粉碎物对柑橘根线虫的毒杀效果及对不同柑橘砧木品种的根系活力和土壤酶活力的影响。结果表明：施加万寿菊粉碎物可降低土壤中柑橘根线虫的数量，增强各柑橘砧木品种的根系活力；根脯氨酸、丙二醛和可溶性糖含量的变化在不同柑橘砧木品种上的表现不同；土壤过氧化物酶活性表现为上升趋势，土壤蔗糖酶表现为先升后降趋势；柑橘根系活力与土壤蔗糖酶活力的相关性高于与土壤过氧化物酶的相关性；万寿菊茎叶和根的粉碎物还田可毒杀柑橘根线虫，同时可作为绿肥改善土壤，促进柑橘根系生长。     

柑橘几丁质酶基因家族的结构、分类与进化分析

【目的】植物的几丁质酶与其抗病能力、防御反应和生长发育密切相关，本文通过生物信息学方法来研究柑橘几丁质酶基因家族成员的性质。【方法】通过检索柑橘全基因组序列，发现了32个几丁质酶基因，使用生物信息学软件对这些基因进行分子量、等电点、信号肽、细胞定位、转录谱、保守结构域、系统发育树等方面进行研究。【结果】该家族基因中有26个成员定位在染色体上，其余6个位置尚未确定。这些几丁质酶基因家族成员的蛋白分子量、氨基酸残基和等电点分别位于14.8～72.7KDa、134～636个和4.53～9.21之间。。除3个预测蛋白不含信号肽外，其余均含有信号肽，其中23个蛋白定位在细胞外，6个蛋白横跨细胞膜。对这些基因在花、叶、果实和愈伤等组织的转录组测序数据进行分析，发现它们的转录水平相差巨大，有的在几种组织中转录水平都很高，有的在不同组织中转录水平相差很大，有的在所有组织中表达量都很低。用最大似然法对蛋白序列构建系统发育树，结合保守结构域的分析结果，可将这些几丁质酶基因分为4类。第1类有信号肽且定位在细胞外，有GH18几丁质酶结构域，同时具有糖基水解酶的功能；第2类大部分是带信号肽的跨膜蛋白，也有GH18几丁质酶结构域，还有一个丝氨酸/苏氨酸激酶的结构域；第3类带信号肽且定位在细胞外，有GH19几丁质酶结构域，同时具有溶菌酶的活性；第4类仅有一个基因，是个无信号肽的跨膜蛋白，有GH18几丁质酶结构域，同时具有糖基水解酶的功能，除此之外还含有抗病蛋白中常见的PPR重复结构域。【结论】对柑橘几丁质酶家族进行分析，有助于了解几丁质酶抗病的分子机制，找出起主效抗病作用的几丁质酶基因，从而为提高柑橘的抗病育种提供帮助。