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本试验旨在研究中国美利奴羊内皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,eNOS)基因第7、13、14外显子上的单核苷酸多态性(SNPs)和单氨基酸多态性(SAPs)。利用生物信息学方法对人、小鼠和中国美利奴羊eNOS基因上的第7、13、14外显子进行了相似性比较,并对GenBank SNP数据库上已公布的人和小鼠eNOS基因外显子多态性进行了统计分析,然后采用PCR-SSCP方法对120只中国美利奴羊eNOS基因的这3个外显子的扩增片段进行分析,通过分析发现在120只中国美利奴羊这3个外显子上并没有SNPs位点,说明中国美利奴羊eNOS基因上的这3个外显子区域相对保守。 相似文献
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3种甜樱桃病毒PNRSV、PDV及LChV-2的多重RT-PCR检测方法的建立与应用 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】建立可同时检测李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)、李矮缩病毒(Prune dwarf virus,PDV)、樱桃小果病毒2(Little cherry virus-2,LChV-2)的多重RT-PCR检测方法。【方法】以复合感染3种病毒的甜樱桃病株叶片为材料,采用CTAB法提取样本总RNA,选用随机六聚体引物对植物样本总RNA进行反转录,所得cDNA作为多重RT-PCR的扩增模板。根据GenBank中PNRSV、PDV、LChV-2基因组序列共设计6对特异引物,分别通过单一RT-PCR和多重RT-PCR筛选出可用于同时检测3种甜樱桃病毒的引物组合。对多重RT-PCR的退火温度及循环数进行优化,以筛选出各引物组合的最适扩增条件。分别以单一感染PNRSV、PDV、LChV-2、复合感染3种病毒、单一感染樱桃病毒A(Cherry virus A,CVA)及甜樱桃无毒苗为样本,对多重RT-PCR引物的特异性进行分析。选取复合感染3种病毒的甜樱桃总RNA的反转录产物为初始模板,按照梯度稀释法依次将模板稀释为2、22、23、24、25倍,在相同PCR反应体系及反应条件下分别对各引物组合的灵敏度进行分析。多重RT-PCR的扩增条带经凝胶回收试剂盒回收纯化后连接至pMD18-T vector,克隆测序,以验证多重RT-PCR检测的准确性。并应用该方法对山东泰安地区甜樱桃生产园中间隔栽培的中国樱桃进行检测。【结果】筛选到2个可以应用的引物组合,组合1“PNRSV-S1/A1、PDV-S2/A2、LChV2-S1/A1”可分别特异性地扩增733、467、337 bp的片段。组合2“PNRSV-S1/A1、PDV-S3/A3、LChV2-S1/A1”可分别扩增得到733、265、337 bp的片段。扩增产物大小与预期相符。多重RT-PCR反应条件优化结果显示,在退火温度52℃、35个循环条件下,2个引物组合的检测效果均较为理想。特异性分析结果显示,2个引物组合均能特异性检测其各自的靶病毒。灵敏度分析结果显示,2个引物组合在cDNA的23×稀释液中仍能特异性扩增,但扩增条带的强度稍有差异,其对植物总RNA的反转录产物的最低检测浓度为107.9 ng•μL-1。克隆测序及序列分析表明,2个引物组合对各自靶病毒的检测结果可靠。应用该方法对9个中国樱桃样本进行检测,结果显示,测试样品均至少感染了2种病毒,其中5个样品复合感染了3种病毒,2个样品同时感染PDV和LChV-2,2个样品同时感染PNRSV和LChV-2。【结论】应用建立的多重RT-PCR检测方法可稳定、准确、灵敏的同时检测单一或复合侵染的3种甜樱桃病毒。 相似文献
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为了探讨SYBR Green Ⅰ实时定量RT-PCR技术在甜樱桃病毒粒子定量分析中的应用前景,以复合感染李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)、李矮缩病毒(Prune dwarf vi-rus,PDV)、樱桃病毒A(Cherry virus A,CVA)、樱桃小果病毒-2(Little cherry virus-2,LChV-2)的甜樱桃"红灯"Prunus avium cv.Red Lamp植株为研究对象,采用相对定量方法,分析各病毒的外壳蛋白基因的表达,用以指示病毒的增殖量。在花、幼叶、功能叶、衰老叶中均能检测到4个基因,但各基因表达量在各器官中存在差异。PNRSV-CP与CVA-CP表达模式相似,功能叶中明显高于其它器官,衰老叶中急剧降低。PDV-CP与LChV2-CP表达模式类似,幼叶中的表达量较高,功能叶片中较低。PNRSV-CP在花、功能叶中的表达显著高于其它3个病毒基因。LChV2-CP在各器官中的表达量均低于其余3个基因。该方法适用于植物组织内多种甜樱桃病毒增殖量的分析。 相似文献
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以毛竹笋为原料,采用水提取、乙醇热回流提取和超声波提取3种提取方法,通过单因素和正交设计试验确定了毛竹笋总黄酮提取的最佳条件。结果表明,水提取工艺最佳条件为固液比1∶30(g∶mL,下同),温度60℃,提取时间1.5 h,pH9;总黄酮得率为0.706%,影响得率的因素为固液比>提取温度>提取时间>溶液pH值。乙醇热回流提取最佳条件为固液比1∶40,温度60℃,乙醇体积分数70%,提取时间2.0 h,总黄酮得率为1.063%;影响得率的因素为固液比>提取温度>提取时间>乙醇体积分数。超声波提取工艺最佳条件为提取时间30 min,固液比1∶40,乙醇体积分数70%,提取温度50℃;总黄酮得率为0.797%;影响得率的因素为固液比>提取温度>提取时间>乙醇体积分数。 相似文献
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小麦籽粒形态及千粒重性状的QTL初步定位 总被引:2,自引:1,他引:1
为研究小麦籽粒形态及千粒重性状的QTL,以普通小麦6044和01-35为杂交组合构建的F8重组自交系(RIL)群体作为试验材料,在山东泰安(山东农业大学试验站)和莱阳(青岛农业大学试验站)两个环境下进行两年田间试验,利用Mapmaker/version 3.0和WinQTLCart软件通过复合区间作图法进行QTL初步定位,在两年两个环境下共检测到12个相关QTL位点,其中关于粒长的2个QTL分别位于2A和2B染色体上,可解释表型变异的25%和12%;4个粒厚QTL位于2A和6A染色体上,可解释表型变异的7%~10%;6个千粒重相关QTL位于染色体2A、4A和6A连锁群上,可解释表型变异的6%~25%;而粒宽QTL在两个地点上都没有检测到。其中相关性高的性状间有一些共同的QTL,表现出一因多效或紧密连锁效应。 相似文献
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不同产区无核白葡萄果实外观品质差异及相关性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]明确不同产区间无核白葡萄果实外观品质差异及品质指标间的相关性.[方法]对新疆吐鲁番、托克逊、鄯善和哈密4个产区147份无核白葡萄果穗重、果实大小(果粒重、皮重、皮果比)、果实形状(果实纵径、横径、果形指数)和果实色度指标(亮度值L、红绿值a、黄蓝值b、色泽比a/b、彩度C、色调角h°)进行测定和分析.[结果]不同产区无核白葡萄穗重、果粒大小、形状及果实色度指标均存在一定差异,同一产区不同样品间穗重、果实大小、形状及果实色度指标也存在一定差异.穗重以鄯善产区最大,为412.71 g,显著高于其他3个产区,吐鲁番、托克逊和哈密产区间并无显著差异;哈密产区的果粒重(2.78 g)、皮重(0.26 g)、皮果比(0.09)、纵径(20.24 mm)、横径(14.26 mm)和果形指数(1.42)均高于其他3个产区,吐鲁番产区的果粒重、纵径、横径和果形指数与哈密产区无显著差异;哈密的L值(37.06)、b值(16.73)、C值,吐鲁番的a值(-2.54)和鄯善产区的b值(16.30)、C值,均显著高于其他3个产区,且哈密与鄯善产区的b值和C值差异不显著,色泽比以吐鲁番和托克逊产区最大,都显著高于鄯善和哈密产区,4个产区葡萄果实的色调角h°差异不显著;哈密产区不同样品穗重一致性较差,吐鲁番产区不同样品间果实形状一致性较好;穗重与果粒重、皮重、纵径和横径呈显著或极显著的正相关,与皮果比和色泽比a/b呈极显著或显著的负相关;果粒重与皮重、纵径、横径和果形指数呈显著或极显著的正相关,与皮果比呈极显著的负相关;皮重与皮果比、纵径、横径和果形指数呈极显著的正相关,皮果比与果形指数和亮度L呈显著或极显著的正相关,与纵径和横径呈显著或极显著的负相关;纵径与横径和果形指数呈极显著的正相关;h.与a/b呈极显著的负相关.[结论]吐鲁番、托克逊、鄯善和哈密产区间和同一产区不同样品间果实外观品质都存在一定的差异,并且各指标间也存在一定的相关性. 相似文献