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为了揭示猪生长性状分子辅助选择标记在不同群体中的遗传效应,本研究采用PCR-RFLP技术,在杜洛克猪、大白猪、长白猪和豫南黑猪群体中对生长性状相关候选基因MC4R的遗传多样性进行检测,并分析其与猪平均日增重、平均日采食量和料重比的相关性。本研究结果显示:MC4R的D298N变异位点在4个猪群中均存在多态性,其中G等位基因为优势等位基因;性状关联分析结果显示,在杜洛克猪群体中,GG基因型个体的平均日增重显著高于AA基因型(P0.05)、料重比显著低于AA基因型(P0.05);在长白猪群体和大白猪群体中GG基因型个体的平均日增重具有高于AA、AG基因型的趋势,料重比有低于AA、AG基因型,但均未达到显著水平(P0.05)。 相似文献
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利用引物设计软件Primer 5.0显示评判引物质量重要信息,通过对扩增鸡脂蛋白脂酶基因第1、第3和第4外显子引物的PCR-SSCP凝胶电泳结果对比,分析这3对引物的重要参数如GC含量以及二级结构等对扩增效果的影响。电泳结果显示,第3对引物扩增相对容易,效果也最好,第4对居中,第1对最差,与引物设计软件给出的信息指标吻合。 相似文献
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【目的】探究确山黑猪HOXA5基因的组织表达情况和HOXA5蛋白的结构功能。【方法】利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)技术检测HOXA5基因在确山黑猪各组织中的表达情况，并与大白猪皮下脂肪和背最长肌进行对比；以确山黑猪皮下脂肪组织为cDNA模板，克隆确山黑猪HOXA5基因编码(coding sequence, CDS)区序列，利用生物信息学软件分析确山黑猪HOXA5基因CDS区序列及其编码蛋白质的结构和功能。【结果】HOXA5基因在确山黑猪肺脏中表达量最高，其次是肝脏和皮下脂肪，且显著高于其他组织。同时，HOXA5基因在确山黑猪皮下脂肪组织中表达量显著高于大白猪。通过对确山黑猪HOXA5基因进行克隆及生物信息学分析，获得的确山黑猪HOXA5基因CDS区全长813 bp,编码270个氨基酸，与牛、绵羊、马、黑猩猩、小鼠、人和鸡的同源性分别为99.1%、99.0%、98.8%、97.8%、97.4%、95.6%和81.3%。确山黑猪HOXA5蛋白分子质量为29.28 kD,主要位于细胞核内，属于酸性、亲水性蛋白，且不具有跨膜结构和... 相似文献
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为了探讨采精频率对杜洛克、大白、长白种公猪精液品质的影响，并确定不同品种种公猪的最佳采精频率，试验选取12月龄体重相近的健康杜洛克、大白、长白种公猪各6头，分5个不同采精频率阶段采精，即第1阶段(A组)为1次/1 d,第2阶段(B组)为1次/2 d,第3阶段(C组)为1次/3 d,第4阶段(D组)为1次/4 d,第5阶段(E组)为1次/5 d,每个阶段采精3次，一个阶段采精完成后，公猪休息一周，然后开始下一个阶段采精，采精完成后对每份精液的精液量及精子密度、活率和畸形率指标进行统计分析。结果表明：三个品种种公猪精液量及精子密度和活率随采精频率的降低均总体呈升高趋势，精子畸形率随着采精频率的降低呈现下降趋势；杜洛克种公猪C组的精液量、精子密度、精子活率较佳，E组精子畸形率最低，但与B、C、D三组精子畸形率差异不显著(P>0.05);大白种公猪B组精液量较佳，D组精子密度较佳，C组精子活率较佳，E组精子畸形率最低，与D组精子畸形率差异不显著(P>0.05);长白种公猪C组精液量较佳，D组精子密度较佳，C组精子活率较佳，E组精子畸形率最低，与D组精子畸形率差异不显著(P>0... 相似文献
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生长性状是猪重要的经济性状，但该性状属于数量性状，受多基因调控。为筛选影响猪生长性状的候选基因，本实验利用猪中芯一号50K SNP芯片对296头猪进行基因分型，对背膘厚（BF）、眼肌深度（LMD）和眼肌面积（LMA）3个性状进行单步全基因组关联分析（ssGWAS）。本实验确定了26、29、43个相关的5-SNP窗口，分别解释了BF、LMD和LMA 1%及以上的总遗传方差。AIREMLF90软件计算BF、LD和LEA性状的遗传力分别为0.48、0.45和0.56。利用Ensembl数据库Sus Scrofa 11.1版本信息，根据起始位置和终止位置寻找显著位点附近的所有基因，共发现35个与生长性状相关的候选基因。GO和KEGG富集分析显示这些候选基因主要参与代谢途径（Metabolic Pathways）、胚胎骨骼系统发育（Embryonic Skeletal System Development）和脂肪酸降解（Fatty AcidDegradation）等通路。NR5A2、CRH、NEK11、ECHS1和TAPT1等基因可能参与生长性状的调控，本实验结果可为今后的猪分子标记育种提供参考... 相似文献