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马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)东北分离物的核苷酸序列分析 总被引:3,自引:0,他引:3
自Gross等(1987)将马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid.,PSTVd)核苷酸序列公布以来,已有20种类病毒全序列被测定出来。类病毒大小一般在240~380核苷酸之间,长度相对稳定,同种类病毒在同一寄主上变化一般不超过10个核苷酸。一种类病毒在不同寄主上可导致出现较多突变,但一般均在15%突变范围之内。PSTVd根据在番茄上的表现症状可分为强系、弱系和中间株系。 相似文献
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为明确分离自黑龙江省克山县马铃薯上的2个病毒分离物KS4和KS7的分类地位,通过RTPCR扩增、克隆获得其基因组序列,利用重组分析程序包和最大似然法分别进行重组分析和系统发育分析。结果显示,分离物KS4和KS7的开放阅读框均有9 186个核苷酸,编码3 061个氨基酸,分离物KS4的核苷酸和氨基酸序列均与马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)分离物Mb112一致率最高,分别为96.9%和98.4%;分离物KS7的核苷酸序列与PVY分离物12-94一致率最高,为97.4%,其氨基酸序列与PVY分离物SYR-Ⅱ-Be1一致率最高,为97.8%。重组分析表明,分离物KS4和KS7均为分离物N-605和Oz的重组体,其中KS4基因组5′-端的2 392个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz;KS7基因组的第800~2 227个核苷酸和第5 637~8 950个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz。系统发育分析发现,分离物KS4被聚类到N:O株系(PVY~(N:O)),分离物KS7被聚类到NTN株系(PVY~(NTN))b型。 相似文献
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1 前 言马铃薯纺锤块茎类病毒 (PotatoSpindleTuberViroid ,简称PSTVd)是引起马铃薯纺锤块茎病的原因 ,该病害发现于 192 2年 ,但直到 196 7年及以后的研究中才发现该病由一种叫类病毒的病原引起的。分布十分广泛 ,是危害我国北方马铃薯生产的重要病害之一 ,严重影响马铃薯的质量和产量 ,一般弱系可造成减产 2 0 %~ 35 % ,强系可达 6 0 %。对其检测有指标植物方法 (利用指示植物鲁格斯番茄Rutgers ,新莨蓿等 ) ,在我国 ,目前较常用的检测方法为聚丙烯酰胺凝胶电泳法 ,而随着分子生物学的发展 ,杂交… 相似文献
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马铃薯种薯中存在环腐病菌潜伏侵染,这种潜伏侵染逐代累积、逐渐表现症状,这是马铃薯环腐病无法根除的根本原因。本研究应用国外成功报道的根据存在于pCS1质粒和环腐菌染色体中一个1.3 kb的插入因子IS1121、高度重复的DNA片段设计的环腐病菌亚种特异性引物序列合成出引物对CMSIF1-CMSIR1和引物对CMSIF2-CMSIR2。以环腐标准菌株、黑龙江省环腐菌株以及马铃薯上其它主要的细菌病原菌(青枯病、软腐病、黑胫病)为试验材料进行直接PCR和嵌套式PCR扩增,结果只有环腐标准菌株和黑龙江省环腐菌株出现特异性片段(直接PCR扩增出1046 bp的片段,嵌套式PCR扩增出864 bp的片段)。将环腐菌纯菌种菌悬液稀释成浓度梯度并与马铃薯组织液混合进行直接PCR和嵌套式PCR检测灵敏度比较,结果表明嵌套式PCR检测灵敏度比直接PCR检测灵敏度提高了100 ̄1000倍。以明显感病症状的块茎、无明显感病症状的块茎和健康块茎为试验材料进行直接PCR和嵌套式PCR,结果除明显感病症状块茎外,所有无明显感病症状的块茎也均被检测出带有环腐病菌。 相似文献
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应用DAS-ELISA法同时检测多种马铃薯病毒 总被引:14,自引:3,他引:11
报道了使用多价血清同时检测多种马铃薯病毒的快速DAS ELISA法。实验分别用快速DAS ELISA法和常规DAS ELISA法检测PVX、PVY、PVS、PVM、PLRV5种主要马铃薯病毒进行比较 ,二者阳性率和灵敏度基本相同 ,但快速法比常规法操作简便、节省时间、节省材料 ,且快速法重复性好 ,结果可靠 ,表明快速DAS ELISA法是一种直观、实用、快速、准确可靠的检测方法 ,适合种薯生产中大量样品的多种主要马铃薯病毒的快速检测。 相似文献