3种中华绒螯蟹群体线粒体COⅡ基因序列测定与进化分析

对我国长江与移居到英国泰晤士河、美国旧金山湾的3个中华绒螯蟹群体的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅱ(COII)的全序列进行了测定.在693 bp的序列长度中,长江群体、泰晤士河群体和旧金山湾群体分别有20、8、7个变异位点;它们的单倍型多样性指数分别为0.8433、0.8158、0.7821;核苷酸多样性指数分别为0.0048、0.0031、0.0039.AMOVA分析表明:长江群体与泰晤士河群体和旧金山湾群体已出了显著的遗传分化,而泰晤士河群体和旧金山湾群体间却未出显著的遗传分化.邻接法(NJ)构建的系统关系树和最小拓展网络分析显示,旧金山湾群体与泰晤士河群体存在一定程度的基因流,旧金山湾的中华绒螯蟹群体除直接来自中国长江外,也可能有一部分来自先移居于欧洲的群体.     

基于共词分析的国内科技查新论文主题研究

通过检索近5年国内科技查新相关论文,利用Bicomb软件提取高频关键词、构建高频关键词共词矩阵和相异矩阵,并利用SPSS和UCINET软件进行网络分析、聚类分析以及战略坐标图等可视化分析.结果表明,近年来关于科技查新的研究主题可以划分为科技查新组成要素、科技查新对科技创新的作用、查新点及其新颖性、文献检索及数据库、查新质量的影响因素、质量控制及评价、查新管理系统、医药卫生查新、存在问题及对策9个类别,并逐一进行论述.通过论述研究主题的内涵、特征等,以期为促进科技查新工作的发展提供决策参考.     

健糎T5K]责任编辑:刘迎春基于文献计量学及网络分析的能值研究综述

为揭示研究主题的发展及研究网络的演化,运用文献计量学以及网络分析方法对1995-2015年Web of Science核心数据库中能值理论的相关文献进行可视化统计分析。结果表明：1）从整体发展上看,研究领域主要集中在生态环境等相关学科。研究主要贡献国家为中国、美国和意大利。2）从研究热点看,早期的研究主要集中在对能值理论的自身完善和发展。近几年随着能值理论被广泛接受,能值理论得到进一步的完善和应用。通过以上研究,我们系统的识别了能值理论的发展趋势,揭示了该领域研究前沿、热点问题,对未来能值理论的进一步应用发展提供了参考。     

基于SNA的陕西省农村电子商务扶贫影响因素分析

[目的]研究分析农村电子商务扶贫的影响因素,并识别其关键因素,为提升农村电商扶贫效率提供理论参考.[方法]采用社会网络分析法(Social network analysis,SNA),以电商扶贫影响因素作为网络节点、各因素之间的关联关系作为网络节点连线,基于陕西农村电商扶贫调查问卷获取相关数据,构建农村电商扶贫影响因素关联网络,使用Ucinet 6.0进行网络中心性分析.[结果]通过分析各影响指标的点度中心性、介数中心性及接近中心性,最终识别出影响电商扶贫的4个关键因素,即农业产业化水平、信息化基础建设、政府主导针对农民的电商培训及农户参与意愿,通过控制和影响其他因素作用于农村电商精准扶贫.[建议]为促进陕西电商扶贫发展,应通过创新农业生产方式、推进乡村信息服务站建设、建立电商扶贫工作站、深化电商人才培养、加大电商扶贫宣传力度等方式提高陕西电商扶贫成效.     

应用社会网络分析技术探索湖南省生猪调运特征

为了解湖南省内生猪调运特点,利用社会网络分析技术构建湖南省市级生猪调运网络,计算网络特征指标,分析月份变化。结果显示:2017年湖南省14个市/州间共调运生猪510 973批次,数量17 815 040头;西部经济落后地区的网络度数中心度和中介中心度低于环洞庭湖地区和湘南地区;邵阳市生猪调运批次和数量最大,而长沙市接收其他城市调入的生猪最多;在去掉度数中心度前50%的7个地区后,生猪调运批次下降76.28%,调运数量下降87.42%;月份分析显示,从第一季度到第四季度,湖南省生猪调运批次和数量存在上升趋势。结果表明:社会网络分析技术可构建完整的生猪调运网络,获得生猪调运的关键地区,有助于局域精准施策;湖南省应重点加强邵阳市和长沙市生猪调运的防疫检疫以及第四季度的监督管理工作。     

利用WGCNA鉴定棉花抗黄萎病相关基因共表达网络

加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)作为一种典型的系统生物学方法,可用来鉴定协同表达的基因模块,探索模块与目标性状之间的生物学相关性,并挖掘网络中的核心基因。黄萎病(Verticillium wilt)可严重降低棉花(Gossypium spp.)的产量及品质,因此研究抗病基因及抗病机制,对于棉花抗病育种工作具有重要意义。本研究以黄萎病菌侵染不同时间点的海岛棉(Gossypium barbadense)幼苗根尖转录组数据为基础,分析其差异表达基因,并选取在不同样本之间表达水平变异最大的前50%基因(共35,647个)进行WGCNA。结果表明,在黄萎病菌侵染条件下,共有22,850个基因差异表达,其中4685个为所有侵染时间点共有的差异基因。共鉴定到18个基因共表达模块,其中5个为抗黄萎病相关特异性模块(black、mediumpurple3、darkolivegreen、plum3模块分别与侵染2 h、6 h、48 h、72 h时间点正相关;mediumpurple2与侵染2 h时间点负相关)。GO和KEGG富集分析表明,特异性模块可以富集到有生物学意义的富集结果,如刺激响应、钙离子结合、黄酮类化合物合成代谢等抗逆相关通路。通过计算模块内基因的连通性,挖掘出了网络中的核心基因,功能预测表明,这些基因可能在逆境胁迫响应中发挥重要作用。本研究为进一步理解棉花抗黄萎病的分子机制、选育棉花抗病新品种提供了理论指导。     

HSP在热应激条件下调控鸡心肌细胞损伤的功能分析

心肌对热敏感,心脏成为热应激损伤的重要器官之一,严重时会引发猝死。热休克蛋白(HPS)是机体在遭受热应激刺激时激活的重要内源性保护机制。为了观察热应激条件下对蛋鸡心肌组织的病理性损伤,以及心肌细胞启动热休克蛋白的变化规律,选用40只300日龄海兰褐蛋鸡构建热应激试验动物模型,通过对血清中肌酸激酶(CK)、肌酸激酶同工酶MB(CK-MB)、乳酸脱氢酶(LDH)和谷草转氨酶(AST)水平的检测以及病理学检测以确定热应激损伤;通过对心肌组织的Hsps的转录水平检测以确定对Hsps的激活;通过系统网络分析,筛选出调控家禽热应激细胞凋亡的相关靶标,并进行相互作用网络和蛋白共表达分析。研究表明,38℃热应激会引起蛋鸡心肌细胞颗粒变性、空泡变性和坏死,导致心肌损伤相关酶谱CK、CK-MB、LDH和AST的上调,还可以激活Cryab、Hsp60、Hsp70和Hsp90转录水平的升高。系统网络分析发现热休克蛋白家族成员CRYAA、HSP90AB1、HSP90B1、HSPA5、HSPD1、DNAJA1和DNAJC3均参与热应激条件下调控家禽细胞凋亡的进程,Hsp90AB1和Hsp90B1可以调控CDK1,Hsp90AB1和HspD1可以与CDK1共表达,Hsp90B1、DNAJC3和IGF1可以调控IL6,影响细胞周期,从而影响细胞凋亡。     

关于“雾霾”研究的作者网络分析

由于空气质量恶化,近年来雾霾现象出现增多且危害加重,雾霾现象已经逐渐成为社会各领域关注的焦点.现以中国期刊网收录的关于雾霾研究方面的期刊论文为数据对象,对其主题和作者共著进行分析,基于作者共著和关键词共现关系构建作者网络,绘制了雾霾研究的主题合作关系著者地图与著者合作关系地图,采用社会网络分析法分析出了国内气象领域“雾霾”相关领域的重要研究者和高活跃度合作研究者.     

社会网络分析方法及其在农业信息传播中的应用

农业信息传播是建设社会主义新农村的重要途径。笔者基于社会网络分析视角,分析农业信息传播的方式、社会关系对农业信息传播的影响,指出了农业信息传播的发展策略。