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11.
PDF2和ODF1转录组测序筛选牛卵泡发育相关基因   总被引:1,自引:0,他引:1  
旨在筛选牛卵泡发育相关基因及其表达模式。本研究选取9头青年母牛,同期发情处理后,采集卵泡波中出现偏差前的小卵泡PDF2(The small follicle at onset of predeviation)和出现偏差后的最大卵泡ODF1(The largest follicle at onset of deviation),分离颗粒细胞(Granulesa cells,GCs),提取总RNA,并进行转录组测序;经牛RefSeq数据库搜索和差异表达基因筛选,进行GO(Gene ontology)分析;随机选择5个基因(MAPK13、CYP19A1、GREB1、SERPINE2、GSTA5)进行qRT-PCR表达量验证分析。结果表明:PDF2和ODF1转录组中共获得RPKM(The reads per kilobase per million reads)值≥0.5的表达基因15 413个,其中表达差异倍数(Fold change)≥2的差异表达基因共651个;对651个差异表达基因进行GO分析表明,参与生物过程(Biological process,BP)的基因占41.66%,分子功能(Molecular function,MF)占17.24%,细胞组分(Cellular component,CC)占41.10%;GO分析结合Genecards基因功能查询,共筛选出13个下调基因和17个上调基因与牛卵泡发育直接相关;CYP19A1、GREB1、SERPINE2在优势卵泡(Donminant follicles,DF)的表达量极显著高于从属卵泡(Subordinate follicle,SF)(P0.01),MAPK13在SF表达量极显著高于DF(P0.01),GSTA5在SF表达量显著高于DF(P0.05)。5个基因差异表达趋势与转录组测序结果完全相符,也进一步证明了转录组测序结果的可信度,为深入探讨基因调控牛卵泡发育奠定了基础。  相似文献   
12.
通过研究不同施肥处理对采煤塌陷区土壤养分和酶活性的影响,结果表明:采煤塌陷区复垦1年后,不同施肥处理对土壤中的养分含量影响大小顺序:无机肥+有机肥+菌肥无机肥+有机肥无机肥CK;土壤碱性磷酸酶和脲酶活性从高到低的顺序为:无机肥+有机肥+菌肥无机肥+有机肥无机肥CK;土壤碱性磷酸酶和脲酶活性的季节变化规律为,夏季土壤酶活性最高,而冬季土壤酶活性最低。  相似文献   
13.
通过大田试验,研究了有机-无机复合保水材料对旱地麦田土壤水分及酶活性的影响,以期为有机-无机复合保水材料的研究和应用提供一定的理论依据。结果表明,有机-无机复合保水材料能在短期内明显提高土壤含水量,在0~20 cm土层较对照提高8.46%(p≤0.05),在20~40 cm土层较对照提高6.15%(p≤0.05)。与对照相比,有机-无机复合保水材料能显著提高土壤过氧化氢酶、蔗糖酶、脲酶和碱性磷酸酶的活性,且不同处理0~20 cm土层的土壤酶活性均高于20~40 cm土层。在0~20 cm土层,不同处理土壤含水量与土壤酶活性均呈显著正相关(p≤0.05);在20~40 cm土层,土壤含水量与土壤过氧化氢酶活性呈显著正相关(p≤0.05),而土壤含水量与蔗糖酶、脲酶、碱性磷酸酶活性相关性不显著。  相似文献   
14.
为确定miR-27a与SCF的靶向关系,剪取成年棕色小鼠和灰色小鼠的皮肤组织,q RT-PCR检测miR-27a和SCF的表达量,选用Pic Tar、Target Scan和DIANA-micro T 3个数据库对miR-27a进行靶基因预测,构建miR-27a的真核表达载体和SCF 3'UTR(含种子序列)的双荧光表达载体,并对种子序列进行突变处理,以miR-27a过表达载体或NC载体(空载)组合SCF 3'UTR双荧光报告载体或SCF 3'UTR的突变载体共转染HEK 293 T细胞,48 h后检测双荧光素酶活性。q RT-PCR结果显示,miR-27a在灰色小鼠皮肤中的表达量极显著高于棕色小鼠(P0.01),而SCF在棕色小鼠皮肤中的表达量显著高于灰色小鼠(P0.05);3个数据库的分析结果均显示,SCF是miR-27a的靶基因;双荧光报告试验结果显示,miR-27a能显著抑制双荧光活性,即miR-27a能与SCF 3'UTR的种子序列结合。综上所述,SCF是miR-27a的靶基因。  相似文献   
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