Use of Degenerate Primers in a RT-PCR Assay for the Identification and Analysis of Some Filamentous Viruses, with Special Reference to Clostero- and Vitiviruses of the Grapevine

RT-PCR with degenerate primers was used for the screening of the genome of some members of the Closterovirus, Vitivirus and Trichovirus genera. Two sets of primers, targeted to conserved sequences of the heat shock protein 70 homologue of closteroviruses or to the RNA dependent RNA polymerase genes of tricho- and vitiviruses, amplified the expected fragments from total RNA extracts or double-stranded RNAs of infected plants. Amplified cDNAs were cloned, sequenced and phylogenetically analyzed. Results support the allocation of grapevine viruses A, B, D and heracleum latent virus (HLV) in the genus Vitivirus, whereas, the detection of a HSP70 homologue in grapevine leafroll-associated viruses agrees with their assignment in the genus Closterovirus. The use of degenerate primers for the identification of grapevine viruses belonging to Vitivirus and Closterovirus genera is envisaged.     

四君子汤对仔猪胸腺及脾脏生长激素受体mRNA表达的影响

选用90头新生"杜×长×大"三元杂交仔猪,随机分为3组,每组30头,分别为中药I组(中药添加剂量10 g/kg),中药Ⅱ组(中药添加剂量20 g/kg),对照组(基础日粮组),试验期为31 d.45日龄时每窝随机选取6头仔猪屠宰后,分别采集胸腺和脾脏.采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,定量分析仔猪胸腺及脾脏中生长激素受体(GHR)mRNA的相对丰度.结果显示,与对照组相比较,2种剂量中药组的仔猪胸腺及脾脏中生长激素受体mRNA的含量均不同程度地提高,中药Ⅱ组效果更为显著.     

马蔺cbf转录因子的克隆及序列分析

根据GenBank已发表的拟南芥cbfs转录因子基因序列设计特异性引物, 采用PCR和RT-PCR方法, 从鸢尾科野生花卉马蔺基因组DNA和cDNA中克隆出cbf转录因子基因片段, 将其克隆到pMD18-T-Vector上。经序列测定及分析表明, 两种途径得到的cbf基因序列相同, 基因全长642 bp, 可编码213个氨基酸。同源性分析表明该基因的核苷酸序列和推导的氨基酸序列与其它植物cbf类基因具有同源性, 尤其与拟南芥cbf1和黄瓜cbf1基因有很高的同源性, 氨基酸同源性高达97%。鉴于同cbf1基因高的同源性, 初步确定克隆到马蔺cbf1转录因子基因, 命名为Ilcbf1, 在GenBank中登录号为DQ131497。     

狂犬病毒RT-PCR检测方法的建立

根据狂犬病毒保守序列设计引物,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)建立了一种检测狂犬病毒的方法,以期实现对严重危及人和动物生命安全的狂犬病毒直接检测。     

山东省沙地葡萄茎痘相关病毒的检测

为明确沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)在山东省发生的情况,2006-2007年在葡萄主栽区和葡萄品种资源圃进行了田间调查、样品采集和病原检测。应用GRSPaV外壳蛋白基因表达获得的多克隆抗体,经间接酶联免疫吸附试验(PTA-ELISA)和斑点酶联免疫吸附试验(Dot-ELISA)检测,在2a采集的298个样品中,125个样品为阳性反应,阳性率41.95%。125个阳性样品涉及43个品种,品种被侵染率74.14%。研究对检测的样品用RT-PCR法验证,有3对引物均扩增出了预期片段,分别为解旋酶基因340bp片段、外壳蛋白(CP)基因842bp片段和RNA聚合酶(RdRp)基因499bp片段。     

应用RT-PCR对新城疫病毒分离株毒力的快速鉴定

根据新城疫病毒 (NDV)强、弱毒株在 F蛋白裂解位点氨基酸组成和序列上的差异 ,参照有关文献 ,设计了 3对引物 (A B,A C,A D)。引物 A B能从 L a Sota、B1 、 系和强毒 F4 8E8的含毒尿囊液中扩增出 36 2 bp的核酸片段 ,引物 A C仅能从强毒 F4 8E8的含毒尿囊液中扩增出 2 5 4 bp的片段 ,引物 A D仅能从 L a Sota、B1 、 系的含毒尿囊液中扩增出 2 5 4 bp片段。 3对引物均不能从 IB、IBD、AI的含毒尿囊液和正常鸡胚尿囊液中扩增出特异片段。从发病鸡群中分离的 3株 NDV毒株均被 A C引物扩出 ,它们的鸡胚平均死亡时间 (MDT)分别为 5 1.8、5 3.2、5 2 .6 h,1日龄雏鸡脑内接种指数 (ICPI)为 1.6 5、1.6 3、1.6 0 ,证明是 NDV强毒。利用 RT- PCR对 NDV人工感染鸡最早可于攻毒后第 2天从病鸡气管中检测到 NDV,其次为泄殖腔和脾、肾。利用 RT- PCR对 NDV毒力的鉴定结果与传统生物学试验的测定结果完全吻合 ,但前者可在 2 4 h内直接对组织匀浆进行诊断 ,具有快速、简便和敏感的特点     

羊草乙醛脱氢酶（ALDH）基因片段的克隆及表达分析

[研究目的]克隆羊草的乙醛脱氢酶ALDH基因片段,研究该基因在不同条件下的表达情况。[方法]采用RT-PCR技术克隆羊草的ALDH基因片段,并对其核苷酸和氨基酸序列进行分析,采用RealTimeRT-PCR方法研究该基因的表达。[结果]获得了羊草的ALDH基因片段,长度为675bp,编码225aa。核苷酸序列比较表明,与水稻ALDH1a序列(AB037421)同源性为86%,与玉米RF2C(AF348413)同源性为85%。BLASTp分析,该序列与水稻、玉米、拟南芥的乙醛脱氢酶一致性分别高达87%、86%、60%,含有醛脱氢酶基因家族的保守结构域。RealTimeRT-PCR数据表明,在诱导条件下该基因的表达量呈先升高后降低的趋势。总体上来说,该基因对盐的响应要高于干旱和冷冻。[结论]成功获得了羊草ALDH基因片段,并研究了该基因的表达情况,为进一步克隆羊草ALDH全长基因奠定了基础。