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miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测 总被引:1,自引:0,他引:1
为探究miR-18a-5p在鸡不同生长时期组织表达变化规律及其生物信息学特点,本研究以苏禽3号鸡为试验动物,利用实时荧光定量PCR技术检测不同生长时期鸡miR-18a-5p的组织表达变化。通过文献和miRBase检索脊椎动物的miR-18a-5p序列,利用Ensembl数据库确定miR-18a-5p在基因组中的位置,根据成熟序列构建系统进化树;使用miRmap、microT、miRanda和TargetScan网站预测miR-18a-5p靶基因,并进行GO和KEGG分析。组织表达分析结果显示,miR-18a-5p序列在鸡心脏、脾脏、肾脏和下丘脑中的表达量显著高于除大脑以外的其他组织(P<0.05)。与3日龄雏鸡相比,90日龄鸡心脏、脾脏、肾脏、腿肌和下丘脑中miR-18a-5p的表达量均显著上升(P<0.05)。在50种脊椎动物中共发现52条miR-18a-5p序列,几乎所有物种都只有1条成熟序列;基因定位分析发现,鸡miR-18a-5p位于1号染色体上的基因间隔区。多序列比对分析表明,不同物种miR-18a-5p的成熟序列同源性较高,物种间较为保守。系统进化树分析发现,鸡miR-18a-5p与原鸽、斑胸草雀等其他鸟类聚为一类,这表明miR-18a-5p进化过程中是保守的。靶基因预测和功能分析发现,miR-18a-5p共有121个靶基因。GO分析结果显示,靶基因主要富集到蛋白质泛素化、细胞周期阻滞、白细胞介素-6产生的负调控等功能。KEGG 通路分析表明,靶基因主要富集到细胞周期及Wnt和FoxO信号通路等。多个与肌肉生长及细胞增殖等相关的基因富集到相关通路之上。综上,鸡miR-18a-5p是组织广泛表达的miRNA,其可能通过Wnt及FoxO信号通路调控肌肉生长及细胞增殖分化。本研究为miR-18a-5p功能及调控机制的深入研究提供参考依据。 相似文献
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<正>羊是恒温动物,在寒冷环境中羊为维持体温,将大量消耗饲料用于产热。羔羊由于体毛稀疏,皮下脂肪少,体表面积大,保温能力差,体温调节机能不完善,当环境温度低于临界温度时,不仅体重减轻及掉膘,而且低血糖、行动迟缓、腹泻和其他疾病的发生率明显上升。有研究表明冬春季节羔羊舍内温度应保持在5~10℃,才能保证羔羊正常生长。贵州省位于北纬24°30′~29°13′,东经103°31′ 相似文献
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荔波县蜜柚测土配方施肥技术 总被引:1,自引:1,他引:0
《现代农业科技》2016,(11)
荔波县蜜柚产业发展迅速,种植蜜柚已成为荔波县农户增收的主要方式之一,同时滥施肥、乱施肥的现象也日益突出。盲目施肥不仅增加了肥料成本,造成环境污染,而且容易造成肥害,影响蜜柚的产量和品质。针对这一情况,提出蜜柚测土配方施肥技术,以期提高蜜柚产量及品质。 相似文献
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经查阅文献,搜集并整理得到模式标本采自贵州的蕨类植物19科、46属、126种.模式产地涉及除六盘水地区外的贵州各地区,黔南地区51种>安顺地区18种>贵阳地区17种>黔西南地区7种、铜仁地区7种、遵义地区7种>毕节地区4种>黔东南地区1种,产地不祥的14种.种数较多的科依次是鳞毛蕨科40种>金星蕨科16种>蹄盖蕨科15种>水龙骨科10种.种数较多的属是耳蕨属11种,其次是贯众属10种.生长环境具有多样性,生长种数较多的生境依次是林下生长种类94种>石上或石隙生长种类62种>溪沟边生长种类41种>阴湿环境生长种类30种>河谷或峡谷生长种类23种. 相似文献