Detection of Colletotrichum coccodes from soil and potato tubers by conventional and quantitative real-time PCR

Colletotrichum coccodes is the causal agent of the potato blemish disease black dot. Two PCR primer sets were designed to sequences of the ribosomal internal transcribed spacer (ITS1 and ITS2) regions for use in a nested PCR. The genus-specific outer primers (Cc1F1/Cc2R1) were designed to regions common to Colletotrichum spp., and the species-specific nested primers (Cc1NF1/Cc2NR1) were designed to sequences unique to C . coccodes . The primer sets amplified single products of 447 bp (Cc1F1/Cc2R1) and 349 bp (Cc1NF1/Cc2NR1) with DNA extracted from 33 European and North American isolates of C. coccodes. The specificity of primers Cc1NF1/Cc2NR1 was confirmed by the absence of amplified product with DNA of other species representing the six phylogenetic groups of the genus Colletotrichum and 46 other eukaryotic and prokaryotic plant pathogenic species. A rapid procedure for the direct extraction of DNA from soil and potato tubers was used to verify the PCR assay for detecting C. coccodes in environmental samples. The limit of sensitivity of PCR for the specific detection of C. coccodes when inoculum was added to soils was 3·0 spores per g, or the equivalent of 0·06 microsclerotia per g soil, the lowest level of inoculum tested. Colletotrichum coccodes was also detected by PCR in naturally infested soil and from both potato peel and peel extract from infected and apparently healthy tubers. Specific primers and a TaqMan fluorogenic probe were designed to perform quantitative real-time (TaqMan) PCR to obtain the same levels of sensitivity for detection of C. coccodes in soil and tubers during a first-round PCR as with conventional nested PCR and gel electrophoresis. This rapid and quantitative PCR diagnostic assay allows an accurate estimation of tuber and soil contamination by C. coccodes .     

黑河流域荒漠地区梭梭人工林地土壤水分动态研究

梭梭林地土壤剖面的含水量与裸沙地含水量显著不同 ,裸沙地土壤含水量随深度增加而增加 ,林地在 30～ 12 0cm范围内有较高的含水量 ;林地 0～ 30cm的上层土壤含水量受降雨及蒸发的剧烈影响 ,30～ 2 0 0cm范围内的林地土壤各测量层平均含水量与其标准差有二次函数的关系 ;降雨对每月的 0～ 2 0 0cm的土壤贮水量没有明显的影响 ,说明降雨多数在当月就被蒸散和深层渗漏所消耗 ;认为梭梭人工林这种脆弱生态系统能够在严酷的环境条件下存在 ,其根系对土壤水和地下水有吸水和释水的再分配功能是重要的因素之一     

农田沙漠化演变中土壤质量的生物学特性变化

通过研究处于沙漠化过程中的科尔沁沙地旱作农田土壤酶活性与基础土壤呼吸活性，分析了土壤质量生物学特性的沙漠化演变。结果表明，土壤酶活性与基础土壤呼吸对沙漠过程中环境的变化反应敏感，随着沙漠化程度增加，与土壤物理化学肥力因素有关的过氧化氢酶、脲酶和碱性磷酸酶的活性和土壤呼吸活性随之下降。土壤酶活性和呼吸活性与土壤有机质和养分有极显著的相关，在一定程度上可以用酶活性和呼吸强度表征有机质和养分的状况及其数量的变异，因此，可以作为农田沙漠化演变中土壤质量特征变化的重要辅助指标。     

土壤湿度对三氮苯类除草剂药效的影响及优化方案

以稗草为生物测定材料,运用二次正交旋转组合设计,以土壤湿度和除草剂用量二因子为决策变量,对稗草的抑制率为目标函数,研究土壤湿度对三氮苯类除草剂药效的影响。结果表明,适当的土壤水分是三氮苯类除草剂发挥药效的重要因素,药效随土壤湿度的提高而提高。不同的土壤湿度对不同除草剂药效影响各异,高湿条件下,湿度差异对药效影响大小依次为嗪草酮、西草净、扑草净、莠去津,低湿条件下则相反。除草剂用量与土壤湿度存在最佳发挥药效的组合。     

小麦矮化腥黑穗病菌侵染能力的研究

中美专家合作在美国犹他州对小麦矮化腥黑穗病菌的侵染能力进行了研究。试验采用不含抗病基因的小麦品种Cheyanne,播种前用溴甲烷对试验小区进行了熏蒸。接种物为含有多种致病型的冬孢子悬浮液,采用土壤表面喷洒冬孢子悬浮液的方法进行接种,接种密度为每cm20、0.88、8.84、88.45、884.49、8844.89、88449个孢子。结果表明,接种密度为每cm20.88个孢子时即可产生0.21％的穗发病率。对试验数据进行分析后表明,小麦矮化腥黑穗病菌的侵染规律符合侵染概率理论,在本试验条件下,单个孢子的侵染概率为0.0002。     

篱壁式红富士苹果光照分布及结果部位对果实品质的影响

作者对6～7年生篱壁式红富士苹果叶幕光照分布、结果部位对品质的影响进行了研究.结果表明:篱壁形叶幕光照垂直分布和水平分布的日变化相对均衡,树冠内未产生无效光区;品质垂直和水平分布与光照垂直和水平分布呈极显著正相关.中、下层中长果枝果实的果面光洁度分别为92.7%和97.2%,端正果率分别为91.6%和92.5%.     

红肉脐橙果肉中主要色素的定性及色素含量的变化

 运用薄层层析法及二极管阵列检测器与高效液相色谱联用的方法, 确定红肉脐橙果肉中含有番茄红素和β- 胡萝卜素两种主要色素, 它们在液相色谱图中占总峰面积(计溶剂峰) 的73. 57 %～77. 78 % , 番茄红素占55. 36 %～58. 49 % , β- 胡萝卜素占18. 21 %～19. 93 %。利用反相高效液相色谱仪以及番茄红素和β- 胡萝卜素标样制作标准曲线, 测定果实发育及室温贮存过程中色素的变化动态, 结果表明, 该脐橙果肉中的番茄红素在成熟期含量最高, 达109. 67μg·g^-1DM, β- 胡萝卜素此时也达到最高值(15. 52μg·g^-1DM) ; 番茄红素的含量在采收后基本呈下降趋势(但采后30 d 有显著升高) , 说明果肉中存在类胡萝卜素采后合成的现象; 贮存4 个月后, 番茄红素含量急剧降低至最高时的1/ 10。     

日光温室黄瓜栽培CO_2浓度的消长规律初探

近 3a(年 )的研究结果表明 :日光温室内CO2 浓度有明显的季节变化和日变化。在整个生长期内因通风时间和通风量的不同 ,日光温室内的CO2 浓度 11月和 3月较高 ,5月较低。各时期日变化基本相同 ,但变化幅度因季节而异 ,上午随Pn的逐渐增大而下降 ,中午 12 :0 0～ 14 :0 0时降至最低 ,下午又随Pn的减小而缓慢回升。叶片的光合作用、呼吸作用和土壤呼吸是影响日光温室内CO2 浓度日变化的主要因素。有机肥施用量对室内土壤呼吸和日光温室CO2 浓度有较大影响 ,在有机肥充足的条件下 ,室内CO2 浓度基本满足黄瓜光合作用的需要 ,无须补施 ,如果在作物生长期间再定时随水向土壤中冲施有机肥 ,效果就更好     

红肉脐橙(Citrus sinensis L.)果肉中特征色素提取方法探索

红肉脐橙是目前为止惟一果肉呈粉红色或红色的脐橙,其呈色色素尚未见报道。为深入研究其果肉中特征色素的构成及在果实生长发育和贮存过程中色素含量的变化,本研究在对该色素初步定性的基础上对提取方法进行了探索。在分析红肉脐橙果肉中色素萃取液的紫外可见吸收光谱时发现,该色素有类胡萝卜素的特征吸收峰,将萃取液进行薄层层析则进一步证实其内含有番茄红素。在色素提取的前处理方式上,本研究认为冷冻干燥样品的浸提效果较真空干燥的样品稳定(变异系数小),且浸提率相差无几,所以选择冷冻干燥作为合适的样品前处理方式。色素浸提条件的正交实验结果表明,最佳浸提条件为50℃、1.5h内浸提4次,浸提的料液比为1:60。此外,浸提温度、浸提时间、浸提料液比和浸提次数对浸提率都有显著影响,影响最大的因素是浸提温度,最佳温度为50℃,随温度降低浸提率显著降低。其次是侵提时间的长短,最佳浸提时间为1.5h,延长或缩短0.5h都会使浸提率下降。浸提次数对浸提率的影响是最小的。