基于二代测序数据拷贝数变异检测的新方法研究

目标区域捕获测序（TRS）是将基因组特定区域制成探针与基因组DNA杂交,将目标区域的DNA富集后再进行二代测序。TRS已应用于多种疾病如智力障碍、帕金森症等,能够有效的对人类主要组织相容性复合体（MHC）、外显子等区域进行测序。由于测序效果受捕获测序探针密度影响较大,探针的疏密及均匀程度很大程度会影响最终结果,与全基因组测序相比,TRS检测拷贝数变异（CNV）难度更大。随着生命科学的飞速发展,越来越多的拷贝数变异检测工具出现,但它们的CNV检测率依然较低,假阳性率较高。因此,本研究开发了一种新颖的拷贝数变异检测方法,结果显示,本研究方法、ExomeDepth和XHMM的检测率分别是76.7%、12.4%和5.5%,假阳性率分别是25.7%、49.4%和66.9%,本研究方法在检测率及假阳性率的表现均优于ExomeDepth和XHMM两种方法。本研究补充了拷贝数变异检测算法,并为相关研究提供一定的理论依据。     

ApoB100对肝脏VLDL合成分泌的影响及其在兽医临床中的研究进展

肝脏可从循环中获得脂质,进行合成并将脂质中的脂蛋白分泌至血液中,在全身新陈代谢的动态平衡中起到核心作用。极低密度脂蛋白（VLDL）是肝脏的主要分泌产物,其主要作用是向外周组织运输内源性合成的脂类,如甘油三酯（TG）等。载脂蛋白B100 (ApoB100)作为VLDL颗粒中主要和必需的蛋白质,与大多数肝脏分泌蛋白的合成不同,主要由共降解和翻译后降解进行调节。文章就ApoB100通过降解及自噬作用影响奶牛肝脏VLDL的合成分泌以及ApoB100在兽医临床中的相关研究进行概述,以期为未来的相关研究提供参考。     

灯盏乙素衍生物的合成及抗白血病活性研究

天然产物灯盏乙素具有广泛药理作用,其抗肿瘤功能是近年来的研究热点之一.研究以灯盏乙素为先导化合物,先对其结构中的4′-OH和6-OH进行苄基化,进一步在其糖羧基位点与多种脂肪胺缩合,合成得到一系列灯盏乙素衍生物4 a～d.所有目标化合物和中间体的化学结构均经1H-NMR、13C-NMR和HR-MS等波谱进行确证.并采用...     

酒炙车前子防治奶牛胎衣不下中有效物质分离体系的确定

酒炙车前子防治奶牛胎衣不下是验方,本实验室验证酒炙车前子在防治奶牛胎衣不下方面有着显著的疗效,并确定了有效部位。但其防治奶牛胎衣不下的有效物质基础尚不明确。因此本试验目的是确定一个能够将其有效部位中所包括的化合物按照极性由低到高分离成三部分的体系。通过预实验确定了分离二氯甲烷部位和乙酸乙酯部位的洗脱剂和展开剂体系。使用相同内径的层析柱,其中硅胶的高度设置成3个梯度:15,25,35cm,使用洗脱剂进行梯度洗脱后,利用薄层色谱法进行检测,由色谱图观察化合物是否能成功分离成三部分。二氯甲烷部位和乙酸乙酯部位的结果显示,柱高15cm条件下无法有效地分离化合物,柱高25cm条件下化合物回收比例要高于柱高35cm条件下的化合物回收比例。因此确定了二氯甲烷部位分离化合物的洗脱剂体系:石油醚∶乙酸乙酯为1∶2;石油醚∶乙酸乙酯为1∶30;二氯甲烷∶甲醇为30∶1;展开剂体系:石油醚∶乙酸乙酯为4∶1;柱体高度为25cm。乙酸乙酯部位分离化合物的洗脱剂体系:石油醚∶乙酸乙酯为100∶1;石油醚∶乙酸乙酯30∶1;二氯甲烷∶甲醇为30∶1;展开剂体系:石油醚∶乙酸乙酯为10∶1;柱体高度为25cm。采用干法上样,上样量应适当增加。该分离体系的确定对研究酒炙车前子中防治奶牛胎衣不下的有效物质基础提供了技术支撑,也为研制高效、安全、廉价的防治奶牛胎衣不下的中药制剂奠定了基础。     

富硒酵母对雏鸡十二指肠黏膜抗炎因子的分子调控机制研究

为了探讨富硒(Se)调控雏鸡十二指肠黏膜系统的分子机制,试验采用富硒酵母(SEY)饲料建立富Se雏鸡模型,应用原子荧光吸收法测定雏鸡血液及十二指肠黏膜组织中的Se浓度,应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测雏鸡十二指肠黏膜组织中转化生长因子(TGF-β1)和白细胞介素-10(IL-10)的含量,采用荧光定量PCR法分析了谷胱甘肽过氧化物酶(GPXs)mRNA在雏鸡十二指肠黏膜中的相对表达量。结果表明:在试验第7,21,35天时,与对照组相比,SEY组雏鸡血液及十二指肠黏膜中的Se含量显著或极显著高于对照组(P0.05或P0.01),十二指肠黏膜抗炎细胞因子TGF-β1和IL-10的表达量显著升高(P0.05);SEY组雏鸡十二指肠肠黏膜GPXs(GPX1、GPX2和GPX4)mRNA表达量显著或极显著增加(P0.05或P0.01)。说明SEY能够显著增强十二指肠黏膜抗炎及抗氧化能力,加强机体免疫力。     

模拟超高温法检测原料奶中蛋白质稳定性的研究

采用模拟超高温法检测原料奶中蛋白质的稳定性,以此来评价原料奶的质量。抽取原料奶A类13份、B类30份和C类128份,分别置于模拟超高温试验机上,在138℃的条件下处理6min,出现絮片者为阳性,蛋白质不稳定;无絮片者为阴性,蛋白质稳定。结果显示,A、B和C类原料奶的阳性数量分别为0、6和33。说明A类原料奶与阴性的B、C类原料奶都可以用于生产纯牛奶,阳性的B和C类原料奶可以用于生产酸奶。     

钙离子在内质网应激中的作用

内质网应激(ERS)是一种重要的细胞自我防御机制,内质网应激时,首先启动生存途径,但长时间的内质网应激将使细胞凋亡。钙离子(Ca~(2+))作为细胞内重要的第二信使,在细胞的各种生理及病理活动中发挥着重要作用,Ca~(2+)的稳态是细胞维持正常结构和功能的前提与基础。内质网是细胞中重要的钙库,当细胞受到外源性化合物作用时,内质网内Ca~(2+)代谢失衡,功能紊乱,导致内质网应激的发生。当细胞中Ca~(2+)耗竭,使得膜上Ca~(2+)通道打开,胞内钙池引发Ca~(2+)内流,使钙池再次充满。论文主要就内质网应激、内质网中钙离子的作用及钙池引发钙离子的内流进行概述,并展望了未来的研究方向,以期望为相关的研究提供参考。     

棉酚对Ⅰ型过敏小鼠Eotaxin及CCR3表达水平的影响

通过建立I型过敏反应动物模型,检测棉酚对模型小鼠中嗜酸性粒细胞趋化因子(Eotaxin)以及特异性受体CCR 3 mRNA表达的影响。结果显示,棉酚能使I型过敏小鼠血清中Eotaxin含量、外周血中Eotaxin和CCR3 mRNA表达显著下降。证明棉酚能够通过降低I型过敏小鼠Eotaxin和CCR 3 mRNA的表达,从而干预过敏反应,最终达到治疗过敏的目的。     

蚯蚓粪对柑橘幼苗抗草甘膦胁迫的影响

草甘膦在柑橘园除草中得到大量使用,对农作物生长、果实品质、产量和质量造成影响。如何降低草甘膦对柑橘树的生物可利用性,从而降低其对农作物造成的药害、提高果实品质和食品安全将至关重要。本文在前期研究的基础上通过施用蚯蚓粪,表征蚯蚓粪作用下土壤中残留草甘膦对柑橘幼苗的生物有效性和生物毒性效应。结果显示,蚯蚓粪能够显著增强其生物有效性（BCF值显著增大）;显著降低草甘膦在土壤中的残留量到草甘膦单独处理组的55.15%,从而减少草甘膦在柑橘幼苗植株中的积累。同时,蚯蚓粪的施用能促进植物的茁壮生长,使抗氧化酶活力较对照组显著提高,从而具有更强的抗逆能力。在这两方面的共同作用下,蚯蚓粪显著减轻了土壤中残留草甘膦对柑橘幼苗的胁迫,使其株高、根长和相应的干重较草甘膦单独施用时增长了26.23%-140.11%,甚至成为对照组的1.03倍和1.13倍。此研究对兼顾化肥有机替代的草甘膦污染土壤的修复和高效利用具有重要意义。