沼泽红假单胞菌相似菌株间差异功能模体的筛选和分析

从功能模体水平上,探索沼泽红假单胞菌相似菌株间功能差异的机理.利用循环遍历算法和Python特有的字典数据格式,编写脚本test.py和difference analysis.py,筛选沼泽红假单胞菌CGA009和YSC3差异功能模体.沼泽红假单胞菌CGA009独有14种功能模体,功能主要集中在DNA复制、合成、修复、...     

低浓度阿奇霉素对猪链球菌2型蛋白表达、荚膜多糖与药物敏感性的影响

本研究通过探索低浓度阿奇霉素对猪链球菌2型蛋白表达、荚膜多糖与药物敏感性的影响，为进一步研究环境中低浓度抗生素对微生物的影响奠定基础。用低浓度阿奇霉素处理猪链球菌2型，利用蛋白质组学iTRAQ技术，筛选关键差异表达蛋白。同时测定猪链球菌2型的荚膜多糖含量和药物敏感性。结果显示，共鉴定到差异表达蛋白174个，占总鉴定蛋白的11.6%,多数差异表达蛋白参与催化和代谢过程，属于膜蛋白，其中，3个荚膜多糖蛋白、9个ABC转运蛋白、1个50 S核糖体蛋白、1个核糖体RNA甲基转移酶、1个DNA回旋酶上调表达；8个荚膜多糖蛋白、4个50S核糖体蛋白、4个30S核糖体蛋白、1个核糖体RNA甲基转移酶、1个DNA聚合酶IV下调表达。用低浓度阿奇霉素处理猪链球菌2型，发现其对多种抗生素的敏感性降低，存活下来的菌株，恢复正常培养后，药物敏感性恢复。用低浓度阿奇霉素处理猪链球菌2型，荚膜多糖含量也未发生大幅度变化。猪链球菌2型通过改变自身蛋白质组的表达量，以适应低浓度阿奇霉素的选择压力。与低浓度阿奇霉素共存时，猪链球菌2型开启外排泵系统，会增加细菌产生多重耐药的风险。