林业院校新生信息意识现状调查与分析

信息素养是信息时代背景下社会成员所必备的素质,其内容包括信息意识、信息知识、信息能力、信息道德以及信息安全等方面的内容。通过对西南林业大学2012级部分新生进行信息素养教育中的信息意识开展问卷调查,了解林业院校新生信息意识现状,为高校进一步提升大学生信息素养教育提供重要的理论支撑。     

林业院校新生信息意识现状调查与分析

信息素养是信息时代背景下社会成员所必备的素质,其内容包括信息意识、信息知识、信息能力、信息道德以及信息安全等方面的内容.通过对西南林业大学2012级部分新生进行信息素养教育中的信息意识开展问卷调查,了解林业院校新生信息意识现状,为高校进一步提升大学生信息素养教育提供重要的理论支撑.     

全基因组预测枯草芽孢杆菌XF-1的分泌蛋白

枯草芽孢杆菌XF-1对诸多植物病原菌具有抑制作用,是农业生产上重要的生防菌之一。利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等预测程序对枯草芽孢杆菌中3 853条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测研究,并对所获得的分泌蛋白开展氨基酸分布、信号肽长度、切割位点等性质进行分析。结果表明,该菌含有分泌蛋白为104个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。     

植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体的预测方法对比研究

植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体(GPCR)在实现外界信号感知和传递过程中发挥着重要作用。基于GPCR蛋白所具有的典型7个跨膜保守结构域及非典型保守结构域,通过总结前人已报道的候选GPCR的同源比对方法,对其跨膜结构域数量预测方法及跨膜结构蛋白数据库进行对比,明确TOPCONS是目前预测GPCR跨膜结构域的较好方法。然后,选择NCBI数据库中223个不同真菌的GPCR蛋白序列通过TOPCONS和TMHMM进行对比分析,结果显示,2种软件对GPCR跨膜结构域数量的预测结果不尽相同,TOPCONS预测结果的准确度较高;进一步对上述GPCR蛋白序列的氨基酸数目进行分析,明确具有7个跨膜结构域的GPCR蛋白氨基酸数目为200～1 406个。该研究可为进一步开展植物病原丝状真菌GPCR蛋白的结构预测及其功能研究提供参考。     

黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析

基于全基因组序列已经公布的黄单胞菌Xanthomonas campestris B100、Xanthomonas campestris pv. campestris 8004、Xanthomonas campestris CN14中分泌蛋白序列为基础数据,采用Protscale、SMART、TargetP 2.0 Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、保守结构域以及转运肽等分析,结果显示：黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系, 44.73%的蛋白为不稳定蛋白, 83.21%的蛋白亲水性小于0,属于亲水性蛋白。同时,在每种黄单胞菌的分泌蛋白中,具有明显保守结构域的蛋白数量平均为12个,并且所有分泌蛋白均具有信号肽,转运肽预测可能性分布也较为平均。     

不同营养类型植物病原真菌次生代谢产物合成基因簇的差异性研究

选择全基因组序列已经公布的22种真菌为研究对象,利用antiSMASH数据库对不同营养类型真菌的次生代谢产物合成基因簇进行注释,以期发现不同营养类型植物病原真菌在侵染植物过程中次生代谢产物所发挥的作用及合成基因簇的差异性。结果表明：半活体营养型真菌和死体营养型真菌中次生代谢产物合成基因簇的种类和数量都高于活体营养型真菌;进一步对非核糖体肽合成酶（NRPS）、聚酮合酶（PKS）、萜烯（terpene）三大类次生代谢产物合成基因簇进行分析,发现半活体营养型和死体营养型病原菌中NRPS基因簇、PKS基因簇和萜烯基因簇的数量也都高于活体营养型病原菌。     

高校学生信息素养现状及其评价标准研究进展

信息时代对高校学生的信息素养能力提出了更高要求,然而,目前高校学生信息素养层次不齐,对学生信息素养的评价指标体系尚未形成统一标准,较难实现学生信息素养能力的提高.从信息素养的内涵和外延为切入点,对高校学生信息素养所存在的问题以及国内外众多学者所开展的有关高校学生信息素养的评定标准、评定方法进行综述,以期为进一步提升中国高校学生信息素养提供策略.     

全基因组预测里氏木霉QM6a的碳水化合物活性酶类蛋白

【目的】里氏木霉QM6a是一株产纤维素酶的重要工业菌株,明确该菌中碳水化合物活性酶类蛋白(CAZymes),为进一步开展其功能研究打下坚实的理论基础。【方法】基于前期所获得的356个分泌蛋白数据,利用CAT预测程序对其CAZymes进行分析。【结果】里氏木霉QM6a中含有201个CAZymes,可以分为主要类别、复合类别,主要类涉及93个GHs和52个CBMs以及15个AAs、14个CEs、5个PLs、4个GTs;复合类别则涉及15个GH/CBMs和1个AA/CBMs以及2个CE/CBMs。【结论】通过上述生物信息学分析方法有效地实现了里氏木霉碳水化合物活性酶蛋白的预测。     

褐环乳牛肝菌中分泌蛋白的理化性质分析

为了更好地明确褐环乳牛肝菌分泌蛋白的功能,基于前期所获得327个分泌蛋白序列,对其理化性质进行分析。结果表明,69.72%的分泌蛋白理论等电点小于6.0,属于酸性蛋白,同时,利用随机数生成软件对上述不同理论等电点类别的分泌蛋白进行10%抽样分析,明确33个不同理论等电点类别的分泌蛋白(包括23个酸性蛋白、4个中性蛋白、6个碱性蛋白)的分子质量、分子式、原子数量、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等理化性质,其中14个分泌蛋白为稳定性蛋白,14个分泌蛋白为亲水性蛋白。     

云南省核桃产业发展现状及对策分析

云南省核桃产业对当地经济的发展起着重要作用,在全国核桃生产中也占有重要地位。为了促进云南省核桃产业快速、健康、有序地发展,采用2000～2009年有关全国和云南省核桃产业发展情况的统计数据,从云南省核桃产业的分布区域与产量角度对其发展现状进行了评述,同时比较分析了云南省和其他省份核桃产业的发展情况,指出了云南省核桃产业发展中亟需解决的问题,并提出了相应的对策建议。